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企业式具有现代企业的一些特征，有较为健全的组织机构设置，有管理者和雇员，产权明晰，机制灵活。经营的园区是一个独立的经济实体，独立经营、自主决策、自负盈亏，土地一般通过租赁的方式获得。经营者按照市场价值规律经营运作、配置资源，景区的经济效益往往较好，经营规模较大。
这种模式的优势在于产权明晰，自然地解决了政企分开和市场导向的问题。经营者市场反应迅速，注重投资回报。劣势在于经营者是独立经营，在政府监督不严格的情况下，可能会过于注重经济效益，轻视社会和环境效益，容易对景区进行掠夺式开发。这种短期行为会破坏景区资源，影响休闲农业的可持续发展。
“园区+企业”式一般由政府推动，政府组织园区的基础设施建设，提供相关配套服务，并在园区设立管委会作为主管机构。园区借助各种优惠政策，通过招商引资吸引投资规模大、科技含量高、经济效益好的农业企业进驻园区。入驻企业租赁园区内土地，独立经营，独立核算，管委会不直接参与企业的运营。
园区内汇集众多高新技术企业，科研开发和示范推广能力强，可以对农民进行技术培训带动农民致富。园区内农作物品种新奇独特，观赏性强，能使游人领略现代农业的发展趋势和高科技的神奇魅力。这种模式尽管已经把观光旅游作为目标之一，但是开发力度尚显不足。管委会作为园区的旅游接待机构，还没有充分挖掘现代农业的旅游功能。园区内的旅游项目和食宿接待设施往往不多，园区也较少地和周围旅游景点进行有效的互动。
联合式以行政村为单位。村内农户大部分都开展旅游接待服务，但单体规模一般不大，由于地缘关系有互相合作的意识。接待户之间会分享超过自家接待能力的过剩客源，这样可以将小团队游客留在当地，从而获得旅游收入。接待户之间没有资产联系，各接待户自负盈亏。村委会是旅游管理机构，为本村接待户和来访游人提供基础性的服务。村内有旅游景点或依托周边的旅游景点。对外宣传时以民俗村的整体形象出现。
这种模式的优点是可以提高农民的组织化程度，带动当地农民从事旅游接待服务，减少单个旅游接待户独立面对市场的风险，扩大旅游影响，增加农民收入。其劣势在于村委会是传统意义上的行政管理组织，作为旅游管理机构缺乏现代经营管理意识；接待户之间是松散的联合，在有利益冲突时往往缺乏大局意识，在统一行动上存在一定的困难。
个体经营式是指旅游接待大户，也就是通常意义上的个体户，其规模比普通的民俗户要大，经营效益也较好。经营者在自家现有田园和房屋的基础上，进行改扩建，为游客提供一些娱乐设施和食宿接待服务。这类大户一般不依赖村组织，有独立面对市场的能力。个体经营最为灵活，也可以对周边农户产生一定的榜样和示范作用。但是，个体式经营完全依靠个人的能力，其规模毕竟有限，对促进当地经济发展和全体农民增收的作用很小。行政部门在对个体经营者的行为约束上，也存在一定的困难。
以上四种经营模式，各有优劣势。个体式经营者拥有最明晰的产权，但这种经营模式规模小、资金实力弱。“园区+企业”式经营还存在着一定的政府干预，经营机制上不够灵活。联合式经营是一种初级的合作方式，可以提高农民的组织化程度，带动农民增收。企业经营模式在四种模式中是效益最好的，这不仅因为经营者有一定的资金实力，还在于经营者有较为明晰的产权。经营者对休闲农业景点拥有占有权、使用权、经营权、收益权。拥有了这些权利，使得经营者的付出和回报休戚相关。经营者在主观上会充分发挥能动性，合理配置景区资源，深入挖掘潜力，大力开拓市场，努力提高经营效益。在客观上，经营者的这种行为也促进了休闲农业的整体发展。可见，一个恰当的产权制度能充分激励经营者，同时也能有力地促进产业的发展。从总体趋势来看，政府也正在逐渐放开旅游景区（点）的开发、经营等权利，企业经营模式代表了一种发展方向。当然，企业经营模式也有它自身的缺陷。如盲目崇拜社会关系、漠视社会公德、缺乏民主等。