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书院通过官府拨充、民间捐输获得一定的经费后，除部分用于书院的建设外，剩余部分多用于购买产业，最主要的是土地。除固定资产的产出，清代书院将货币资金用于发商、发当生息，也是一种较为普遍的现象。
拨充、捐赠或购买土地，并将土地租与他人耕种以获得租佃收入，这是书院院产产出的主要途径，也是书院日常运营中最主要的经费来源。如江西武宁正谊书院，于道光九年（1829）用官绅所捐以备育婴之费2520贯买田置产，“买李苍壁田二十五号，计三十六亩八分，庄屋一所，计十三间，山二嶂，并基地、水塘等，坐落二十八都土名长乐塅，额租钱九十八千文，佃户杨碧亨（折实租钱八十二千文）。买汪孔霞田六十二号，计三十七亩六分，秋地四亩一分，庄屋一所，山四所，水塘四所，大塘半口，并园围基地等，坐落三十五都洞口，土名崖垅，每年额租钱六十千文，佃户余俊吾，……”所买田额租共一百九十七千二百文概归书院。
这些地租收入成为正谊书院日常运行中主要的经费来源。关于田租我们还将在书院经费构成中做有关介绍，此处不详述。
明清时期，将货币资金发交盐商、当商等商业主体，按照议定的息率收取利息，是书院经费来源的重要补充。关于书院发商生息以获取经费，我们将在经费构成中详细介绍。
由于生息存在一定的风险，如战乱对商业的破坏、经营不善而破产等，极有可能造成书院不但收不到利息，甚至连本金都有可能化为乌有。为此，一些书院在购置田产后，将剩余资金用于添置较为稳定的店铺，将店铺出租，收取房租作为经费。如河北蔚县文蔚书院于乾隆时期初创时议定书院经费不发商生息，“（书院）当创建之初，预为久远之计，是以不交商生息，而建买市房，按四季收取房租，以供师生脩脯膏火之用”。
嘉庆二十四年（1819），海南琼山书院“契买琼山县署前仁和坊民房一所……用价银五百一十圆。每年收租三十千文”。
江西金溪仰山书院同治八年（1869）冬新买浒湾店屋1栋，“座落李家巷，坐东朝西，接连两进”，同治九年（1870）冬新买城内店屋2栋，“一栋坐落街中叶家巷，上首坐南朝北，接连三进，现开张三和布店；一栋坐落街中叶家巷，上首坐南朝北，接连四进，现开张复新银号”。