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“肝者，将军之官”出自《素问·灵兰秘典论》：“肝者，将军之官，谋虑出焉。胆者，中正之官，决断出焉。”综合各注家见解，其基本可分为两种观点：其一，从将军者骁勇善战、刚果专断取象诠释肝之特性。如王冰注曰“勇而能断，故曰将军”，李中梓曰“肝为震卦，壮勇而急，故为将军之官”。其二，从将军者尚武好动、性急善怒取象解释肝之特性。如张景岳曰：“肝属风木，性动而急，故为将军之官。”张志聪曰：“肝气急而志怒，故为将军之官。”恽铁樵云：“肝主怒，拟其似者，故曰将军。怒则不复有谋虑，是肝之病也。”《新编黄帝内经纲目》曰：“肝属风木，藏血主动，性动恶怒，故喻为将军。肝藏魂，有协助心神之用，故出谋虑。”前者侧重于从肝之生理阐释，而后者则侧重从肝之病理解故。
“肝者，将军之官”是言其生理功能，其后即云“谋虑出焉”，则足以表明将军者为智谋勇略、沉着镇定之义，而非善怒急躁、好动鲁莽之属。
《素问·五常政大论》云“木曰敷和……其性随，其用曲直”。所谓“敷和”即布散、温之义。所谓“随”，柔和也，如张景岳所云“柔和随物也”，与《素问·五运行大论》所载的“在气为柔，在脏为肝”之义同。“曲直”者，能屈能伸，柔韧刚毅。这说明肝有柔和而刚毅不屈之象，而非刚强暴急之晦。肝者谋虑于内，阳刚其外，而能安内以攘外，如将军之职能，内安黎民，外御敌侵。谓谋虑者，运筹于内、阴柔蓄发是也。一者，肝体阴而用阳，体阴者乃能藏血。蓄藏阴血以待升发之机调度布达，奉养周身。阴血充足，以制亢阳，阴平阳和，气血调畅，则五脏安和。二者，在其经脉系统，肝经为厥阴，两阴交尽之界，蓄发生阳之机。所谓阳刚于外者，其一，肝主升发疏泄，调畅气血之能。肝者厥阴，阴尽阳生，阳气生发，为一身气机升降动力之源。气机升降有序，畅而不滞，气血调和，正气疏达布表，御邪于外，固护肌表，百病不生。其二，肝主乎筋，为“罢极之本”，肝气刚毅，筋脉得养，则能耐劳持力，勇而刚果。
肝司将军之职而行调度调节之能。将军者，司其统帅之能，总领调度全军而捍卫国之安定。欲得统领而安定全局，必得先谋虑揣度而后行。其谋虑者，阴柔而蓄发。肝藏血，受纳脾胃生化之血而藏之。《素问·经脉别论》曰：“食气入胃，散精于肝，淫气于筋。”饮食入胃，胃气消磨腐熟，脾为胃行其津液，化而为血，散布于肝，肝有所藏，疏注流筋，筋得所养，柔韧而持力。肝血得藏，肝阴充足，以制亢阳，使肝之阴阳平和。肝主疏泄，所藏之血必经其疏泄之能而调度调节血量布散周身，以濡养脏腑百骸诸窍。
综上所述，“肝为将军之官”实为肝之生理功能的高度概括。肝象将军，志和气达，柔于内，刚其外；体阴而用阳，曲柔而刚直，藏血而调度气血，荣养脏腑百骸；升发少阳之气以化生君火；主升发疏泄而助卫固表，总揽一身气机升降而出乎谋虑。故肝气不调，百病生焉。