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明代的李时珍历时27年完成的《本草纲目》，是我国古代自然科学知识的百科全书式巨著。李时珍不仅总结了16世纪之前我国药物学的内容，而且还通过亲自采访和实地考察验证，纠正了以往本草书中错误，补充了许多新的药物资料，所以《本草纲目》内容极为丰富，全书共载有1 892种药物、1 000余张药图、1万余首药方，是古代本草学集大成之作。李时珍在《本草纲目》中提出了当时最先进的药物分类体系：按“从微至巨”“从贱至贵”的原则，科学、系统地论述了各种药物的知识，例如对药物的记述涵盖了药物的名称、产地、品种、形态、炮制、性味、功效、主治等，尤其在“发明”一项着重探讨的药性、疗效及用药要点就是源于李时珍本人对药物的观察、研究、实际应用的经验总结。
《本草纲目》不仅对药物学有巨大贡献，还反映了不少与医学及药物的形态、生态环境相关的自然科学知识，例如环境对生物的影响、遗传与相关变异现象等。李时珍在阐发他的医学见解和临床用药经验的同时，还推导了药物疗效的机理。李时珍还提出了“脑为元神之府”，这是以前医家少有论及的新观点。李时珍的《本草纲目》是我国古代最伟大的药学著作，在世界科技史上占有重要地位。随着《本草纲目》的问世，书中诸多超越传统的创见为众多医家所熟知并被应用于临床实践中，《本草纲目》的影响也因此越来越大。
