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网络环境下，图书馆的发展也面临着许多问题，图书馆的服务工作受到了严重的挑战，特别是图书馆的服务工作已经远远不能满足读者的需求。这些问题影响了图书馆职能的充分、高效发挥。
众所周知，我国图书馆的经费起点低，尽管图书馆经费经历了较快的增长，但直到目前，其绝对数额依然较小。考虑到目前图书馆基本支出特征——书刊价格不断上涨、需要采购的文献类型日益多样、以现代信息技术为核心的设备更新日益昂贵、人民生活水平改善后对办公及阅览条件的不断升级，目前图书馆经费远远不能满足其正常发展的需要。
尽管我国图书馆经费的整体水平得到了较大程度的改善，但由于各级图书馆所处的经济环境不同，地区间的差异还是很大，发展处于一种分化的状态。在经济不发达的地区，图书馆的经费投入没有保障，部分地区图书馆难以维持现状，许多地方甚至没有图书馆，特别是在西部农村，这种现象更为严重。经费投入不足、地区发展失衡已经成为我国图书馆可持续发展最为突出的问题。
我国图书馆事业与社会事业的其他领域相比，投入严重不足，差距在拉大。而本来就比较少的经费又主要用来支付职工工资，可用于购书的经费少得可怜。
由于投入的不足，许多图书馆的藏书量严重不足，图书无法更新，图书馆的人均藏书量远远低于国际图联的人均藏书1.5 ~2.5册的标准。图书馆的馆舍陈旧老化，服务设施和技术设备落后，许多地区的图书馆馆舍已经陈旧老化，时至今日，已变得寒酸破败，其设备根本无法使用，仅作为摆设。
首先，从东西部来看，图书馆事业东西部地区之间差距越来越大，北京、上海、江苏、浙江、山东、福建、广东图书馆事业发展很快，十分可喜。但是西部地区非常令人担忧，就文化事业经费的投入来看，中西部地区占总人口的2 /3，但文化事业经费投入只占总量的44%。一级图书馆数量最多的是江苏省，上海市一级图书馆、上等级的图书馆比例是全国各省、市、区之首。而青海、西藏上等级的图书馆数量极其稀少。其次，从县级图书馆与市级、省级和国家图书馆相比来看，由于各级图书馆的投入主要靠同级财政的投入，我国的财政状况是市、省级和中央财政的财力要比县级基层财力雄厚得多，因此县级图书馆的状况要比市、省、国家图书馆差得多，无论是馆舍基础设施、技术设备等硬件条件，还是人员素质、服务水平等软件条件，都不在同一档次上。再次，从城乡差距来看，一些城市所辖区县的县级图书馆与一些农业县的县级图书馆的发展差距也十分大，有时甚至城市所辖区县的县级图书馆比一些省的省级图书馆还要好。
图书馆管理体制是指对图书馆实施控制、监督、指导、操作的机构安排以及这些机构间的权利义务关系。具体地说，图书馆管理体制决定着谁负责制定图书馆的方针、政策、标准；谁负责给予图书馆政策拨款；谁决定它的发展规划；谁对它进行监督约束；谁在业务上对它进行指导等一系列问题。
在我国，各级地方政府是我国图书馆发展的最主要决定者，地方政府不仅掌握着图书馆的发展的财权、规划权、决策权和管理权，而且地方政府对这一权力的运用情况受到的约束和监督很小，几乎没有。此外，各级图书馆所处的经济环境不同决定了我国图书馆在管理体制上实行条块分割、各自为政，难以形成协同运作、优势互补、高效服务的图书馆体系。这种管理体制致使图书馆产生了分配不公、效率低下等恶果，严重影响了图书馆正常功能和作用的发挥。
现代社会人们渴求获得不同的、深层次的信息与知识，但是作为信息部门之一的图书馆由于计划经济体制的影响，固守传统的做法致使服务内容一直停留在简单的书刊借阅上，对文献信息深加工与开发利用浅尝辄止，除纸质印刷物外，其他先进的文献信息载体形式收存甚少。这样远离市场经济需要的服务造成大多数图书馆目前难以满足读者多方面、多层次的综合性需求，从而降低了图书馆的社会地位。
在传统的图书馆管理思想的影响下，人们仍然习惯于以馆藏多少作为评价图书馆的等级标准，共享意识淡薄，缺乏全局观念，保守主义、形式主义和本位主义思想严重，追求“大而全”“小而全”的现象依然普遍存在。领导信息管理观念淡薄，对图书馆工作的重要性还没有充分认识，闭关自守、自给自足，盲目追求大而全，造成信息资源的重复投资和严重浪费。读者并不在乎图书馆是幢什么样的建筑，在什么位置，又有多少文献，读者在乎的是图书馆能提供什么信息资源和信息服务，他们不再经常去建筑形式的图书馆，而是通过网络获取文献信息。
许多图书馆资源与服务分布较散，一站式信息服务未能实现。服务以图书馆为中心，被动地等读者上门。图书馆图书资源采集不全，有些文献没有收集。由于工作机制、人员素质及设备的限制，服务工作有许多局限性，造成读者利用效率不高。馆员对学术研究活动就很不重视，认为那是专家学者研究、探讨的东西，自己只要把本职工作做好就已经不错了，抑制了工作人员的工作积极性和主动服务的精神。
目前图书馆普遍存在的矛盾是：读者用户日益增长的信息知识需求与图书馆的信息知识提供能力相对落后之间的矛盾。而造成这一矛盾的主要因素就是图书馆的整体素质相对较低。在我国，图书馆的管理长期以来一直隶属于上级文化主管部门，自身缺少支配人力资源的权力，很多工作人员是照顾安排进来的。这种用人局面导致能干事的进不来，进来的干不了事，队伍老化，文化层次普遍偏低，人浮于事现象严重，难以开拓事业发展新领域。
此外，虽然目前不少图书馆的人才结构较之前些年有长足的进步，但大部分工作人员都不是图书馆学专业或计算机专业的，普遍存在着知识结构单一、专业结构不合理等问题。部分工作人员专业知识水平不高，即使其有很好的服务态度也无法为读者解疑释难，再加上培训制度的不完善，使之传统技能和知识水平越来越无法适应图书馆现代化的发展，越来越无法满足读者利用图书馆的需求。
图书馆馆员年龄偏大、素质偏低，接受现代化知识比较慢。图书馆要实现信息化、数字化、电子化，年龄偏大的人员接受新事物较慢，不敢使用电脑网络，这样势必影响图书馆向现代化方向发展。年轻、学历高、有能力、高素质，对图书馆事业有追求的人却想进无门，实现图书馆的信息化、网络化是一纸空谈。在网络环境下，图书馆工作人员将不再只与图书打交道，而是与计算机网络打交道，图书馆的服务内容和手段都发生了巨大的变化，对图书馆馆员提出更高的业务素质要求。各级管理人员及基层操作人员在安全水平与意识上也存在着一定的差异，往往造成上下级理解不同，操作无法规范化，致使网络安全方面的措施很难达到预期的成效。
我国图书馆事业存在的这些问题，在很大程度上制约了我们现代图书馆的发展，如果这些问题得不到有效解决，我们图书馆现代化建设就不能实现，从而在很大程度上限制了现代图书馆的发展。