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手术显微镜放大了手术视野，并且使用专业的显微外科器械，因而在镜下操作有别于常规的手术操作。在进行显微外科训练前，需要了解显微镜下操作的特点，这样有助于更好地掌握镜下操作的要点。
1.显微镜下视野内的组织结构放大，便于进行肉眼下无法完成的精细操作。
2.显微镜下视野缩小，操作的空间和范围有限。
3.显微镜的景深有限，物体的上下移动可以造成术野的不清晰。
4.由于放大效应，轻微的动作不稳定，在镜下均会非常明显，影响手术操作。
5.分别在肉眼和镜下操作时，视力的调整需要适应。
镜下操作时，动作要轻柔、稳健、幅度小，所有动作均在视野内进行，避免造成重要组织损伤。
镜下进行组织分离、剪切、缝合、打结、剪线等动作时，注意均在一个平面上进行，避免上下移动而导致的视物模糊。
进行镜下操作和更换显微外科器械时，眼睛不要离开目镜。通常可以将显微镊子放置于左侧，而显微持针器和显微剪刀放在右侧，便于镜下操作时拿取器械。
镜下操作时，将前臂、腕、手舒适地放置于手术台面上，或者在前臂和手部下方放置无菌单，避免长时间操作后肌肉疲劳引起的手部抖动。
血管、神经等结构容易损伤，并且镜下的操作空间有限，因此需要双手进行密切的配合。例如血管锐性分离时，一只手用显微镊子牵开血管保持张力，另一只手用显微剪刀锐性剪切分离。管壁进针时，一只手用显微镊子保持管壁张力，另一只手进针。