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1．注重选药 医生除了根据病情选药外，还会根据药物疗效、不良反应、药物代谢动力学特征等来选药。一般会优先选择疗效好、安全范围广、不良反应小、临床应用时间久的经典药物。选择新药需要特别谨慎，如抗癫痫药物中的苯丙氨酯，虽然研究证实对成人癫痫安全有效，但是可能会导致儿童肝坏死和再生障碍性贫血。
2．适当用药 由于批量小、成本高等特点，厂家生产儿童用药的积极性不高，导致目前专门的儿童用药相对较少，儿童用成人药的现象比较普遍。成人药物剂型多，用于儿童问题也多，例如剂量难把握、儿童抗拒服用等。在有选择的情况下，儿童用药应该选择适合儿童的剂型，例如口感好的混悬液、颗粒剂、糖浆剂、片剂等。
3．适宜的给药途径 儿童常用的给药途径有雾化吸入、口服、肌内注射、静脉注射、静脉滴注、皮下注射、直肠给药等。医生经过专业判断，在口服药能满足治病需求的情况下，会尽量优先选择口服药物治疗；若病情危重或存在不宜口服的情况，则采用其他给药途径。
4．个体给药 儿童尤其是新生儿和婴幼儿，由于其参与药物代谢、排泄的器官如肝脏、肾脏发育不完全，药物在体内的半衰期与成人有较大差异，因此，医生会根据儿童的年龄、体重等因素选择适宜的给药频次。