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在胃肠道统一理论GUT框架中，肠膜有效渗透性P eff 是基于可透过第一道渗透屏障非搅拌水层UWL的各种分子状态药物的总浓度进行定义的，游离型药物单体、胆汁胶束-药物结合都会透过UWL。因此，肠膜有效渗透性P eff 是基于溶解的药物浓度C dissolv 进行定义的，C dissolv 是渗透和溶出时所采用的统一有效浓度。
在大多数情况下，假设只有游离型的药物单体能渗透过上皮细胞膜是合理的。很多实验数据表明，体外试验、在体肠试验、体内试验中胆汁胶束-药物结合会降低表观渗透性P app ，P app 通常是通过溶解的药物浓度C dissolv 进行计算的 ① 。胆汁胶束-药物结合被认为是产生负向食物效应（吸收降低）的主要原因之一，详见第12章。
① 通常的体外渗透性试验（比如Caco-2）的给药池中没有添加胆汁胶束，因此在生物药剂学建模时，如采用体外渗透性数据，应将渗透性数据乘以f u 进行胆汁胶束结合校正。
上皮细胞膜的有效渗透性P′ ep 是通过溶解的药物总浓度进行计算的，方程为：
如UWL渗透性的影响可以忽略，则P eff 为：
这和肝清除率的计算相似，即肝固有清除率（CL h，int ）和血浆中的游离百分数（f up ）与肝清除率（CL h ）相关，当 Q h ＞f up ×CL h，int 时，CL h =f up ×CL h，int ，见 4.11 章节。