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即便我们相信自己有行动的自由，相信我们的命运还没有被神明或物理定律无可改变地规定好，一些对自由意志的限制也仍然存在。
在雷·布拉德伯里（Ray Bradbury）于公元1952年写作的《雷霆之声》（ A Sound of Thunder ）中，一位穿越到恐龙时代的时间旅行者无意中踩到了一只蝴蝶。回到现代世界后，他发现自己意外杀死蝴蝶的行为以无法预料的方式扰乱了历史的进程。
我们选择的自由可以通过多种方式被剥夺：囚犯选择受限；下身瘫痪的人选择受限；生活在极度贫困中的人选择受限。我们可以把这个想法进一步推广，认为那些年轻时机运不佳或未能接受教育的人的选择也是受限的；认为那些为霸凌者恐吓住的人，或被压迫性政权洗脑的人的选择是受限的。这时，我们可以说作用于一个人身上的力也让他的自由意志有所丧失吗？
如果一个人注定要做出某些举动，无论是因为其大脑中的化学反应还是神明的规划，我们能让他对自己的行为负责吗，或者选择只是大脑所产生的幻觉？若行为是无可避免、无法控制的，那么因某人做出了这样的行为而惩罚他，是可以接受的吗？