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四大臣执政初始，尚能齐心合力，基本上遵照福临制定的方针，继续完成统一中国的战争。康熙元年（1662年）四月，奉四铺臣之命，吴三桂执杀南明桂王朱由榔。西南各地小股抗清势力纷纷归降，偏居台湾的郑氏部属亦有归顺者。三年三月，靖西将军穆里玛同定西将军图海，率八旗劲旅及湖广、四川、陕西三省绿营兵，镇压了大顺农民军余部李来亨领导的郧襄山区茅麓山抗清力量。至此，大规模的民族征服战争结束，清王朝进入了相对稳定的发展阶段。多年的战争给社会生产造成了极大破坏，经济凋敝，民生涂炭。四铺臣面对百废待兴的局势，大力恢复和发展生产，安插流民，奖励垦荒，施行赈济蠲免政策，以苏民生。同时，他们依世祖遗诏精神，将顺治年间改设的内阁和翰林院撤销，重新恢复内三院名称，并加强对官吏的管理，裁汰了十三衙门，扩建了内务府，并注重督抚的楷模作用。几年间，经济发展，年谷屡登，社会秩序趋向安定。
从康熙五年开始，四大臣之间的争斗日益激化。正白与正黄、镶黄两旗同属于上三旗，地位尊贵，但正白旗与两黄旗却积怨甚深，在四大臣中，遏必隆和鳌拜属两黄旗，正白旗的苏克萨哈成为了他们的眼中钉，被他们打压。四人中，索尼最是德高望重，但是他已经年迈，见鳌拜与苏克萨哈形同水火，却又无力排解，屡次呈请圣祖亲政。遏必隆与鳌拜同旗结党，凡事皆附和鳌拜。而苏克萨哈威望浅薄，势单力孤，心非鳌拜所为而无力抗争。康熙六年六月，索尼谢世。班行章奏，鳌拜均列首位。
在鳌拜专权的道路上，最大的障碍就是苏克萨哈。
苏克萨哈也是个才能突出的人，他文武双全，曾追随顺治皇帝驰骋天下，多次镇压农民起义军，而且为人平易近人、善结好友，只要是有才干的，他都虚心接受。值得一提的是，鳌拜和苏克萨哈是儿女亲家，但因为政见不同，两人如同水火。
为了扫清苏克萨哈这一障碍，他做了四件事。
一是极力拉拢索尼和遏必隆，取得两人支持。索尼和遏必隆都是两黄旗人，他们和鳌拜都是皇太极的忠实部下，因此关系本来就比较近。而且在拥戴顺治继位的时候，鳌拜是发起者，再加上索尼年纪比较大，不愿意再多过问朝政，遏必隆又是个老好人，鳌拜稍微一拉拢，他们自然站在鳌拜一边。因此，在四大臣辅政中，很快对苏克萨哈形成“三比一”的绝对优势。
二是极力为正黄、镶黄两旗人谋福利，以取得他们的支持。他的方法就是提出正黄旗、镶黄旗与正白旗换地。这种做法为正黄、镶黄两旗的人争得了不少利益，在多尔衮时期，由于多尔衮的袒护，正白旗所得到封地明显比正黄、镶黄旗好，鳌拜因此有此举动。鳌拜这也是效法皇太极的做法。
三是削弱苏克萨哈的支持势力。鳌拜处决了三个反对换地的人，包括大学士、户部尚书苏纳海，直隶、山东、河南三省总督朱昌祚以及巡抚王登联。这些人都是正白旗或者同情正白旗的人，也是苏克萨哈的支持者，削弱了苏克萨哈的支持势力。
四是孤立苏克萨哈。苏克萨哈在顺治亲政时首先站出来指出多尔衮罪状，这一点为很多人所不齿，后来在与鳌拜的争地斗争，以及保护三位部下的风波中居于下风，因此正白旗人对苏克萨哈多有怨言。苏克萨哈两边不讨好，最后才彻底败下阵来。
苏克萨哈在一败涂地的情况下，准备来一招“置之死地”“釜底抽薪”或者说“同归于尽”。他提出还政于康熙，自己去给顺治守陵，想让康熙皇帝来压制鳌拜，但是康熙毕竟年幼，鳌拜根本没把这个小皇帝放在眼里，因此他罗列了苏克萨哈的二十四大罪，将他处死，甚至把他一家差不多灭族。
值得注意的是，康熙也是在这样的变化中逐渐成长成熟了，而且学会了使用一些策略，这些变化都是鳌拜没有察觉的。
起初，康熙发现，索尼总是称病休息不上朝，他一开始在上朝时会问一问索尼的病情，可是随着时间的推移，康熙发现鳌拜对于他关心索尼的态度似乎并不愉快，于是，他改变了方法，开始当场训斥索尼因私废公、不顾大局，但下朝之后，康熙会去索尼的家里看望他，还会将鳌拜在朝堂上的所作所为告诉他，并征询索尼对付鳌拜的策略。后来，在康熙五年时，太皇太后和康熙还决定立索尼的孙女赫舍里氏为皇后，很明显，这也拉拢了索尼。
对待鳌拜，则以安抚和麻痹为主，表面上，康熙对鳌拜的结党营私的行为毫不知情，还在朝堂上赞赏鳌拜和他的党羽，这样，能稳住鳌拜，避免他在康熙羽翼未丰时做出犯上作乱的行为。
康熙很明白，遏必隆一派依附鳌拜，不过是胆小而已，为此，康熙立遏必隆的孙女为贵妃，这种做法也能遏制遏必隆和鳌拜串通一气。
苏克萨哈作为鳌拜党的对立派，经常在朝堂上当面指出鳌拜的罪状，这虽然也是康熙想说的，但是他并不能在朝堂上顺着苏克萨哈，而是要训斥他，防止鳌拜集团向外扩张。
从这些措施能看出来，康熙能清晰准确地把握四大臣的不同特点，并能对症下药，找到对付每个人的方法，表现出一个成熟的政治家的风范。
然而，康熙担心的一些事还是发生了。
康熙五年（1666年），鳌拜借口多尔衮时期将镶黄旗应得到的土地给予正白旗，以坏地换好地，使本旗镶黄旗领所得到的田地十分“不堪”，提出应该给予调换。
索尼、遏必隆都支持他，鳌拜遂移文户部，并以土地不堪为理由。户部尚书、隶正白旗的苏纳海认为土地分配已久，且康熙三年奉有民间土地不许再圈圣旨，反对更换。鳌拜暗欲置之死地。此后，虽有议政王大臣议复此事，又有都统贝子温齐等人查勘八旗占地的详情，辅臣等仍称旨说：永平府周围地亩未经圈出，应令镶黄旗移住。并援引顺治帝的凡事俱太祖太宗例行之旨，极欲实现鳌拜心愿。四月，户部遵旨议复镶黄、正白两旗换地一事，以两议请旨。鳌拜等人在称旨时将两议中于己有利的内容全部纳入。
是年底，直隶山东河南总督、隶汉军正白旗的朱昌祚和直隶巡抚、隶汉军镶红旗的王登联均据实据理，抗言直谏。鳌拜等对他们称旨严责。不久，在鳌拜的一手操纵下，苏纳海、朱昌祚、王登联均被革职，交刑部议罪。年轻的康熙帝知道拜鳌必欲杀害这三人，特召四辅臣询问，独苏克萨哈不语，其他三人坚持应置重刑。康熙帝始终不允鳌拜等人所奏。谁知，鳌拜竟擅自矫旨，将苏纳海、朱昌祚、王登联处予绞刑，家产抄没。
十二月，这场圈换旗地之争以鳌拜得势暂告结束。
四大臣中，苏克萨哈在与鳌拜一派的争斗中逐渐感到力不从心，心生退意。
索尼看着鳌拜的势力逐渐坐大，而自己也年岁渐长，心中十分忧虑，于是，他策动三辅臣与自己一起奏请皇上亲政。这年，康熙十四岁时，在索尼等人的不断请求和太皇太后的应允下，康熙决定亲政，但为了安抚鳌拜，他依然下令鳌拜等人以辅政大臣的身份处理国家事务。不久，苏克萨哈上奏请求为顺治先帝守陵，以此保全余生，但是鳌拜依然不放过他，鳌拜及大学士班布尔善诬以不欲归政，对其列二十四罪，将其灭族。