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肛肠学科是一门历史悠远的医学专科。几千年来肛肠学科不断进步和发展，近百年来随着人们对这类疾病的认识不断加深，肛肠学科逐渐成为一门独立的学科，形成了一定的理论和临床诊疗、护理体系，造福于人类健康。
早在商周时期，即有对人体实体解剖的详细记载。在春秋时期，我国医学家就提出了“痔”“漏”的病名，后为世界医学所采用，并沿用至今。宋、元、明时代，我国肛肠专业有了很大发展。唐宋时期，这些方法就传到了邻国，我国对肛肠学科的发展有独特贡献，曾居于世界领先地位。枯痔疗法、肛瘘挂线疗法等我国独创的治疗方法，解决了肛肠疾病治疗中的一些难题。
如《灵枢·平人绝谷》中说：“广肠大八寸，径二寸寸之大半，长二尺八寸，受谷九升三合八分合之一。”《医宗必读·行方智圆心小胆大论》中说：“大肠传道之官，变化出焉……是经多气多血……广肠即回肠之更大者，直肠又广肠之末节也，下连肛门，是为谷道后阴，一名魄门……”这些记载详细说明了肛门、肛管、直肠的长度、大小和走向以及生理功能和特点，并将肛门、肛管、直肠包括于大肠之中。《秘传证治要诀及类方》中说：“肛门者，大肠之下截也。一曰广肠，言其广阔于大小肠也。又曰魄门，言大肠为肺之腑，肺藏魄，故曰魄门也。肛者，言其处似车缸形也。”这些记载与西医学对肛门、肛管、直肠解剖的认识是相符合的。
我国古代医学家对解剖学的发展做出了突出贡献，对肛肠病学的研究有着突出成就，得到了世界肛肠学界的一致公认。中华人民共和国成立以来，我国中医、西医和中西医结合三支力量团结合作，努力传承祖国传统医学，积极吸收国外先进理论和诊疗、护理经验，进行了大量的基础理论研究和临床研究，在肛肠病学的许多方面取得了不少重要进展，使我国肛肠学科进入了新的阶段。
中医学认为，人是一个有机整体，整体统一性的形成是以五脏为中心，通过经络“内属于脏腑，外络于肢节”的作用而实现的。大肠肛门是机体的重要组成部分，在生理上不但有其独自的功能特点，而且与五脏等器官的功能活动也有密切的关系。大肠上连阑门与小肠相接，下为肛门，具有传导、排泄水谷糟粕等作用，肛门具有调节和控制排便的功能。
大肠肛门疾病是发生在肛门、直肠和结肠的多种疾病的总称，已经不再局限于传统意义上单纯的痔瘘疾病，而是包括了从回盲瓣开始的与结、直肠和肛门有关的所有疾病，如痔、肛管直肠周围脓肿、肛瘘、肛裂、肛乳头纤维瘤、直肠阴道瘘、肛窦炎、肛管直肠脱垂、小儿脱肛、婴幼儿肛瘘、直肠前突、肛门直肠畸形、会阴撕裂、肛管直肠癌、肛门失禁、肛周骶尾畸胎瘤、肛管直肠狭窄、肛门直肠损伤和异物、肛周皮肤病如肛周湿疹等。大肠肛门疾病是临床的常见疾病，民间自古就有“十人九痔”“十男九痔”“十女十痔”等说法，这些疾病给患者的生活和身心健康都造成了极大困扰。