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疑似大脑发育的问题，如脑瘫高危儿、缺氧缺血性脑病、早产儿、发育迟缓、头围异常、惊厥等都建议进行颅脑磁共振检查，颅脑磁共振具有B超、CT等检查不可替代的优势。B超检查是通过小婴儿未闭合的前囟进行颅内结构的扫描，缺点是对脑外缘部位的扫描存在盲区，优点是没有辐射。头部CT检查能够显示全脑结构，对出血性疾病显示清晰，缺点是仅为横断面平扫，分辨率偏低，针对脑发育方面疾病，如细微的脑间隙、脑白质、胼胝体病变无法确定，尤其是小于1cm的小病灶容易漏诊。
磁共振的优势是清晰度高，可以进行任意角度和方向成像，能够三维立体观察脑的结构，没有漏诊的情况出现，而且没有放射性辐射。磁共振是目前唯一能够在活体上无创性观察儿童脑白质正常发育过程的方法，为正常儿童脑白质的不同发育阶段及病理状态提供了有力的证据。特殊的磁共振技术还可以明确显示出广泛的脑白质损伤，甚至可以显示脑白质的走行，直观地反映出脑白质的发育与功能情况。利用功能性磁共振技术、脑地形图等技术，可以早期筛查、早期诊断先天性发育障碍性疾病。