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柑橘栽培无病毒化是现代柑橘业发展的重要特征，完善柑橘良种无病毒苗木繁育体系是柑橘产业可持续发展的关键。无病苗木的培育是指无柑橘黄龙病等病害的苗木培育，要求用无病毒母本树的接穗和砧木进行繁殖，对柑橘黄龙病等病害的防治有重要意义。
采穗用的母本树特性要求与“第二节 嫁接苗的培育”部分所述的相同。为确保苗木不带病，培育无病苗木所用的母树应当栽植于纱网大棚内，并经常进行鉴定。病毒鉴定可通过农业部指定的果树脱毒中心进行，如设立在广东农业科学院果树研究所的华南热带果树脱毒中心。母本树的栽培管理要按照无病程序进行，及时淘汰变异植株。一般为了保证接穗不发生变异，原则上每株采穗用的母本树采穗时间不超过3年。
育苗基地包括无病毒采穗圃、指示植物鉴定圃和无病毒苗圃。无病苗木的培育主要运用纱网大棚等设施进行，要求无昆虫传播病害，整个育苗过程完全在封闭的纱网大棚内完成。如果采用露地育苗，要求有良好的自然隔离条件，有高山、大河、湖泊等自然隔离屏障，周围2千米以上无芸香科类植物。
无病母本园用纱网封闭
纱网室内无病毒采穗圃
纱网室内指示植物鉴定圃
无病苗木的育苗过程在纱网封闭的无病育苗圃内进行
无病苗木一般采用营养筒（袋）等容器育苗或露地育苗，比常规大田育苗要求更高。
（1）培育砧木
①砧木种子的采集和消毒：砧木种子要采自优良纯正品种或优良单株系，无检疫性病虫害。播前要进行种子消毒，先在保温容器内倒入57℃左右的热水，将砧木种子用纱网袋装好，置于50~52℃热水中预浸5~6分钟，取出后立即投入保温容器内处理50分钟，注意使水温保持在55℃ ±0.3℃。取出后立即摊开，稍晾干，放至温室待播。凡要接触已消毒种子的人员必须先用肥皂洗手。用于柑橘无病毒苗圃的常用工具要专用，枝剪和嫁接刀在使用于每个品种材料之前，用1%次氯酸钠溶液消毒。
②播种：砧木种子播种于苗床营养土中，苗床保持地温25℃以上，相对湿度保持在80%~90%。当温度超过30℃时，立即揭膜和喷水降温。苗出土后每隔7~10天喷1次杀菌剂（多菌灵或托布津等），防治立枯病、炭疽病和根腐病等。当苗高5厘米以上时开始追施0.1%~0.2%复合肥等稀薄液肥。
③砧木苗移栽：待苗高达15厘米以上时即可移栽。
④砧木苗的管理：移栽约15天后施1次稀薄液肥，以后每个月施肥1次。砧木苗生长期间要做好病虫防治工作。
（2）采穗母本树的培育与 采穗 采穗母本树应当是经过农业部指定的鉴定机构鉴定，确认为无病才能应用。采穗母本树定植于网室内，竖立标示牌，加强水肥管理，注意促进营养生长，以培养较多的充实健壮接穗。定植后第2年开始采集接穗，采穗限期为3年。采穗工具应经过消毒处理。操作人员应当衣着干净，用肥皂洗手。
砧木苗移栽入育苗容器中，整齐摆放在育苗场
采穗母本树定植区域标示牌
（3）嫁接 砧木苗高35厘米以上、主干10厘米高处的径粗达0.7厘米时即可嫁接。嫁接工具必须用洗衣粉洗净，再用10%~20%漂白粉消毒，用清水冲净后使用。嫁接人员用肥皂洗手，衣着干净。嫁接方法与“第二节 嫁接苗的培育”部分相同。
嫁接
套袋保湿
接芽萌发
接芽抽梢
嫁接成苗
（4）苗木出圃 按照农业部行业标准《柑橘脱毒苗》的规定，出圃的无病苗木嫁接高度大于10厘米。苗木出圃时，对苗木的品种、砧木、嫁接日期、出圃时期、定植去向等情况进行详细记载。
茎尖嫁接脱毒育苗是目前脱毒育苗的先进技术。主要通过在无菌条件下茎尖嫁接实现脱毒。具体方法是：
（1）砧木准备 将饱满的砧木种子剥去外种皮和内种皮，在0.5%次氯酸钠溶液加0.1%吐温-20的溶液中浸泡消毒10分钟，然后用无菌水冲洗3次，在无菌环境中播于含1%琼脂的MS植物细胞培养基（灭菌）的试管内，然后置于27℃ ±l℃下黑暗中培养。幼苗生长13~14天可用作茎尖嫁接的砧木。
（2）茎尖准备 在纱网大棚内采母本树萌发的长1~3厘米的嫩梢，去掉叶片，切下尖端长约l厘米的梢段，在0.25%次氯酸钠溶液加0.1%吐温-20的溶液中浸泡消毒5分钟，用无菌水冲洗3次。在无菌环境中，在双目解剖镜下，用刀将下部叶去掉，切下生长点带2~3个叶原基的茎尖，长度为0.14~0.18毫米的茎尖备用。
（3）嫁接方法 在无菌条件下，从试管中取出砧木苗，截顶，留1.5厘米长的茎，留根4~6厘米长，去子叶和腋芽。在双目解剖镜下于砧木近顶部一侧开方形切口，即横切1刀、竖切2刀，或在茎段上部用3刀切成一个“△”切口，深达形成层，挑去3刀间皮层，将茎尖置于砧木切口，茎尖切面与砧木的横切面相贴，即完成嫁接。
茎尖培养
嫁接
嫁接小苗
（4）茎尖嫁接小苗管理 将嫁接苗放入盛有液体培养基的试管内生长。培养温度27℃，光照度1000勒，每天16小时。
（5）茎尖嫁接植株的培养 一般茎尖嫁接苗培养1个月，长出2~3片叶片，叶色变为深绿色后即可移出转接。茎尖苗经过指示植物检测或通过聚合酶链式反应（PCR）检测，属无病苗，则可作为母树进入无病毒良种库用作采穗，再进入良种繁育场繁育无病苗木。