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本报告中数据主要来源于政府数据库和国家神经系统疾病医疗质量控制中心的信息平台。
由国家卫生健康委员会医政医管局搭建的政府数据库，包括医院质量监测系统（HQMS）和国家医疗质量管理与控制信息网（NCIS）的全国医疗质量数据抽样调查。
1.HQMS囊括了全国31个省级行政区域的二级和三级医院的病案首页信息。本年度报告中分析了2016年1月1日至2019年12月31日病案首页中出院诊断编码在I60～I69（脑血管病）和G00～G99（神经系统疾病）范围内的神经系统重点病种。该数据库通过医院病案首页信息，可以监测神经系统疾病不同病种的平均住院日、次均费用、在院病死率等重要结局指标。通过纵向数据可以展示医疗质量的纵向变化趋势，为卫生政策等制定提供科学数据支撑。本报告中来源于此数据库中的相关部分，均标注数据库简称：HQMS数据库。
2.NCIS全国医疗质量数据抽样调查覆盖了全国31个省级行政区域的二级和三级医院，通过医疗质量调研问卷采集数据。本年度报告中分析了2019年神经外科、神经重症和神经介入等神经系统疾病亚专业的单病种和治疗技术的医疗质量信息。本报告中来源于此数据库中的相关部分，均标注数据库简称：NCIS数据库。
由国家神经系统疾病医疗质量控制中心搭建的医疗质量信息平台，神经系统重点单病种，如脑血管病、癫痫等医疗质量指标，尤其是过程指标通过信息平台采集。
1.全国2790家医院通过中国卒中中心联盟（CSCA）数据平台连续上报急性脑血管病（脑梗死、脑出血、蛛网膜下腔出血、短暂性脑缺血发作）病例。该数据库对脑血管病医疗服务过程指标进行采集，与行政数据库互为补充，比较完整地反映了医院的医疗服务全过程的规范程度。本报告中来源于此数据库中的相关部分，均标注数据库简称：CSCA数据库。
2.癫痫及癫痫持续状态的医疗质量控制指标通过癫痫质量控制指标体系上报平台进行信息采集。2017年6月起，在国家卫生健康委员会医政医管局指导下，由国家神经系统疾病医疗质量控制中心牵头启动了癫痫质量控制指标体系建设，经过三年不断发展，该体系现已纳入全国31个省、市、自治区的127家医疗机构。2020年，通过组织癫痫亚专科内、外科专家及神经重症质控专家对既往癫痫医疗质量控制指标进行补充和修订，确定了10项癫痫内外科质控指标及惊厥性癫痫持续状态质控指标。该指标被纳入《神经系统疾病医疗质量控制指标（2020年版）》，于2020年1月由国家卫生健康委员会办公厅印发全国各级卫生健康行政部门相关专业质控中心和医疗机构，以期在全国层面进一步推进多学科全方位的优质癫痫专科医疗服务。目前癫痫质量控制指标体系建设已拓展到神经内科、神经外科、神经重症及神经病理四大专业，纳入了上述127家哨点医院的门诊及癫痫住院患者的信息。这一工作填补了我国癫痫患者各方面医疗质量信息的空白，提供了医疗服务过程中的可靠数据，并有力地推动了癫痫规范诊疗的进一步提高。尽管受到新型冠状病毒肺炎疫情冲击，但在2020年，癫痫医疗质量控制体系建设仍然稳步发展，截至2020年12月31日，年度累计上报癫痫住院患者病例5239例，较2019年同期增长75.57%。这提示了基于平台的癫痫医疗质量控制上报体系的可靠性及可持续性。本报告中来源于此数据库中的相关部分，均标注数据库简称：癫痫数据库。