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HLA也称为人类主要组织相容性复合物，位于人类第6号染色体短臂远端（6p21）；其中，HLA-A、HLA-B和HLA-Cw称为HLA-Ⅰ类抗原；HLA-DRB1、HLA-DQB1和HLA-DPB1称为HLA-Ⅱ类抗原。目前，造血干细胞移植之前主要进行HLA-Ⅰ、HLA-Ⅱ类抗原配型，即HLA-A、HLA-B和HLA-DR位点配型。HLA中任一位点配型结果均由一对等位基因所编码的抗原所组成，如HLA-A*0202，HLA-*1904，其中HLA-A*02，HLA-*19表示血清学特异性，称为HLA低分辨配型；HLA-A*0202，HLA-*1904表示DNA等位基因亚型，即称为HLA高分辨配型。