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寻找新的非侵入性生物标志物有助于更准确的判断IgA肾病患者的当前组织学状态。podocalyxin是一种唾液黏蛋白，在足细胞、造血祖细胞、血管内皮细胞和神经元表达。podocalyxin位于足细胞的顶端膜上，在足细胞足突的形成和维持中起重要作用，足细胞损伤时podocalyxin脱落进入尿液，是足细胞损伤的特征之一。Kanno等检测了包括IgA肾病在内的多种儿童肾小球疾病患者的尿液podocalyxin水平，认为尿液podocalyxin水平是评估活动性肾小球损伤严重程度的有效生物标志物，可作为儿童急性毛细血管外病变活动的指标。有研究者根据Shigematsu分型来确定急性和慢性毛细血管外病变，发现成人IgA患者尿液podocalyxin水平与急性毛细血管外病变相关，但尿蛋白排泄与急性毛细血管外病变无关。因此，尿液podocalyxin水平可能是IgA肾病急性毛细血管外病变损伤的一个有效标志物。
megalin是一种分子量600 000的糖蛋白，是低密度脂蛋白受体家族的成员，在近端肾小管上皮细胞（renal proximal tubular cell，PTEC）的顶膜上高表达，在PTEC的内吞功能中起着重要作用。PTEC损伤的低分子量蛋白标志物，如α 1 -微球蛋白和β 2 -微球蛋白，被肾小球滤过，并通过megalin被PTEC重吸收。有研究观察了成人IgA肾病患者中尿液megalin水平与肾脏病理改变之间的关系，其结果提示尿液megalin、α 1 微球蛋白（α 1 -microglobulin，α 1 -MG）、β 2 微球蛋白（β 2 -microglobulin，β 2 -MG）和N-乙酰-β-D-氨基葡萄糖苷酶（N-Acetyl-β-D-glucosaminidase，NAG）与肾小管萎缩和间质纤维化无关，但尿液megalin水平与慢性毛细血管外病变及系膜细胞增生相关。megalin在肾小管而非肾小球表达，为何尿液中megalin与肾小球病变相关？有两种可能的机制：一方面，肾小球病变引发了肾小管间质损伤，从而导致了megalin从损伤的肾小管进入尿液，这可能是由于足细胞-肾小管间的作用介导的；另一方面，IgA肾病的肾小管损伤可能加重了肾小球病变，并导致肾小球硬化。megalin能否作为IgA肾病的有效标志物还需进一步验证。