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微生物是广泛存在于自然界中的一群肉眼看不见，必须借助光学显微镜或电子显微镜放大数百倍、数千倍甚至数万倍才能观察到的微小生物的总称，具有体形微小、结构简单、繁殖迅速、容易变异及适应环境能力强等特点。
细菌是属原核生物界的一种单细胞微生物，具有细胞壁和原始核质，无核仁和核膜，除核糖体外无其他细胞器。细菌的大小可以用测微尺在显微镜下进行测量，一般以微米（μm）为单位。
病毒是由一个核酸分子（DNA或RNA）与蛋白质构成的非细胞形态，靠寄生生活的介于生命体及非生命体之间的有机物种，它既不是生物亦不是非生物。它是由一个保护性外壳包裹的一段DNA或者RNA，借由感染的机制，这些简单的有机体可以利用宿主的细胞系统进行自我复制，但无法独立生长和复制。
某些细菌在一定的环境条件下，胞质脱水浓缩，在菌体内部形成一个圆形或卵圆形小体，是细菌的休眠形式，称为芽孢。芽孢对热力、干燥、辐射、化学消毒剂等理化因素均有强大的抵抗力。
朊病毒又称蛋白质侵染因子、毒朊或感染性蛋白质，是一类能侵染动物并在宿主细胞内复制的小分子无免疫性疏水蛋白质。朊病毒是一类不含核酸而仅由蛋白质构成的可自我复制并具感染性的因子，是一类能引起哺乳动物和人的中枢神经系统病变的传染性病变因子。
医院感染是指住院患者在医院内获得的感染，包括在住院期间发生的感染和在医院内获得出院后发生的感染，但不包括入院前已开始或者入院时已处于潜伏期的感染。医院工作人员在医院内获得的感染也属医院感染。
内源性医院感染又称自身感染，是指各种原因引起的患者在医院内遭受自身固有病原体侵袭而发生的院内感染。
外源性医院感染又称交叉感染，是指各种原因引起的患者在医院内遭受非自身固有的病原体侵袭而发生的感染。
职业暴露是指医务人员在从事临床诊疗、护理及科学实验等职业活动的过程中，通过眼、口、鼻及其他黏膜、破损皮肤或非胃肠接触含血源性病原体的血液或其他潜在传染性的物质；也指由于职业原因而暴露在危险因素中，从而有可能损害健康或危及生命的一种情况。
标准预防是基于患者的血液、体液、分泌物（不包括汗液）、非完整皮肤和黏膜均可能含有感染性因子的原则，针对医院所有患者和医务人员采取的一组预防感染的措施。
职业防护是指医务工作者在医疗、护理等工作中采取多种有效措施，保证工作者免受职业损伤因素的侵袭，或将其所受伤害降到最低程度。
防护服是指临床医务人员在接触甲类或按甲类传染病管理的传染病患者时所穿的一次性防护用品。
防水服为清洗操作时穿着的防护用品，应具有良好的阻水性和防渗透作用。
护目镜是防止患者的血液、体液等具有传染性的物质溅入人体眼部的用品。
手卫生是医护人员洗手、卫生手消毒和外科手消毒的总称。
消毒是指消除或杀灭传播媒介上病原微生物，使其达到无害化的处理。
消毒剂是指能杀灭传播媒介上的微生物并达到消毒要求的制剂。
高水平消毒剂是指能杀灭一切细菌繁殖体（包括分枝杆菌）、病毒、真菌及其孢子等，对细菌芽孢也有一定杀灭作用的消毒制剂。
中水平消毒剂是指能杀灭分枝杆菌、真菌、病毒及细菌繁殖体等微生物的消毒制剂。
低水平消毒剂是指能杀灭细菌繁殖体和亲脂病毒的消毒制剂。
灭菌是指杀灭或清除医疗器械、器具及物品上一切微生物的处理。
灭菌剂是指能杀灭一切微生物（包括细菌芽孢）并达到灭菌要求的制剂。
1868年E.H.Spaulding根据医疗器械污染后使用所致感染的危险性大小及在患者使用时的消毒或灭菌要求，将医疗器械分为三类，即高度危险性物品、中度危险性物品和低度危险性物品。
高水平消毒能杀灭一切细菌繁殖体，包括分枝杆菌、病毒、真菌及其孢子和绝大多数细菌芽孢。达到高水平消毒常用的方法，包括采用含氯制剂、邻苯二甲醛、过氧乙酸、过氧化氢、臭氧、碘酊等，以及能达到灭菌效果的化学消毒剂在规定的条件下，以合适的浓度和有效的作用时间进行消毒的方法。
中水平消毒能杀灭除细菌芽孢以外的各种病原微生物，包括分枝杆菌。达到中水平消毒常用的方法包括采用碘类消毒剂、醇类和氯己定的复方、醇类和季铵盐类化合物的复方、酚类等消毒剂，在规定条件下，以合适的浓度和有效的作用时间进行消毒的方法。
低水平消毒指能杀灭细菌繁殖体（分枝杆菌除外）和亲脂病毒的化学方法以及通风换气、冲洗等机械除菌法。如采用季铵盐类消毒剂、双胍类消毒剂（氯己定）等，在规定的条件下，以合适的浓度和有效的作用时间进行消毒的方法。
洗眼器是指用来冲洗眼部的设备，其主要组成结构包括冲洗液输送管道、喷头、控制阀及阀门驱动装置。
手卫生设施是指用于洗手与手消毒的设施设备，包括洗手池、水龙头、流动水、洗手液（肥皂）、干手用品、手消毒剂等。
医疗废物是指医疗卫生机构在医疗、预防、保健以及其他相关活动中产生的具有直接或者间接感染性、毒性以及其他危害性的废物。
微生物按其大小、结构、组成等可分为非细胞型微生物、原核细胞型微生物和真核细胞型微生物三大类。
非细胞型微生物是最小的一类微生物，无典型的细胞结构，无产生能量的酶系统，只能在活细胞内生长增殖。核酸类型为DNA或RNA，两者不同时存在，病毒属于此类微生物。
完整成熟的具有感染性的病毒称为病毒体。病毒用纳米（为1/1 000μm）为单位来表示，病毒主要由核酸和蛋白质组成，在核酸外围有蛋白质外壳，称衣壳，衣壳与核酸在一起称为核衣壳，无包膜的病毒核衣壳就是病毒体。有些病毒衣壳外有包膜，有的包膜表面有钉状突或刺突构成病毒体的表面抗原。病毒的复制周期从病毒进入宿主细胞开始，经过基因组复制到释放，为一个复制周期。
朊病毒所致疾病类型为传染性退变性脑病变和传染性海绵状脑病变。朊病毒不具备病毒结构，无核酸形成，只是一种特异性蛋白质颗粒，这种蛋白质虽不能在体外繁殖，但其却有增殖性和传染性。
这类微生物的原始核呈环状裸DNA团块结构，无核膜、核仁。细胞器很不完善，只有核糖体。DNA和RNA同时存在。依据16S rDNA序列分析，这类微生物可分为古生菌和细菌两大类。细菌的种类繁多，包括细菌、支原体、衣原体、立克次体、螺旋体和放线菌等。
按细菌外形区分主要有球菌、杆菌和螺旋菌三大类。在自然界及人和动物体内，绝大多数细菌黏附在无生命或有生命的物体表面，以生物膜的形式存在。
细菌具有典型的原核细胞的结构和功能。其中细胞壁、细胞膜、细胞质和核质等是每个细菌细胞都具有的，故称为细菌的基本结构；荚膜、鞭毛、菌毛、芽孢仅某些细菌具有，为其特殊结构的特性。
是细菌致病重要的毒力因子，也是鉴别细菌的重要标志，荚膜多糖可使细菌彼此粘连，也可黏附于组织细胞或无生命物体表面，参与生物被膜的形成，是引起感染的重要因素。
带有完整的核质、酶系统和合成菌体组分的结构，能保存细菌的全部生命必需物质。一个细菌只形成一个芽孢，一个芽孢发芽也只生成一个菌体，细菌数量并未增加，故芽孢不是细菌的繁殖方式。与芽孢相比，未形成芽孢而具有繁殖能力的菌体称为繁殖体。芽孢的抗力强，一般细菌繁殖体在80℃水中迅速死亡，而有的细菌芽孢可耐100℃沸水数小时。杀死细菌的芽孢是作为判断灭菌效果的指标。
是介于细菌与病毒之间能单独生活的原核细胞微生物，目前被认为是能在灭活细胞的人工培养基中增殖的最小微生物，主要特点是缺乏细胞壁。常见的支原体有肺炎支原体、流感支原体、人型支原体和神经支原体等。
为原核细胞型微生物，是细菌学中独立的部分，寄生或共生于家畜、小哺乳类动物及节肢动物（虱、蚤、蜱、螨）体内，并通过它们进行传播。常见的致病立克次体有普氏立克次体、莫氏立克次体、Q热柯克斯体和康氏立克次体等。
是一类介于病毒和立克次体之间的形态，在宿主细胞内有独特的发育繁殖周期，同时含有DNA和RNA两种类型核酸的原核细胞型微生物。常见致病的衣原体有鹦鹉热衣原体、沙眼衣原体、淋巴肉芽肿衣原体、脑膜炎衣原体等。
是一类介于细菌和原虫之间的形态细长、柔软、呈波状或螺旋状、运动活泼的单细胞微生物，一般分为螺旋体、脊螺旋体、疏螺旋体、密螺旋体和钩端螺旋体5个属。后三属有引起人患回归热、梅毒、钩端螺旋体病的致病菌。
真核细胞型微生物细胞结构比较完整，包括细胞壁、完整的细胞核、丝状体和孢子。单细胞真菌呈圆形或卵圆形，称酵母菌。多细胞真菌大多长出菌丝与孢子，交织成团称丝状菌，又称霉菌。真菌孢子是真菌的繁殖器官。