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科研的投入包括科研资金的投入和科研力量的投入，研究的主要内容应包括黄鳝生理、生态特性的研究，黄鳝生产的最佳环境的研究，还有种苗繁育与批量生产等方面的研究。学习国外的先进养鳝经验，大力开展工厂化养殖，深入研究养鳝技术，加快研制黄鳝的全价颗粒饵料，扩大养殖规模，开展工厂化养殖，提高集约化程度。同时对黄鳝的种质资源进行调查和研究。
自然界中黄鳝主要生活在湖泊、河流、水库、池沼、沟渠等水体中，也在水稻田、田埂、堤岸和乱石缝中钻洞穴居，亦喜栖于腐殖质多的水底泥窟中。然而近些年来，黄鳝自然资源锐减，田间地头基本绝迹，江河、湖泊自然资源极少，市场上销售的野生黄鳝几近殆尽，野生黄鳝平均个体体重也在不断降低，以前0.25千克/尾以上的个体很常见，0.5千克/尾以上的个体也不少，现在个体在0.25千克/尾以上的黄鳝已经很少见了。黄鳝自然资源现状形势逼人，究其原因可归纳为以下几点：栖息地减少、工业污染、农药化肥污染、过度捕捞、使用违规工具捕捞等。关于黄鳝人工繁殖方面的研究虽见许多报道，但笔者认为，就目前研究的现状看，无论是其亲鱼暂养的成活率，还是受精卵的孵化率、孵出仔鱼的成活率都极低。这说明，目前对黄鳝人工繁殖和驯养的关键性技术还没有进一步研究。只有解决好这一问题，才能保证在人工控制条件下大量生产黄鳝种苗，一方面可进行放流，补充自然资源，另一方面，可投放市场，直接获得经济效益。
随着养殖规模扩大和集约化程度不断提高，黄鳝病害暴发概率大大增加，发病的程度也大大加深，黄鳝的疾病出现多样化和复杂化趋势。为了防治病害，一些养殖户通过增加预防和治疗的药量，大量重复使用抗生素等能在体内残留的药物，致使成鳝品质下降，受到市场排斥，影响了黄鳝产业的发展。解决此问题单纯靠投药防治不是最好办法，应倡导生态养鳝等养殖形式，最大限度地减少鳝体药物残存程度，这有利于人们的身体健康，更重要的是有利于出口换汇。此外，养殖户还要树立品牌意识，在生产、销售和经营当中，为成鳝注册商标名称，通过诚信经营打造知名黄鳝品牌，获取相应的品牌价值。
苗种占黄鳝养殖成本的比重较大。养殖成活率的高低、体重增长的比例、收效的多少，在很大程度上取决于鳝种。购买质优、健壮的黄鳝苗种是养殖成功的第一步。黄鳝苗种最好在当地引种，其主要原因是：①鳝种来源清楚，是钩钓的、电打的、药捕的还是笼捕的，养殖者能够清楚了解。②在购到鳝种后，运输距离和时间短，处理方便，成活率较高。异地购种由于运输时间过长，温度较高，鳝种运回后往往会死亡一部分，长时间运输使鳝种体质下降，下池后再死亡一部分，再加上长途运输的费用，成本很高。相比较而言，养殖者在当地购买鳝种，即使价格高一些，但由于鳝种的来源清楚，暂养时间短，离水时间不长，成活率较高，还是比在外地购买鳝种要经济实惠得多。我国黄鳝地方自然种群最大的有深黄大斑鳝、浅黄细斑鳝、青灰色鳝三种，还有少数浅白色鳝、浅黑色鳝等。以上几种黄鳝，最适宜于我国人工养殖的是生长速度快、个体大、增重倍数高的深黄大斑鳝和浅黄细斑鳝两种。而从越南、泰国引进的黄鳝，虽然在热带地区表现出较好的生产性能，但不一定适宜于我国其他地方养殖。
为了错开黄鳝集中上市的时间，赚取更多的利润，可以采用囤养技术来延迟黄鳝的出售时间，从而实现常年供应鲜活成鳝。一般从9月囤养，到春节前后出售，避开因大量上市而市场价格走低的时期。可以在房前屋后建池或在稻田中囤养黄鳝。囤养黄鳝能否赚钱的关键是让黄鳝有较高的存活率和回捕率。因此，要把好黄鳝的引进关和防逃关。有土囤养密度不宜超过10千克/米 2 ，无土囤养密度不宜超过5千克/米 2 。
目前，我国的出口产品仍以活黄鳝为主，应加快研制和开发黄鳝的保健、快餐食品等深加工产品，此外，加强产品的商标注册也迫在眉睫。