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2001年，经国务院批准，外汇储备经营进一步明确了决策授权体系，确保了外汇储备管理与货币政策执行、国民经济宏观管理的协调一致，也保障了外汇储备经营管理工作的高效运转；引入投资基准管理模式，围绕投资基准进行投资决策，不断规范外汇储备经营活动。
2001年底加入世界贸易组织后，我国加速融入全球经济，对外开放进一步扩大，国际收支持续大额顺差，对国民经济影响日益增强。
适应新形势新挑战，外汇管理体制改革向纵深推进，积极促进贸易投资便利化，稳步推进资本项目可兑换，加强跨境资金流动管理，健全国际收支统计监测，完善外汇储备经营管理。
伴随着入世后外汇储备规模的较快增长，2001年，外汇储备经营以规范化、专业化和国际化为目标，建立了投资基准经营管理模式和风险管理框架，完善了大规模外汇储备经营管理的体制机制。
投资基准就是确定了货币、资产、期限和产品分布的结构和比例，作为投资管理过程中衡量某项资产或投资组合构成和收益的重要参照指标。
在按照投资基准经营的同时，也允许经营人员对基准进行适度偏离，积极捕捉市场机会，在既定风险下创造超出基准的收益。
除了国家外汇管理局直接利用外储进行对外投资外，我国还通过以外汇储备支持设立主权财富基金中国投资有限责任公司、参与创建全国社保基金以及向国有商业银行注资等方式，形成了国家外汇储备投资格局多元化局面。
2005年7月21日晚，我国再次宣布进行人民币汇率形成机制改革，从单一盯住美元改为实行以市场供求为基础，参考一篮子货币进行调节、有管理的浮动汇率制度；货币兑换起始水平从8.2765元人民币/美元调整为8.11元人民币/美元。
同时，实施一系列配套外汇管理政策，包括提高经常项目外汇账户限额；提高个人因私购汇指导性限额和简化手续凭证；扩大银行为客户办理远期结售汇业务和开办人民币与外币掉期交易；调整银行挂牌汇率管理；并加强外汇政策的宣传和培训。
这些举措为改革开放后新时期的企业、银行逐步适应市场汇率波动的变化创造了条件。
2005年7月启动的人民币汇率形成机制改革为深化外汇管理体制改革注入新的活力。企业和个人持有和使用外汇的政策更加便利，外汇市场加快发展。
与此同时，外汇管理方式加快从重点管外汇流出转为流出入均衡管理，逐步建立起资本流动双向均衡管理的制度框架，在2008年新修订的《外汇管理条例》确立了均衡监管思路，并在行政法规层面明确取消了强制结售汇制度。
2007年9月29日，为了加强外汇储备投资的多样性、分散投资风险，中国成立中国投资有限责任公司。公司主要投资于股权、固定收益、对冲基金、私募市场、大宗商品市场和房地产投资等另类资产。中投公司购买了包括百事通、摩根士丹利等一些公司的部分股权。
2008年9月，国际金融危机全面爆发，我国及时启动应急机制，做好国际收支逆转的应急预案，积极防范金融风险，确保了外汇储备资产的总体安全，顶住了国际金融危机的冲击。
2009年后，针对跨境资金流向复杂和规模增大、市场主体便利化需求不断增长的现实，我国外汇管理加快了理念和方式的“五个转变”，即从重审批转变为重监测分析、从重事前监管转变为强调事后管理、从重行为管理转变为更加强调主体管理、从“有罪假设”转变到“无罪假设”、从“法无明文授权不可为”转变到“法无明文禁止即可为”。
2009年12月4日，国家外汇管理局发布的《外汇管理概览》指出，我国外汇储备管理进行多元化货币和资产配置。外汇储备经营始终坚持“安全、流动、增值”的原则，进行审慎、规范、积极的投资运作。外汇储备运用应遵循积极配合国家宏观经济综合平衡和重大发展战略的原则，确保外汇储备运用“安全、流动、增值”的原则，以及坚持依法合规、有偿使用、提高效益、有效监管的原则。
2010年1月初召开的全国外汇管理工作会议部署了2010年外汇管理工作重点，强调外汇管理工作将提升外汇管理服务经济发展的功能；改进跨境资本流动统计和监管，防范异常跨境资本流动风险；提高外汇管理透明度；完善外汇储备经营管理，保障外汇储备资产安全并取得合理回报。
2011年2月16日，国家外汇管理局发布《国家外汇管理局关于人民币对外汇期权交易有关问题的通知》，批准中国外汇交易中心在银行间外汇市场组织开展人民币对外汇期权交易。
总体来看，进入新世纪，我国外汇管理体制改革进一步深化，外汇管理的理念和方式加快转变，市场配置外汇资源的作用不断增强，对于促进外贸持续快速发展、引导资本有序双向流动、充分利用两个市场两种资源、服务实体经济发展等发挥了积极的作用。
同时，在国务院、中国人民银行、国家外汇管理局三级授权管理体系下，我国摸索实践出一条具有中国特色的外汇储备经营管理之路，在国际上树立了专业化的大型投资者形象，实现了外汇储备资产的安全、流动和保值增值，取得了相当不错的经营业绩。
首先，坚持专业化、规范化、国际化的发展建设。几十年来，我国外汇储备规模大幅增长，连续多年位居世界第一。
为了管好用好如此大规模的资产，外汇储备经营管理以“规范化、专业化、国际化”为目标，分阶段有序推进，从最初的摸索市场规律、开创经营模式、积累管理经验，到现在发展成为具有国际竞争力的资产经营管理机构。
资产配置以研究为驱动，建立了风险和收益综合优化的资产配置框架，发展完善了战略配置和战术配置体系。投资管理以投资基准管理模式为基础，围绕基准主动、灵活实施投资策略。
风险管理运用先进理念和技术，形成了逆周期的风险管理战略，风险管理框架、方法、工具和手段不断优化。
会计清算确保了外汇储备资产完整和安全，实现了交易清算、会计核算和业绩评估的高精准率。
信息化建设搭建了全球24小时连续运转的信息系统，建立了支撑前中后台全业务流程的信息化体系，确保信息安全。
加强机构队伍建设，培养锻炼了一支业务精良、朝气蓬勃、有战斗力的队伍，建成了各种形式的决策架构、“八部一办”的总部框架以及以北京、新加坡、香港、伦敦、纽约、法兰克福为支点的全球经营平台。
其次，坚持多元化、分散化、多层次的投资运用。
多年来，外汇储备经营遵循市场规律，在投资上“不把鸡蛋放在一个篮子里”，从长期、战略的角度出发，在国际市场上进行分散化配置。
我国外汇储备投资横跨70多个国家和地区，包括30多种货币，50多类资产品种，6000多家投资对象，利用不同货币和资产的此消彼长，降低经营风险，实现动态平衡。
多年来，外汇储备经营始终从国家大局出发，积极探索和拓展运用方式，建立汇金公司支持国有商业银行改革，支持配合国家设立中国投资有限责任公司，认购国际金融公司和国际货币基金组织债券、参与设立东盟十国与中日韩三国区域外汇储备库，创新开展委托贷款业务、设立外汇储备委托贷款办公室支持国家“走出去”战略，开辟了多条渠道运用外汇储备，切实服务我国实体经济发展。
20年间，不论国际市场如何风云变幻，外汇储备始终坚持积极稳健经营。亚洲金融危机期间，在确保外汇储备自身经营安全的同时，积极制定流动性安排预案，坚决捍卫了人民币不贬值的庄严承诺。
美国次贷危机期间，外汇储备快速有效应对，保障了资产总体安全。欧债危机期间，外汇储备及时启动应急机制，灵活调整投资策略，有效防范化解相关风险，总体实现保值增值目标。
2013年11月，党的十八届三中全会再次拉开了新一轮改革大幕，对外汇管理改革作出了全面部署，外汇储备经营管理事业进入了又一关键发展阶段。