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基本病理动物模型（animal model of fundamental pathologic processes of disease）是指各种疾病共同性的一些病理变化过程模型。致病因素在一定条件下作用于动物，使动物组织、器官或全身造成一定病理损伤，出现各种功能、代谢和形态结构的某些变化，其中有些变化是许多疾病共有的现象，如发热、缺氧、水肿、休克、弥散性血管内凝血、电解质紊乱、酸碱平衡失调等。如发热症状动物模型，可以通过化学药品、生物制剂和综合方法诱导。家兔背部皮下注射2%的硝基苯酚（DNP）溶液，30min后家兔体温显著升高，lh后达到峰值，较对照组体温升高1.58℃。大鼠皮下以160mg/kg的剂量注射DNP溶液，体温将升高0.6℃以上。用0.5% CMC-Na（羧甲基纤维素钠）溶解甲状腺素片配制成5mg/kg所需浓度的溶液，对大鼠每日5ml/kg连续给药7d后，可以得到合适的发热动物病理模型。大鼠的双后爪囊跖皮下分别注射1%卡拉胶混悬液0.1ml，也可造成发热模型。以10ml/kg的剂量，给大鼠背部注射15%的酵母菌混悬液，0.5h后其体温上升。
系统疾病动物模型（animal model of different system disease）是指与人类各系统疾病相对应的动物模型，分为神经、心血管、呼吸、消化、泌尿、生殖、内分泌等系统疾病动物模型。
包括癫痫动物模型、抑郁症动物模型、记忆障碍动物模型、阿尔茨海默病（Alzheimer's disease，AD）动物模型等。例如，大鼠腹腔注射氯化锂、毛果芸香碱可出现持续性癫痫发作，从而建立癫痫动物模型。应激法、药物法、嗅球切除法以及免疫因子刺激法可建立抑郁症动物模型。侧脑室注射选择性胆碱能神经毒剂AF64A损伤大鼠前脑基底胆碱能神经元，制备AD模型。
包括心肌缺血动物模型、心律失常动物模型、高血压动物模型、动脉粥样硬化动物模型等。例如，冠脉结扎法、注射药物诱发冠脉痉挛法、闭胸法等引起兔、豚鼠、大鼠的冠状动脉血流量降低，致使心肌供氧不足以及代谢产物清除减少，均可制备心肌缺血模型。不同动物饲料中添加高胆固醇类物质可以复制动脉粥样硬化斑块。兔每天喂服胆固醇0.3g，连续4个月；大鼠喂服1%～4%胆固醇、10%猪油、0.2%甲硫氧嘧啶、86%～89%基础料，连续7～10d；Gottigen系小型猪喂饲含1%～2%的高脂食物6个月；雄性C57BL/6J小鼠在普通饲料中加5%胆固醇、2%胆酸钠、30%蛋白质，喂养25周，动物均可出现动脉粥样硬化斑块。
包括慢性支气管炎动物模型、肺水肿模型、支气管痉挛、哮喘模型等。如大鼠和小鼠吸入氧化氮可造成中毒性肺水肿。兔或犬的气管内注入50%葡萄糖液可引起渗透性肺气肿。豚鼠腹腔注射致敏抗原鸡蛋白溶液可复制急性过敏性支气管痉挛。
包括急性胰腺炎实验动物模型、肝硬化动物模型、胆囊炎动物模型、脂肪肝动物模型等。如大鼠胰胆管注射牛磺胆酸钠可复制急性胰腺炎实验动物模型。大鼠腹腔内注射D-氨基半乳糖，约半年之后可形成肝硬化。细菌感染或化学刺激（胆汁成分改变）可致胆囊炎性病变。过量饮酒、长期高糖/高脂饮食、四氯化碳药源性肝损害、乙醇灌胃等方法可制备脂肪肝动物模型。
包括慢性肾小球肾炎动物模型、肾结石、膀胱结石动物模型等。如抗血清法、异种蛋白法、阿霉素法等制备慢性肾小球肾炎模型。膀胱内异物移植、用富含维生素A的食物饲养动物、乙二醇和乙醛酸钠中毒，在肾内形成草酸钙结晶，有利于结石的发生，以建立肾结石模型。
包括前列腺增生症动物模型、子宫内膜异位症动物模型等。如雄性激素法、胎鼠尿生殖窦植入法等建立前列腺增生模型。
包括糖尿病动物模型、甲状旁腺功能亢进症动物模型、甲状腺功能减退症动物模型等。如以化学诱导法、胰腺切除法、高脂/高糖饲料喂饲法建立糖尿病动物模型；高磷饮食诱导法建立原发性甲状旁腺功能亢进动物模型；低碘饲料喂饲法、化学诱导法、甲状腺切除法建立甲状腺功能减退症（甲减症）模型。