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1．胸膜损伤 术中需避免损伤胸膜，以防术后出现血气胸、胸腔积液、肺不张等，如已发生，术中应立即修补缝合，术后亦可行胸膜腔穿刺或胸腔闭式引流、加强抗结核等处理。
2．肠系膜上动脉综合征 术后患者上腹胀痛、恶心甚至呕吐，一般采用禁食、胃肠减压等处理。
3．脊髓损伤 发生率较低，但后果严重，应严加防范。主要由于胸腰段椎管容积小、缓冲空间小，术中操作稍有不慎可能损伤脊髓，而且伴有脊柱后凸畸形或脓肿压迫脊髓，当压迫解除后可发生脊髓缺血再灌注损伤。因此操作时要仔细，注意手法的轻巧和准确，多可避免；术中监测躯体感觉诱发电位（somatosensory evoked potential，SEP）和运动诱发电位（motor evoked potential，MEP），对脊髓损伤的避免也有帮助。
4．脊柱不稳 在将结核病灶清除、减压充分的基础上，对能保留的椎体骨质尽量保留，以防骨缺损太大，影响稳定性的重建。
5．术前需抗结核治疗2周，复查红细胞沉降率示逐渐降低或不再升高再行手术，以防术中、术后结核播散。
6．术后结核复发、窦道形成 多发生在术后2～3年，其主要原因有术中病灶清除不彻底，术后未正规抗结核治疗，脓肿引流不充分，手术时机不当，或合并其他细菌感染、全身情况恶劣、严重营养不良。因此应在彻底清除病灶的基础上规律、全程、适足量、联合服用抗结核药物12～24个月，平均18个月。术后常规静脉予以广谱抗生素预防感染，并且加强营养，予以对症支持及内科治疗，控制血糖等指标稳定于正常范围。
7．术后长期卧床易导致压疮、坠积性肺炎、下肢深静脉血栓、肌萎缩、骨质疏松加重等并发症，术后需鼓励患者勤翻身、叩背咳痰、雾化治疗等，早期指导患者于床上行四肢功能锻炼及康复治疗，术后常规使用下肢气压治疗预防下肢深静脉血栓，尽早佩戴支具下地活动。