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动物实验结果的准确性和可靠性受到各种因素的影响，其中实验过程中的动物福利保障就是一个重要因素。福利差的实验动物就好比失效的试剂或者失准的仪器，会使研究结果出现偏差甚至错误。应用福利良好的高质量实验动物，能减少动物用量，避免不必要的重复实验，降低其他实验材料和能源的消耗。因此，实验动物福利不仅是实验动物自身的需要，也是保证动物实验结果科学、可靠的基本要求。保障动物实验过程中的动物福利，总的原则是把动物的应激、痛苦和不安减少到最低程度。
动物在实验过程中受到的应激程度与操作者的熟练程度、工作态度和操作环境有关。进行动物实验时应为动物提供适宜的环境，避免过冷过热、强光、噪音等不良刺激。实验实施之前，如果对动物进行温柔地抚慰，动物会显得比较平和、温顺，有的甚至能够配合操作者进行实验。反之，如果操作者态度恶劣、动作野蛮粗暴，动物也会产生一种反抗情绪，拒不配合，实验很难继续进行。即使勉强进行下去，也得不到真实、准确的实验结果。保定实验动物时，应遵循“温和保定，善良抚慰，减少痛苦和应激反应”的原则。保定器具应结构合理、规格适宜、坚固耐用、环保卫生、便于操作。在不影响实验的前提下，应尽量减少对动物身体的强制性限制。
开始动物实验时，先进行短时低频的模拟操作，循序渐进，逐渐增加次数和提高强度，平稳过渡到正式操作，缓解实验操作对实验动物带来的应激，避免剧烈的行为学变化。在对实验动物进行手术、解剖或器官移植时，必须进行麻醉，并做到准备充分、方法得当、用药合理、深度适宜。术后恢复期应根据实际情况，进行镇痛和有针对性的护理及饮食调理。在得知实验结果时，及时选择动物表现疼痛和痛苦的较早阶段作为实验的终点。处死实验动物时，必须采用无痛苦的方式。现场不宜有其他动物在场。确认动物死亡后，方可处置尸体。