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在《天体运行论》出版的同年，1543年，另一本具有重要意义的书也出版了，那就是安德烈·维萨里（Andreas Vesalius，1514—1564）的《人体构造》（ The Fabric of the Human Body ）。
维萨里的一个英国学生约翰·卡尤西（John Caius，1510—1573）原名约翰·凯斯（John Kays），他从意大利回国后，把姓氏拉丁化了。他并不认同老师维萨里的理论，而是坚持盖伦的解剖学没有错误。当时的英国医学落后，到外国留学是很多人的追求。卡尤西得到了帕多瓦大学的学位后，回英国从事内科医生职业，他是英国玛丽一世（MaryⅠ，1516—1558）、伊丽莎白一世（ElizabethⅠ，1533—1603）的御医，并长年担任英国内科学院（College of Physicians）的主席。
英国内科学院是由托马斯·利纳克尔（Thomas Linacre，1460—1524）创建的。利纳克尔于1496年毕业于帕多瓦大学，同样是盖伦医学的信徒。从意大利回国后，他担任过亨利七世（HenryⅦ，1457—1509）、亨利八世（HenryⅧ，1491—1547）的御医。在亨利八世的许可下，他于1518年建立了英国内科学院这一医学监察机构，并于1523年正式运行。英国内科学院拥有很大的权力，如果想在伦敦地区行医、开设药店，必须有它的许可，否则会被罚款或监禁。不过，牛津大学和剑桥大学（利纳克尔的母校）的毕业生却不受限制。
卡尤西作为利纳克尔的忠实继承者，一生都在维护内科学院的利益。1546年，卡尤西成为理发师与外科医生协会（United Company of Barbers and Surgeons）的解剖演示官。当时，官方每年会给这一协会四具被处决罪犯的尸体，而卡尤西立刻协调，使内科学院也得到了这一待遇。而且，他一直致力于获得整个英国的医师执业许可权力，而不仅仅是伦敦。卡尤西在任期间，积极打击无证从医、江湖游医、巫术治疗、女药剂师等，并且，打击那些批评盖伦医学的人。
1617年，詹姆斯一世给予许可，药剂师协会从杂货商行会（Grocers′Company）中分离出来。1618年，英国内科学院组织出版了一部伦敦药典，并被政府赋予官方地位，不按药典要求制备药品是违法行为。这是英国近代第一部正式药典。不过，药典的第一版错误太多，所以很快又收回修订，到第二年12月才重新面世。
苏珊·里夫·莱昂（Susan Reeve Lyon）是伦敦著名的女药剂师，她结过两次婚，并在第一任丈夫去世后，独自经营药店，资历很深。虽然药剂师协会不允许女从业者，但允许药店所有者去世后，其遗孀经营药店。莱昂再婚后，仍得到继续经营药店的许可，不过，内科学院于1632年起诉她，说她不应把药卖给无证的医生，因为她的客户中，有两名医生是从莱顿大学毕业的，尚未得到内科学院的许可。
尼古拉斯·卡尔佩珀（Nicholas Culpeper，1616—1654）因为极为喜爱草药、植物，所以在16岁时从剑桥大学退学，转而进入药店当学徒，后来自己开了一间药店。卡尔佩珀曾代表药剂师协会抗议内科学院对医学执业权的垄断。并且，他本人还出了本书《英国内科医生》（ The English Physitian ）。不过，因为他免费为病人看病赠药，结果药剂师协会反而与他产生冲突。他一气之下进入军队，作为军队外科医生参加了英国内战并负伤。1655年，卡尔佩珀关于星相医学（占星术在医学、草药方面的应用）的遗作出版，成为星相医学的代表作。
1665年伦敦鼠疫暴发，查理二世带头离开伦敦避难。因为内科医生们如托马斯·西德纳姆，大部分也离开了伦敦，所以药剂师们一度获得了治疗病人的权力，他们被称为“鼠疫医生”（plague doctors）。不过，药剂师的这一权力并未正式化。
1701年，药剂师威廉·罗斯（William Rose）为一名病人看病，收费50英镑，结果病人不满意，就向内科学院举报他非法行医。药剂师协会与罗斯积极反诉病人与内科学院，于1704年获得了胜利，从此药剂师也获得了治疗病人的权利。1816年，《药剂师法案》出台，赋予了药剂师协会更大的权力。
1864年，第一版《英国药典》（ British Pharmacopoeia ）依据1858年的医学法案正式出版。