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（1）与平行对照试验相比，单组试验存在非同期对照偏倚，不能抵消某些非处理因素对结果的影响，在开展单组试验时，需要对可能存在的选择偏倚、混杂偏倚、测量偏倚和评价偏倚进行全面分析和有效控制。保证所选目标值的纳入标准、排除标准、诊断标准、疗效评价标准等因素与单组试验保持一致。
（2）单组试验目标值法的使用应当基于对疾病及其治疗方法充分的了解的基础上，而且在设置对照在客观上不可行时（如患者有强烈的选择意愿）开展，比如到针灸科或者推拿科寻求治疗痛经的患者并不希望接受止痛药物的治疗。
（3）由于没有设置平行对照组，单组目标值设计的临床试验一般不进行干预措施优效、等效或非劣效的评价，仅用于评价干预措施的有效性/安全性是否达到专业领域内公认的平均水平/最低标准，即如果目标值选用的是总体参数性质的平均水平，则评价的是干预措施的有效性/安全性是否达到行业平均水平。如果目标值选用的是单侧置信区间的上限/下限，则评价的是干预措施的有效性/安全性是否达到目前行业的最低标准。如果在目标值的可信度较高而且应用非常广泛的时候（非常稳定的目标值，可以看作总体参数）也可以通过设置临床有意义的界值进行优效、等效或非劣效的设计。因此，在开展中医药研究时，可以采用单独使用中医药疗法的单组试验，目标值可以选用西医常规的疗效标准作为对照，观察中医药疗法是否能够作为一种替代疗法达到西医常规治疗的效果，也可以中西医联合干预与西医常规治疗的目标值进行比较，观察中医药药疗法作为一种补充疗法效果的评价。