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为达到质量要求所采取的作业技术和活动称为质量控制。辅助生殖技术实验室质量控制是为了维持配子及胚胎操作过程的一致性和稳定性而制定的一系列措施，是辅助生殖技术质量保障的基础。辅助生殖技术实验室质量控制管理可分为：一是严格的操作制度和管理制度，保证操作过程的规范和稳定；二是对接触配子/胚胎的耗材、培养基的质量控制试验，以决定是否使用这些耗材和培养基。
实验室技术人员必须做到令行禁止，严格遵守各项规章制度和SOP操作。此外，各个实验室还需制定相应的日常行为准则、人员培训、身份核对与确认等。
1.进入实验室必须按规定更换手术衣、帽子，并穿戴整齐，口罩应遮住口鼻，严格执行无菌技术操作。
2.不得将对胚胎有毒有害的物品带进实验室。进入培养室人员不得化妆、喷洒香水、染发等。
3.培养室内不允许倒退行走，避免相互碰撞，不可随意跑动或嬉闹，不可高声喧哗谈笑。胚胎培养室人员应让行于运送配子和胚胎的工作人员。
4.不得使用同一支吸管操作不同患者的配子和胚胎。
5.不得同时交接两份或两份以上的标本。
6.发现患者身份可疑或标本混乱时，必须立即停止操作，核实身份；混淆的标本、用品一律废弃，并立即上报。
7.未经患者知情同意，不得使用患者未受精卵、剩余配子/胚胎进行科学研究。
1.新进人员需接受系统的培训，并接受原国家卫生部指定医疗机构进行生殖医学专业技术培训。培训内容包括基本理论、专业知识和操作技能培训。对基本理论和专业知识，可按计划让其自行学习并接受相应考核；操作技能要从易到难逐渐学习，由高资质技术人员带教。
2.每项技术操作经考核合格后方可独立上岗。
3.对每个实验室人员制订切实可行的方案来衡量其工作表现和技术能力。
4.定期对不同人员之间的操作进行比较分析，如果其中一人表现低于实验室要求，应及时分析找出原因并给予指导纠正。
1.对每位患者的配子/胚胎进行严格编号，并在所用离心管、培养皿、吸管或移液管上标识夫妇姓名，并经另一名人员复核。
2.精子的接收和处理、取卵、授精、移植、配子/胚胎的冷冻与解冻等涉及配子/胚胎的操作必须双人核对，并在相应记录单上签名。
3.配子/胚胎冷冻时，冷冻载体上信息标志清晰可辨。详细记录冷冻、解冻信息，包括夫妇姓名、储存位置、冷冻时间、发育时期、胚胎数目以及冻存管数，并双人核对。
4.对于有传染病患者的配子/胚胎如不能做到封闭式冷冻，应分罐储存。
5.应建立相关技术电子化信息管理系统。
有效地管理实验室仪器设备，能够确保仪器设备的正常运行和使用，并满足相关技术规范的要求和标准。包括仪器设备安装、标志（正常使用、停用、报废）、校准与维护、规范化操作以及试剂耗材的质量控制等。
每台仪器设备建立一个档案，包括仪器的名称、编号、厂家、使用日期、使用说明、维修保养记录以及仪器的建议使用寿命。关键仪器设备实行专人管理，对仪器设备进行日常点检、定期维护保养，并做相应记录。对所有的仪器设备制作简易的操作流程和使用注意事项，并对使用人员进行培训。使用人熟练掌握仪器设备的性能和操作程序后，方可操作仪器。
实验室需配置UPS电源或备用电力设备，以保证突发断电情况下仪器设备无法运行。
定期对检测设备进行校准。如CO 2 测试仪、温度检测仪、pH仪、电子天平等。建议对关键设备，如培养箱、液氮罐等安装远程监控系统。
实验室环境的管理目的是使实验室空气质量等符合IVF实验室的要求，为胚胎的体外操作和发育提供相对安全稳定的环境。
1.每日工作完全结束后，对工作台面、地面进行清洁，可使用IVF专用清洁剂。地面采用湿式拖地或用湿毛巾擦地。
2.如工作台面或地面有污染，用IVF实验室专用的清洁消毒剂擦拭后用纯水擦拭，不建议使用酒精或者紫外线等可能会影响胚胎发育的清洁消毒方式。
3.每日清洗室内拖鞋。
4.每周一次大清洁，包括墙壁、吊顶等均需要彻底清洁。
5.每月对培养室进行空气细菌培养，并记录结果。
1.保证工作安全顺利开展的前提下，严格控制进入实验室的人员数。
2.仪器设备的摆放方便整洁，尽可能缩短使用的电源线。
3.实验室内不放置无关的物品，暂不使用的仪器移出实验室。
4.在实验室外拆开试剂耗材的大包装，仅将当天需使用的耗材带入实验室。
5.严格按照室内空气净化设备要求定期更换滤膜。
6.确保胚胎实验室保持正压。
7.定期更换实验室层流滤膜（高效滤膜、中效滤膜、回风口滤膜、新风口滤膜），并更换时间、更换滤膜类型、更换前滤膜处理状态等作好详细记录。
8.定期或实时监测室内空气质量，如发生异常，及时查找原因。
质量控制试验主要是指对IVF过程中使用的培养基、培养油以及各种接触性耗材所做的质量控制试验。常用的试验方法有人类精子存活试验和体外鼠胚试验，这两个试验作为人类体外辅助生殖技术用医疗器械生物评价，已经由国家食品药品管理局发布。其中人类精子存活试验适用于评价与配子/胚胎直接接触的培养液及器具/耗材类产品可能产生的毒性风险，体外鼠胚试验适用于与配子/胚胎接触的人类体外辅助生殖技术用医疗器械的安全性评价。
由于其取材方便，被应用于IVF实验室的质量控制试验。但由于精子的功能结构不同于卵子/胚胎，其敏感度与胚胎的相关性仍被质疑。
具体操作方法可参见国家食品药品管理局发布的《人类体外辅助生殖技术用医疗器械生物学评价——人精子存活试验》（YY/T 1535—2017）。
鼠胚试验在许多耗材、培养基毒性风险评价中具有临床意义。目前大多商品化培养基以及耗材给出的质量指标都是鼠胚试验结果。但鼠胚试验操作相对复杂，影响因素也较多，如小鼠的品系、鼠龄、获得胚胎的时间、胚胎的细胞数等都影响试验结果。
具体操作方法参见国家食品药品管理局发布的《人类体外辅助生殖技术用医疗器械生物学评价——体外鼠胚试验》（YY/T 1434—2016）。
安全管理是管理的核心。明确实验室潜在的风险，对风险进行评估并加以管控，将风险的发生概率降至最低。建立突发异常事件的应急措施。
1.水、电安全。IVF实验室多使用的大功率电器，电路的铺设要考虑用电负荷。定期组织电工、水工对全院的电路、水管、气管进行检修、维护、排查安全隐患。每天工作结束，检查水、电关闭情况，断开一切可以关闭的电器电源。配备双路电源或UPS电源，以防突发停电。
2.操作者安全。操作者要有自我安全防护意识，规范化操作，避免锐器刺伤、擦伤，液氮冻伤。
3.配子/胚胎的安全。一是污染的风险，体外培养污染的发生率为0.1%～1%，污染的来源：卵泡液、矿物油、精液，主要来源是精液。二是不同配子/胚胎混淆的风险，为杜绝混淆的发生，应建立严格的核对制度，涉及配子/胚胎的所有操作都必须严格执行双人核对，应建立相关技术电子化信息管理系统。。
4.对液氮储存罐安装自动报警装置，并定期添加液氮。
5.一旦发生事故或是错误，操作者不可擅自处理，或是隐瞒实情，应立即上报负责人。
要达到完善的质量控制，必须有详细的质量控制记录，记录每一个可能影响到IVF治疗结果的实验室变化因素，并及时检查各种记录的完整性和准确性。质量控制记录包括操作人员以及操作技术的变动，室内温湿度、空气质量等操作环境的变化，所用仪器设备的状态以及直接与配子/胚胎接触的培养基/耗材使用情况等。质量控制记录是质量控制分析的基础。
建立实验室关键绩效指标（key performance indicator，KPI），为每项结果设立限定值（上限、下限），以限定值变化进行质量控制和质量保障。如IVF受精率、卵细胞质内单精子注射（intracytoplasmic sperm injection，ICSI）受精率、卵裂率、囊胚形成率、冻融复苏率、临床妊娠率/种植率等。定期分析各项指标是否达到限定值，如出现异常，及时组织相关人员进行分析，查找原因。