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（1）正常出生时阴茎长度>2cm，真正的小阴茎极为罕见，但却是先天性垂体功能低下的重要体征之一。男婴几乎都有包茎。注意有无尿道下裂。阴茎小伴发育不良和隐睾应注意是否存在Prader-Willi综合征。
（2）观察阴囊的颜色，如呈蓝紫色多提示存在睾丸扭转。足月儿阴囊皱褶发育良好，阴囊光滑多提示新生儿发育未成熟。睾丸是否在阴囊内，早产儿的睾丸常未下降，有无腹股沟疝和鞘膜积液。
（1）足月女婴最显著的是大阴唇增大。阴道分泌物通常是乳白色黏稠的。
（2）假月经：部分女婴于生后5~7天，阴道流出少许血性分泌物，是母亲雌激素中断所致，可持续约1周。
（3）阴唇融合而阴蒂增大，应考虑肾上腺皮质增生。
检查有无肛门闭锁、肛裂。足月儿生后48小时内应排胎便，早产儿可有胎便排出延迟。