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冻存自体脐血造血干细胞是指将婴儿出生时脐带血干细胞冻存于-196℃液氮中，保存在脐带血库。从技术上来讲，脐血造血干细胞冻存20年以上不存在任何问题，因为美国纽约脐血库的学者发现冻存20年以上的脐血可以在小鼠体内重建正常的造血和免疫功能。需注意的是自体脐带血冻存需要每年交纳一定的保存费用。自体脐带血干细胞用途包括婴儿在成长过程中发生血液系统疾病（如：白血病、重型再生障碍性贫血、淋巴瘤等），有造血干细胞移植指征时，采用自体脐带血作为干细胞来源不失为一种安全有效的治疗选择。然而，自体脐带血移植不能用于治疗遗传性疾病，而且随着儿童成长、体重增加，冻存的自体脐带血细胞数量不能满足其移植的需要。目前关于自体脐血保存的意义，学术界尚存在一定的争议，因此，患者应该根据自己的实际情况决定是否冻存自体脐血造血干细胞，必要时可以向有经验的移植专家咨询。
骨髓造血干细胞和外周血造血干细胞的选择是一个颇具争议的话题。与骨髓移植相比，外周血造血干细胞移植具有以下优点：①移植后造血和免疫功能重建快，移植的费用/效益比优于骨髓；②外周血造血干细胞采集对供者来说更安全；③对于自体骨髓移植而言，自体造血干细胞移植时采用外周血干细胞，可以使采集受到肿瘤细胞/白血病细胞污染的机会更小；④外周血造血干细胞移植具有更强的抗白血病效应。然而，外周血造血干细胞移植也存在一些缺点：①移植后Ⅲ～Ⅳ级急性移植物抗宿主病的发生率高于骨髓移植；②慢性移植物抗宿主病的发生率也高于骨髓移植。因此，如果患者所患的疾病移植后复发的危险性不大，那么建议选择骨髓造血干细胞；如果患者所患的疾病移植后复发的危险性很大，建议选择外周血干细胞。最近，北京大学血液病研究所的资料证实在单倍型相合移植中，粒细胞集落刺激因子动员的骨髓和外周血造血干细胞混合移植疗效优于单纯外周血造血干细胞移植，因此该中心临床常规应用骨髓和外周血造血干细胞混合移植治疗各种血液系统疾病。当然，我们还需要更多的临床研究去证实到底哪种造血干细胞来源更好。骨髓造血干细胞？外周血干细胞？还是其他。
要想正确选择造血干细胞来源，一定要咨询有丰富经验的移植医师。
造血干细胞移植物中含有多种细胞，这些细胞回输到患者体内发挥不同的作用，具体如下：①CD34 + 造血干细胞回输后在患者骨髓微环境中增殖、分化为各类的造血和免疫细胞，包括粒细胞、红细胞和血小板等。②T细胞和自然杀伤细胞是移植物中促进造血干细胞植入和发挥抗白血病作用的主要效应细胞，也是导致移植物抗宿主病发生的主要效应细胞。③调节性T细胞等免疫调节细胞：可以调控免疫效应细胞、防止移植后抗宿主病发生的主要细胞亚群。④移植物中的内皮祖细胞和间充质干细胞等细胞，可以参与辅助造血干细胞植入等。