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建立动物模型的最终目的是为了防治人类疾病。因此，对动物模型的评估主要取决于模型与人类疾病的相似或可比程度。一个理想的动物模型应具有以下特点：①能再现所要研究的人类疾病，即动物疾病表现与人类疾病相似；②不同动物可重现该疾病，最好能在两种或两种以上的动物身上复制该疾病；③动物背景资料完整、等级合格、生命周期能满足实验需要；④动物要价廉、来源要充足、便于运送；⑤尽可能选用小型动物。除此之外，动物模型的评估还可以用表面效度、结构效度和预测效度来体现。表面效度/表型是指该模型具有与人类疾病相似的临床症状表现。如呼吸系统动物模型以反复发作的慢性咳嗽、咳痰或伴有喘息为特征。消化系统动物模型以呕吐、腹痛、腹泻、便秘为特征。抑郁模型以情绪和行为障碍为特征。心血管系统动物模型以心肌缺血、心律失常、血压变化为特征。糖尿病动物模型以血糖升高、多食、多饮、多尿、体重减轻等为特征。结构效度指该模型具有与人类疾病相似或相同的病理生理学改变，如呼吸系统动物模型的病理特点是支气管腺体增生，黏液分泌增多。抑郁模型应包括相似的交感神经系统反应模式、下丘脑-垂体-肾上腺皮质轴的反应性、脑内相关神经递质的类型和变化趋势等。预测效度是指该模型的表现及结构改变能够被经典有效的治疗药物逆转。