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中药之性味与植物分类具明显之相关性，性味又与中药之作用相关，因而植物分类与中药之临床效用明显联系，欲了解每味中草药之临床应用，就必须从它的植物分类入手。常用中药见于如下之科属：①伞形科：羌活、独活、防风、白芷、柴胡、前胡、胡荽、藁本、当归、川芎等；②菊科：蒲公英、败酱草、紫菀、款冬花、野菊花、菊花、青蒿、牛蒡子、苍耳子、豨莶草、漏芦、茵陈、佩兰、苍术、白术、大小蓟等；③百合科：玉竹、黄精、知母、贝母、山慈菇、天冬、麦冬、葳蕤、百合、土茯苓等；④唇形科：黄芩、夏枯草、紫苏、薄荷、藿香、益母草、丹参、泽兰等；⑤蓼科：大黄、土大黄、何首乌、扁蓄等；⑥毛茛科：黄连、附片、乌头、丹皮、白芍、赤芍、威灵仙等；⑦豆科：黄芪、山豆根、赤小豆、白扁豆、甘草、苦参、葛根、补骨脂、芦巴子等；⑧蔷薇科：桃仁、杏仁、山楂、玫瑰、木瓜、香橼、佛手、仙鹤草等。
上述列举8个科属之常用中药，现分析如下：
伞形科中药中柴胡、前胡、羌活、独活、白芷、防风、胡荽、藁本均系传统之祛风湿药，具有明显之解表去痛功效；惟当归、川芎为传统之补血活血药。细考其作用，在传统治头痛方药中恒加当归、川芎两味，盖颠顶之上惟风能至，二药既善治头痛，亦可谓祛风也，古有“治风先治血，血行风自灭”之谓，说明二药既同属伞形科，则与其他该科成员当具一定共同性。
菊科中药中蒲公英、败酱草、野菊花、菊花、青蒿、牛蒡子、漏芦、茵陈、大小蓟、豨莶草等均具清热解毒作用，说明菊科中草药之主要作用是清热解毒。苍术、白术、苍耳子、佩兰等四药虽非传统之清热解毒药，但经现代药理学研究，苍耳子对金黄色葡萄球菌有强大之抑制作用；苍术中提取出烯内酯Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ均有强大之抑菌消炎作用；白术挥发油对食管癌、艾氏腹水癌均有明显之抑制作用；佩兰对肠道感染具明显临床疗效，经实验研究证明该药对肠道病毒具有较强的抑制作用。上述研究说明，苍术、白术、苍耳子、佩兰虽非传统之清热解毒药，但其药理作用亦包括清热解毒。
百合科中药玉竹、黄精、知母、葳蕤、百合、天冬、麦冬均为传统之补阴药。贝母、山慈菇、土茯苓虽非传统之补阴药，但贝母具清热、润肺、化痰之功；土茯苓属清热解毒之大剂，山慈菇清热软坚。诸药均具清热之效，热易伤阴，热清之，则阴可复耶，故亦寓养阴、补阴之效矣！
唇形科中药黄芩、薄荷、夏枯草均具清热泻火之效，为传统之清热泻火或清热解毒方药。藿香、紫苏虽然不属传统中药之清热类，但藿香除对胃肠道有调节功能外，经现代实验研究证明该药对肠胃真菌亦具明显抑制作用，同时对钩端螺旋体、鼻病毒均具抑制作用；紫苏则除止咳化痰、解表清热之功能外，经现代实验研究对金黄色葡萄球菌、痢疾杆菌均具明显之抑制作用。益母草、丹参、泽兰三药均具活血化瘀之效，丹参清热、益母草消肿、泽兰解毒皆寓泻火之效，据近代实验研究，三药均有不同程度的抑菌作用，由此说明唇形科中药均具直接或间接之清热泻火作用。
蓼科植物大黄、土大黄、何首乌、扁蓄均具泻火利湿之效，惟何首乌除清热解毒外尚兼补血填髓之功。豆科植物黄芪、补骨脂、葛根、芦巴子、白扁豆，或补气，或补阳，或益精，或升阳；苦参一味虽属清热燥湿之剂，但现代药理学研究其具有明显升白作用，亦寓补气之功效。蔷薇科植物桃仁、杏仁、山楂、玫瑰、木瓜、香橼、佛手、仙鹤草均具行气活血功效，其中杏仁止咳、山楂消食、木瓜利湿、仙鹤草止血益气，乃同中之异也。上述各科中药大体亦具同科同用之原则，所不同者乃科同而属目各异，此同中有异之故也。
惟毛茛科之各种中药功效之差异较大，附片、乌头大热而壮阳；黄连大寒而泻火；丹皮、赤白芍活血而清虚热；威灵仙则为传统之祛风湿药，现代研究对病毒有巨大之抑制作用。此科之中草药尚未发现明显同科同用之规律，应作为今后探讨之重点。