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HLA高分辨分型有两层含义。一是抽取移植患者和健康捐献者的静脉血样本，提取DNA，应用聚合酶链反应测定HLA位点的基因序列；二是利用基因测序技术（二代测序技术）测出各自DNA碱基的顺序，最后通过软件比对分析得出HLA型别。HLA高分辨分型技术是世界卫生组织（WHO）认定的HLA分型标准。分型的作用就是尽最大可能找到排列一致的样本，配型的精度决定了患者造血干细胞移植后的临床疗效和生存质量。多数学者认为决定造血干细胞移植治疗成本的关键步骤是如何快速、准确地找到与患者HLA配型一致的造血干细胞健康供者。
与HLA相合同胞供者中寻找供者的概率25%～30%相比，在无亲缘关系人群中找到HLA相合供者的概率是1/100000～1/50000，甚至更低，其寻找过程耗时较长而应用受限。对于脐血造血干细胞移植而言，由于脐血移植对HLA配型的要求不太严格，HLA 4～6个位点相合的无关供者脐血造血干细胞都可用来移植，而脐血有核细胞数量要在2.7×10 7 /kg，近年来考虑到双份脐血移植的成功实施，因此对于存量10万份以上的脐血库而言，能找到供者的概率为60%左右。这些造血干细胞移植的新进展使患者有更多的机会选择供者和/或干细胞来源。