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临床上许多疾病都与感染有密切关系，类风湿关节炎也不例外。有关报道中提到的病原体种类甚多，奇异变形杆菌和结核分枝杆菌是至今发现的与类风湿关节炎最为相关的2种细菌，EB病毒是病毒感染中研究最多的。
研究发现，许多与类风湿关节炎有关的细菌或病毒的蛋白中含有一段共同序列QK/RRAA。该序列可见于Ⅱ型胶原蛋白及A型滑膜细胞表面的HLA-DR4/DR1抗原。当上述细菌或病毒蛋白进入机体后，其QK/RRAA多肽片段可诱导特异性抗体的产生，该抗体既可与外源性抗原多肽形成免疫复合物，又可与自体抗原的QK/RRAA序列结合，引起自身免疫反应。