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儿科俗称哑科，患病后诊其脉“脉微难见”，听其言“言不足信”，故钱氏把“必资外证”列为四诊之首，首重望诊，通过详细观察面色、两目、动态、口唇等外在征象，由外知内，推断疾病虚实寒热。
对于儿科望诊的实际应用，他专论“面上证”与“目内证”。其“面上证”据《素问·刺热论》的观点指出：“左腮为肝，右腮为肺，额上为心，鼻为脾，颏为肾，赤者热也，随证治之。”（《小儿药证直诀·脉证治法》）左腮、右腮、额上、鼻、颏分别是肝、肺、心、脾、肾脏之气应于面之部位，病虽未发，其色先见，可为病症之先兆。其“目内证”包括“赤者，心热……淡红者，心虚热……青者，肝热……黄者，脾热……无精光者，肾虚。”（《小儿药证直诀·脉证治法》）杂病证“目赤兼青者，欲发搐；目直而青，身反折强直者，生惊……吐泻昏睡露睛者，胃虚热；吐泻昏睡不露睛者，胃实热。”（《小儿药证直诀·脉证治法》）这些独特的诊断方法在临床上有重要的参考价值，望而知之有其临床实际意义。
《小儿药证直诀》还有多处关于闻诊、问诊、切诊的专论，例如论小儿脉法，只提出脉乱、弦急、沉缓、促急、浮、沉六种脉象。书中有许多综合四诊所得做出疾病、证候诊断的记载，说明他在重视望诊的同时，也是注意到四诊合参的。