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物流系统分析是指从对象系统整体最优出发，在优先系统目标、确定系统准则的基础上，根据物流的目标要求，分析构成系统各级子系统的功能和相互关系，以及系统同环境的相互影响，寻求实现系统目标的最佳途径。
物流系统的分析方法是指在进行规划设计工作时，根据系统的概念、构成和性质，把规划对象作为一个系统进行充分了解和分析，再将分析结果加以综合，使之能够最有效地实现系统的目标，并且将评论方法贯穿于分析与综合过程中。分析、综合、评价是物流系统规划中处理问题最基本的方法，三者关系如图2-2所示。
图2-2 物流系统分析的内容
分析过程的主要任务是为系统收集充足和必要的信息，并初步制定多套可满足集合要求的备选方案，用各种手段和方法分析对象系统的要求、结构及功能等，并考虑到环境、资源、状态等约束条件，建立各种替代方案所需的分析模型，根据评估标准评估分析结果，以获得更多的满意的建议。该分析过程旨在实现系统的整体效益，侧重于寻求解决特定问题的最佳策略，使用定性和定量分析方法为决策者提供有价值的信息，以获得有利的决策。在分析过程中，需要考虑五个基本要素：目标、替代方案、模型、指标体系、评价准则。
1）目标。目标是决策的出发点，为了正确获取决策所需的各种有关信息，物流系统分析人员的首要任务就是充分了解建立物流系统的目的和要求，同时还应确定物流系统的构成和范围。
2）替代方案。一般情况下，为实现某一目标，总会有几种可采取的方案或手段，这些方案彼此之间可以相互替换。选择一种最合理的方案是物流系统要分析研究和解决的问题。
3）模型。模型是系统分析的基本方法，是对实体物流系统抽象的描述。它可以将复杂的问题化为易于处理的形式。在分析过程中，借助于模型来有效获取物流系统规划设计所需要的参数，并据此确定各种制约条件，同时还可以利用模型来预测各替代方案的性能、成本与效益，有利于对各种替代方案进行分析和比较。
4）指标体系。指标体系指的是若干个相互联系的统计指标所组成的有机体，即系统目标所涉及的各个方面。费用与效益是最重要的两个指标。分析阶段要根据系统的目标来确定具体的明细指标。
5）评价标准。评价标准是物流系统分析中确定各种替代方案优化顺序的依据，是评价方案优劣的尺度。评价标准根据具体情况而定，费用与效益的比较是评价各方案的基本手段。
系统综合是以分析过程中提出的各种推荐方案为基础，选定系统规划设计的方法，研讨系统分析的结果，收集整理设计数据，为系统分析的每个推荐方案给出总体框架、结构、系统详细分析设计及方案实现，以供进行评价决策。
系统评价过程是对分析或综合设计出来的可供选择的方案，用技术、经济和环境多视角来综合评价的过程。特别是审核系统综合设计的合理性与实现综合设计方案的风险性，从而选择适当的可能实现的方案。
具体的工作任务包括设定评价方法，进行方案的费用评估、效益评估、风险评估，在评估的基础上进行综合评估，最后通过决策，选择可行的方案。