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各受检部位进行MRI检查时需要选择合适的成像技术，包括对成像序列、序列的成像参数、扫描方位等的选择。T 1 加权成像序列、T 2 加权成像序列和质子加权成像序列是临床常规的成像技术，具体参数的选择可以参考相关著作。随着MRI技术的进步，针对不同的临床需求，提出了很多有针对性的成像技术，如脂肪抑制、化学位移成像等。
化学位移成像基于脂肪和水分子中质子的化学位移效应，也被称为同相位/反相位成像。由于分子结构的不同，脂肪的质子进动频率低于水分子的质子进动频率。在射频脉冲激发后，由于脉冲的聚相位效应，水分子中和脂肪中质子处于同一相位。射频脉冲关闭后，由于水分子的质子进动频率略高于脂肪中的质子，两者的相位将逐渐开始离散，到某个时刻，两种质子的相位相差180°，如果组织中同时含有这两种质子，那么此时采集到MR信号相当于这两种组织信号相减的差值，称为反相位图像。过了这一时刻后，相位差逐渐缩小，直至质子的相位差为零，此时采集到的MR信号为这两种组织横向磁化分矢量叠加的信息，被称之为同相位图像。临床上多采用扰相GRE T 1 加权序列，可很容易获得反相位和同相位图像。化学位移成像技术多用在腹部脏器中检查中，如肾上腺病变的鉴别诊断，因为肾上腺腺瘤中常含有脂质，在反相位图像上信号强度常有明显降低，利用化学位移成像技术判断肾上腺结节是否为腺瘤的敏感性约为70%～80%，特异性高达90%～95%。利用化学位移成像技术还有助于脂肪肝、肾脏或肝脏血管平滑肌脂肪瘤的诊断和鉴别诊断。
脂肪抑制是MRI检查中非常重要的技术，脂肪组织不仅质子密度较高，且T 1 值很短（1.5T场强下为200～250ms），T 2 值较长，因此在T 1 加权图像上呈现很高信号，在T 2 加权图像上呈现较高信号。T 1 加权图像上除脂肪外，含蛋白的液体、出血均可表现为高信号，脂肪抑制技术可以判断是否含脂，为鉴别诊断提供信息，还可以减少运动伪影、化学位移伪影或其他相关伪影；抑制脂肪组织信号，增加图像的组织对比；增加增强扫描的效果。
MRI设备可采用多种技术进行脂肪抑制，不同场强的MRI设备应采用不同的技术，同一场强的扫描机也可因检查的部位、目的或扫描序列的不同而采用不同的脂肪抑制技术。频率选择饱和法是最常用的脂肪抑制技术之一，该技术利用脂肪与水的化学位移效应，在成像序列的激发脉冲施加前，先连续施加数个预脉冲，这些预脉冲的频率与脂肪中质子进动频率一致，这样脂肪组织的将被连续激发而发生饱和现象，而水分子中的质子由于进动频率不同不被激发。这时再施加激发射频脉冲，脂肪组织因为饱和而不产生信号，而水分子中的质子被激发产生信号，从而达到脂肪抑制的目的。频率选择反转脉冲脂肪抑制技术是一种超快速梯度回波成像序列，既考虑了脂肪的进动频率，又考虑了脂肪组织的短T 1 值特性。其方法是在真正射频脉冲激发前，使用窄带宽的预脉冲进行激发，中心频率为脂肪中质子的进动频率，该脉冲略大于90°，这样脂肪组织将出现一个较小的反方向纵向磁化矢量，预脉冲结束后，脂肪组织发生纵向弛豫，其纵向磁化矢量将发生从反向到零，然后到正向并逐渐增大，直至最大值（平衡状态）。由于预脉冲仅略大于90°，从反向到零需要的时间很短，如果选择很短的T 1 （10～20ms），采集时间仅略有延长。
MR扩散加权成像是一种能检测活体组织内水分子扩散运动的无创性方法。扩散（diffusion）是指分子热能激发而使分子发生一种微观、随机的平移运动并相互碰撞，也称分子的热运动或布朗运动。为了反映组织的水分子扩散情况，在某个方向上施加扩散敏感梯度场，如果在该方向上有位置移动的质子，这些质子将经历磁场强度的变化，进动频率也随之发生变化，从而造成相位离散，引起质子信号的衰减。由于只有在施加扩散敏感梯度场方向上的运动才有相位的变化，DWI所反映的水分子扩散运动具有方向性，通过施加多个方向的扩散敏感梯度场，可以全面地检测出水分子在各方向的扩散运动。场强在1.0T以上的MRI设备多采用单次激发SE-EPI序列进行DWI，如果不施加扩散敏感梯度场将得到T 2 加权图像，施加扩散敏感梯度场将得到DWI。根据需要可在层面选择方向上施加扩散敏感梯度场，也可在层面选择、频率编码及相位编码方向上都施加。该序列TR为无穷大，因此剔除了T 1 弛豫对图像对比的污染，根据需要和软硬件条件，TE一般为50～100ms。