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黄鳝雌雄异体，但有奇特的性逆转现象。从生命开始到第一次性成熟均为雌性，以后随着年龄增长，产卵后卵巢逐渐退化，进入雌雄间体阶段，其卵巢逐渐过渡为精巢后终生雄性，这种由雌到雄的转变叫性逆转现象。在达到性成熟的黄鳝群体中，较小的个体是雌性，较大的个体主要是雄性。雌雄间体的性腺组织实际上是一个动态过程，在这个生理变化过程中，由有功能的雌性转变为有功能的雄性。黄鳝的幼体性腺逐步从原始生殖母细胞分化成卵母细胞，黄鳝从幼体进入成体，性腺发育成典型的具有卵母细胞和卵细胞的卵巢，以后又逐渐发育变成成熟卵，这就决定第一次进入性腺发育成熟的个体都是雌鳝。雌鳝产卵后，可以明显地发现性腺中的卵巢部分开始退化，起源于细胞索中的精巢组织开始发生，并逐步分枝和增大，即性腺向着雄性方向发展，这一阶段的黄鳝即处于雌雄间体状态。这以后卵巢完全退化消失，而精巢组织充分发育，并产生发育良好的精源细胞，直到形成成熟的精子，这时的黄鳝个体已转化为典型的雄性。
据组织切片观察，仔鳝出膜3天，体长1.35厘米时，1对生殖原基即开始出现，随后逐渐增大伸展。出膜后30日龄的稚鳝，平均体长5~6厘米时，生殖腺外膜合并形成纵隔，已有卵母细胞出现。幼鳝60日龄、体长7厘米左右时，合并的生殖腺变细，横切面似三角形，纵隔完全消失，卵母细胞为不规则形。幼鳝120日龄、平均体长13.5厘米时，生殖性为单一体，位于体腔左侧，右侧生殖腺已不存在，生殖腺外观为乳白色，卵母细胞大多为圆形或椭圆形，直径为15~60微米。黄鳝越冬后，平均体长20厘米时，即从幼体进入成体，生殖腺中的卵母细胞逐渐发育成熟的卵，进入性成熟时期，称为雌性阶段。雌鳝产卵后性腺中卵母细胞部分开始退化，起源于细胞原基中的精巢组织开始发生并逐渐分枝、增大，性腺向雄性方向发展。这一阶段处于雌雄间体状态（其前半段为偏雌性阶段，后半段为偏雄性阶段）。雌雄间体的性腺组织实际上是一个动态过程，在这个生理变化过程中，有功能的雌性转变为有功能的雄性。其卵巢完全退化消失，而精巢组织充分发育，并产生发育良好的精源细胞，直到形成成熟的精子，这时候的黄鳝个体已转化为典型的雄性了。