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流行性感冒病毒（influenza virus）简称流感病毒，包括人流感病毒和动物流感病毒。人流感病毒是人流行性感冒（流感）的病原体，分为甲（A）、乙（B）、丙（C）三型；其中甲型流感病毒抗原性易发生变异，曾多次引起世界性大流行。在流感流行季节之前对人群进行流感疫苗预防接种，可有效减少接种者感染流感机会或减轻流感症状。其治疗以对症治疗和预防继发性细菌感染为主。奥司他韦（oseltamivir）可以选择性抑制甲型流感病毒的神经氨酸酶活性。利巴韦林、干扰素具有广谱的抗病毒作用。
甲型流感病毒除感染人类以外，还可感染禽、猪、马等动物；乙型流感病毒可感染人和猪；而丙型流感病毒只感染人类。流感病毒多呈季节性广泛流行，北方以冬季为主，南方四季都有发生，在夏季和冬季达到高峰。传染源主要是感染者，其次为隐性感染者，感染的动物亦可传染人；主要传播途径是经飞沫、气溶胶通过呼吸道在人间传播。人群普遍易感，潜伏期长短取决于侵入病毒量和机体免疫状态，一般为1～4d。病毒感染呼吸道上皮细胞后，患者出现畏寒、头痛、发热、浑身酸痛、鼻塞、流涕、咳嗽等症状。在症状出现的1～2d内，病毒随分泌物大量排出，以后则迅速减少。流感发病率高，但病死率低，死亡病例多见于伴有细菌性感染等并发症的婴幼儿、老人等。
在流感流行期间，根据典型临床症状可以初步诊断，但确诊或流行监测必须结合实验室检查，主要包括病毒分离与鉴定和快速诊断方法。
（1）病毒的分离与鉴定是人流感确诊的金标准，但病毒分离的实验条件要求高，加之其有高致病性的危险，最好在生物安全3级及3级以上的国家指定实验室进行。
（2）快速诊断采用间接或直接免疫荧光法、ELISA检测病毒抗原。病毒抗原检测主要用荧光素标记的流感病毒特异性抗体，检查患者鼻黏膜涂片或呼吸道脱落上皮细胞涂片中的病毒抗原，或用单克隆抗体ELISA检查患者呼吸道脱落上皮细胞或咽漱液中的病毒颗粒或病毒抗原，可于24～72h内辅助诊断。另外，用RT-PCR、核酸杂交或序列分析等方法检测病毒核酸有助于快速诊断。
副流感病毒（parainfluenza virus）根据抗原构造不同分为5型，其中1、2、3型副流感病毒是感染人类的主要型别。病毒通过人与人之间直接接触或飞沫传播，首先在呼吸道上皮细胞中增殖，一般不引起毒血症。副流感病毒可引起各年龄段人群的上呼吸道感染，并可引起婴幼儿及儿童发生严重的呼吸道疾病，如小儿哮喘、细支气管炎和肺炎等。儿童感染的潜伏期尚不清楚，成人感染潜伏期为2～6d，感染1周内可以有病毒排出。自然感染产生的sIgA对再感染有保护作用，但只能保持几个月，因此再感染多见。实验室诊断主要通过细胞培养分离鉴定病毒，或用免疫荧光检查鼻咽部脱落细胞中的病毒抗原等方法。尚无特异性有效药物与疫苗。
腺病毒（adenovirus）分为A～G共7组，42个血清型；多数可以引起人类呼吸道、胃肠道、泌尿道及眼部感染。腺病毒主要通过呼吸道传播，3、7、11、14、21型等主要引起婴幼儿肺炎和上呼吸道感染；其中3型和7型腺病毒为腺病毒肺炎的主要病原。此外，3、7、14型可以引起咽结膜热，8、19、31型可以引起流行性角膜炎，40、41型可以引起儿童病毒性胃肠炎。腺病毒肺炎占病毒性肺炎的20%～30%，在北方多见于冬春两季，南方多见于秋季。由于缺乏腺病毒特异抗体，80%的腺病毒肺炎发生于6月龄至2岁的婴幼儿，潜伏期3～8d。多以骤热（39℃以上）、咳嗽、呼吸困难及发绀等呼吸道症状为主，有时出现嗜睡、惊厥、腹泻、结膜炎，甚至心力衰竭等。学龄前期与学龄期儿童的腺病毒肺炎以持续高热为主。根据流行病学资料和临床表现可初步诊断腺病毒肺炎。用间接免疫荧光技术、ELISA检测特异性IgM可以进行快速诊断，但不能进行腺病毒分型。常规咽拭子病毒分离及双份血清抗体检查可用于回顾诊断，以对症治疗为主，尚缺乏有效的抗病毒药物与疫苗。
呼吸道合胞病毒（respiratory syncytial virus）主要引起6月龄以下婴儿患细支气管炎和肺炎等下呼吸道感染，以及较大儿童和成人的鼻炎、感冒等上呼吸道感染。呼吸道合胞病毒感染流行于冬季和早春，传染性较强，主要经飞沫传播，或经污染的手和物体表面传播。病毒首先在鼻咽上皮细胞中增殖，随后扩散至下呼吸道，但不形成毒血症。潜伏期为4～5d，可持续1～5周释放病毒。其感染仅引起轻微的呼吸道纤毛上皮细胞损伤，但在2～6月龄的婴幼儿感染中，可引起细支气管炎和肺炎等严重呼吸道疾病。呼吸道合胞病毒所致疾病在临床上与其他病毒或细菌所致类似疾病难以区别，因此需要进行病毒分离和抗体检查，但操作复杂、费时。常用免疫荧光试验等直接检查咽部脱落上皮细胞内的呼吸道合胞病毒抗原，以及RT-PCR检测病毒核酸等进行辅助诊断。尚无特异性治疗药物和预防疫苗。
柯萨奇病毒（coxsackievirus）主要通过粪-口途径传播，但也可经呼吸道或眼部黏膜感染。其致病的显著特点是：病毒主要在肠道中增殖，却很少引起肠道疾病；不同的肠道病毒可引起相同的临床疾病，如散发性脊髓灰质炎样麻痹症、无菌性脑膜炎、脑炎、轻型上呼吸道感染等；同一型病毒也可引起几种不同的临床疾病。目前，尚无有效疫苗用于预防，也没有特效的治疗药物。
柯萨奇病毒是病毒性心肌炎常见的病因，散发流行于成人和儿童，新生儿病毒性心肌炎死亡率高。多数患者一般先有短暂的发热、感冒症状，或恶心、呕吐、腹泻等症状，继而出现心脏病的相应症状。
手足口病主要由A组柯萨奇病毒16型和肠道病毒71型引起。手足口病好发于6月龄至3岁的儿童，疾病的特点为手、足、臀部皮肤的皮疹和口舌黏膜水疱疹等，可伴有发热。手足口病的流行季节以夏秋季多见。
几乎所有的肠道病毒都可引起无菌性脑膜炎、脑炎和轻瘫。无菌性脑膜炎患者先出现的症状为发热、头痛和全身不适，然后出现颈项强直和脑膜刺激症状等。肠道病毒所致的无菌性脑膜炎几乎每年夏秋季均有发生。
疱疹性咽峡炎主要由A组柯萨奇病毒引起，以夏秋季节多见，患者主要为1～7岁儿童。典型症状是发热、咽痛，在软腭、悬雍垂周围出现水疱性溃疡损伤。
由于柯萨奇病毒所致疾病的临床症状和病毒型别均具有多样性，因此仅根据临床表现不能作出病因诊断，确诊必须依赖微生物学检查。标本可采集患者的咽拭、粪便、脑脊液等。一般是先用细胞培养分离到病毒后，再用中和试验进行鉴定和分型，这也是鉴定肠道病毒的常用方法，但敏感性较低。也可采用单克隆抗体建立的间接免疫荧光法检测病毒抗原，用ELISA方法检测抗病毒抗体，RT-PCR方法检测病毒核酸等进行快速诊断。
单纯疱疹病毒（herpes simplex virus）可致多种疾病，如龈口炎、角膜炎、结膜炎、脑炎、生殖道感染和新生儿感染等，可在神经元细胞建立潜伏感染，复发常见。单纯疱疹病毒有两种血清型，即HSV-1和HSV-2，两型的传播途径不同，HSV-1主要通过密切接触感染，而HSV-2则主要通过性接触传播或新生儿经母体生殖道感染，从而所致疾病的临床表现不同。人群中单纯疱疹病毒感染常见，密切接触和性接触是主要传播途径，病毒经破损皮肤黏膜进入人体。因此，要注意外阴及肛门皮肤黏膜受损时，应避免接触被污染的浴巾、污染的共用马桶圈等设施。阿昔洛韦、更昔洛韦等对生殖器疱疹、疱疹性脑炎和疱疹性角膜炎的疗效较好，但均不能清除潜伏状态的病毒或防止潜伏感染的复发。目前尚无疫苗。
主要临床表现为黏膜与皮肤的局部疱疹，潜伏期2～12d，病程持续2～3周。一般情况下，HSV-1经飞沫或直接接触唾液传播，原发感染较轻，10%～15%表现为显性感染，以腰以上部位感染为主，往往限于口咽部，全身感染少见，在免疫缺损的患者中才会侵犯多器官，如感染神经系统引起病毒性脑炎。HSV-2则以腰以下及生殖器感染为主，经性途径传播。但HSV-1和HSV-2感染途径及其分布也可交叉重叠。
原发感染后，如机体不能彻底清除病毒，病毒以非复制的状态潜伏在神经细胞中，持续终身。在潜伏期，原发感染灶附近检测不到病毒，对抗病毒药物不敏感。
当机体受非特异性刺激，如发热、寒冷、日晒、月经期、情绪紧张，或其他细菌、病毒感染，或短暂抑制细胞免疫时，潜伏病毒被激活，引起复发性局部疱疹，可表现为反复发作。复发期病毒排出，具有传染性。
刮取宫颈黏膜、皮肤、口腔、角膜等疱疹病损组织的基底部材料作涂片，用荧光素或酶标记抗体染色，检查细胞内单纯疱疹病毒抗原；标本亦可用Wright-Giemsa染色镜检，寻找细胞核内包涵体及多核巨细胞，均有益于病毒感染的诊断。
PCR或原位杂交技术检测标本中单纯疱疹病毒DNA，方法快速、敏感而特异；尤其是脑脊液标本的单纯疱疹病毒PCR检测被认为是诊断疱疹性脑炎的标准方法。
ELSA和间接免疫荧光法检测单纯疱疹病毒抗体。特异性IgM抗体阳性提示近期感染，特异性IgG抗体的检测常用于流行病学调查。
人类是人巨细胞病毒（human cytomegalovirus）的唯一宿主。人巨细胞病毒是引起先天性畸形的最常见病原。人巨细胞病毒在人群中的感染极为普遍，我国成人抗体阳性率高达60%～90%。原发感染发生在2岁以下，通常为隐性感染，仅少数人有临床表现。在机体免疫功能低下时易发生显性感染。感染后，多数人可长期带毒；潜伏病毒被激活可导致复发感染。人巨细胞病毒的传染源为患者及隐性感染者。病毒可长期或间歇从感染者的尿液、唾液、泪液、乳汁、精子及阴道分泌物排出。传播方式包括：①母婴传播，病毒可通过胎盘至胎儿，或产道和/或乳汁至新生儿；②接触传播，通过人-人密切接触，经口-口或手-口途径传播，幼儿园常见；③性传播；④医源性传播，包括输血和器官移植等。接触病毒后，潜伏期一般4～8周。目前，尚无安全有效的疫苗，可用高滴度抗人巨细胞病毒免疫球蛋白及更昔洛韦等联合治疗严重感染。
孕妇在孕期3个月内感染，病毒可通过胎盘引起胎儿原发感染，出现死胎或先天性疾病。先天性感染率为0.5%～2.5%，其中5%～10%的新生儿出现临床症状，有肝脾大、黄疸、血小板减少性紫癜、溶血性贫血及神经系统损伤。少数呈先天性畸形，如小头畸形和智力低下等，严重者可致流产和死胎，也有部分（10%）亚临床感染患儿在出生后数月至数年才出现智力低下和先天性耳聋等。
分娩时新生儿可经产道、母乳或护理人员感染。一般多无明显临床症状，尿液和咽分泌物中大量排出病毒，少数表现为短暂的间质性肺炎、肝脾轻度肿大、黄疸。多数患儿预后良好。
通常呈隐性，感染后多数可长期带毒，表现为潜伏感染，并长期或间歇排出病毒。少数感染者出现临床症状，表现为巨细胞病毒单核细胞增多症，出现疲劳、肌痛、发热、肝功能异常和单核细胞增多等症状，但嗜异性抗体阴性。临床症状较轻微，且并发症少见。
在免疫功能低下者中，原发感染或潜伏病毒的激活均可引起严重疾病，如肺炎、肝炎和脑膜炎等。其是导致艾滋病患者最常见机会感染的病原体之一，常导致视网膜炎。
收集咽喉洗液、尿液等标本，经离心后取沉渣涂片，Giemsa染色镜检。观察巨大细胞及包涵体。该方法简便，可用于辅助诊断，但阳性率不高。
常用标本是中段晨尿、血液、咽部和宫颈分泌物，接种于人胚肺成纤维细胞，培养4～6周后观察细胞病变，也可在玻片短期培养2～4d后，用免疫荧光或免疫酶联技术检测病毒早期抗原。
应用ELISA检测HCMV-IgM，可以帮助诊断人巨细胞病毒的近期感染，若从新生儿血清中查出HCMV-lgM，表示宫内感染。IgG检测可了解人群感染率，急性期和恢复期双份血清检测可用于临床诊断。
荧光定量PCR检测标本中病毒DNA拷贝数或用RT-PCR法检测病毒mRNA，可用于快速诊断。