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转运人员到达后必须了解患儿病史、详细检查，预测患者在转运过程中需要采取的措施比正确的诊断更为重要。评估当前的整体状况，完成并记录病情危重度评分。高危新生儿在转运前应尽可能达到基本的稳定状态，避免在转运途中死亡。
目前国际上采用STABLE模式在转运前对患儿进行处理。S（sugar）-注意维持血糖稳定：可足跟采血，应用快速血糖仪检测，确保患儿血糖维持在2.6～7.0mmol/L。T（temperature）-保持体温稳定：确保患儿的体温维持在36.5～37.2℃，在做各项操作及抢救时都应注意保暖，但也要防止过热。A（assisted breathing）-保证呼吸道通畅：清除患儿呼吸道内的分泌物，视病情需要给氧，必要时行气管插管维持有效的通气，此时应适当放宽气管插管的指征。B（blood pressure）-维持血压稳定：监测患儿的血压、心率及血氧饱和度，血压偏低时可使用生理盐水扩容，也可应用多巴胺及多巴酚丁胺维持血压。L（lab works）-注意监测患儿血气指标，根据结果进行纠酸和补液，确保水、电解质及酸碱平衡。如果血常规提示感染应尽早给予抗生素。E（emotional support）-情感支持：由医师向患儿的法定监护人讲明目前患儿病情及转运途中可能会发生的各种意外情况，稳定家属的情绪，使其主动配合。
由于新生儿尤其是早产儿体温调节中枢发育不完善，体表面积/体重的高比例会导致散热过快，胎龄越小、出生体重越低，发生低体温的风险越大。低体温将会导致代谢性酸中毒和组织缺氧，严重时会导致低血压、休克、DIC、肺出血、脑室内出血和新生儿死亡。因此在危重新生儿转运时，体温管理是一个重点。在实际工作中我们常用一些保暖设备和装置以实现保暖的目的。
辐射式保暖床装有头顶式远红外元件，发出的热集中在安置新生儿的区域内，以达到保暖的目的。主要用于产房内新娩出新生儿的处理或复苏操作，如对新生儿做一些暴露躯体的操作（如腰穿、抽血）、对危重新生儿进行抢救。
暖箱为新生儿尤其是早产儿提供了一个适宜的小环境，在转运时最好使用转运暖箱。
适用于胎龄小于30周的早产儿或极低出生体重儿。方法是：预热塑料包被，一旦患儿娩出，不擦干身体立即将早产儿放入塑料包被内，仅暴露头部和右侧腕部并立即擦干，然后和辐射式保暖床联合使用。如果患儿需要转运，外面还需要再包上毛毯，以减少传导散热，或者使用转运暖箱。保暖过度对新生儿同样不利，可导致水分丢失增加而发生脱水，诱发呼吸暂停，血液浓缩导致红细胞破坏增加而加重黄疸，还可引起患儿发热，严重者可导致死亡，所以在转运过程中也要避免保暖过度的发生。
新生儿尤其是早产儿更容易发生低血糖，葡萄糖是重要的能量物质，是大脑唯一的能量来源。血糖<2.2mmol/L为低血糖，转运车上最好配备快速血糖检测仪。但快速血糖一般较静脉血糖稍高，一般要维持血糖在2.6～6.5mmol/L。低血糖急救处理：缓慢静脉注射10%葡萄糖2ml/kg。
保持呼吸道的通畅是转运的必须要求。所有的患儿都必须被评估，了解其能持续保持呼吸道通畅的能力。存在意识障碍的新生儿应该置于适宜的体位以防止误吸，保持呼吸道通畅。上呼吸道的分泌物应该清理干净，气道的附属部位，例如口咽部、鼻咽部的呼吸道也要保持通畅。有严重的呼吸窘迫、呼吸衰竭、意识丧失及颅内压增高的新生儿，首先应进行插管而不是转运，并且应该在转运团队到来之前就进行插管。转运团队对患儿最初的评估包括呼吸音、辅助通气下的胸廓扩张度及胸片上气管插管位置。如果患儿没有插管，呼吸道的再次评价内容就包括呼吸音、自主呼吸时胸廓的扩张度、意识水平及血气分析。转运团队的一个重要决定就是在转运前是否需要对患儿进行插管。没有任何一个参数能够回答这个问题，它由患儿整体的状况决定，对转运患儿来说气管插管的指征可适当放宽。包括对患儿病情的趋势评估：患儿病情是改善还是恶化，这基于患儿的生命体征、病史及精神状态。还要考虑患儿的计划转运模式及转运时间。如果决定插管，应该由最有经验的医务工作者进行操作，插管前应该进行适当的镇静。在转运之前必须确保气管插管是安全的，转运团队有权重新置管。由于在转运过程中保持人工气道的通畅是转运团队的责任，反复确定气管插管位置正确会让他们感到放心。
对气道和呼吸的评估实际上是同时进行的。呼吸状况的检查包括呼吸频率、呼吸音、辅助呼吸肌活动、皮肤颜色及意识水平。氧浓度和呼气末二氧化碳监测仪可为通气状态提供无创性的评估。动脉血气分析能够提供患儿氧合和通气状态的准确信息，但必须结合患儿的整体状况考虑。应该为所有存在呼吸窘迫或者因为某些问题导致患儿氧耗增加的患儿提供充足的氧气或者呼吸支持。氧疗是为了提高患儿的氧浓度，给氧的方法很多，对于吸氧浓度要求低的患儿并不需特别考虑给氧途径，对于早产儿来说要避免吸入100%氧气。头罩可以提供90%及以上氧浓度的氧气，头罩根据尺寸的大小可以适用于不同的患儿并应用于持续转运过程中。从体格检查就能明显判断患儿是否呼吸衰竭，而不需要血气分析来证明这个事实。一旦发现患儿有呼吸衰竭，就需要用气囊加压面罩行正压通气，并开始着手安排气管插管。对于早产儿，强调出生后立即给予经鼻持续气道正压通气（nasal continuous positive airway pressure ventilation, nCPAP），推荐压力5～6cmH 2 O，早产儿正压通气推荐应用T-组合复苏器，途中也可选择nCPAP。避免肺损伤，包括压力伤、容量伤，压力过高可增加气胸发生率。在胎龄26周以上超早产儿中，早期nCPAP优势更加明显，然后再根据病情进展情况考虑是否进行气管插管，如果呼吸窘迫逐渐加重应给予气管插管。虽然早期nCPAP成为主流，但气管插管机械通气仍是抢救危重早产儿的重要手段之一，主要通气方式包括常频和高频通气，但仍然要避免发生不必要的压力伤和容量伤。在完成插管和人工通气之后，应该采用血气分析来评估现在和进一步的通气状况，并考虑气管内应用肺表面活性物质（pulmonary surfactant, PS），特别是早产儿。虽然目前预防性应用PS越来越谨慎，尤其是对于26周以上早产儿，如无新生儿呼吸窘迫综合征（neonatal respiratory distress syndrome, NRDS）表现，可早期nCPAP支持，暂不使用PS，但对于有NRDS表现的早产儿，仍倾向于早期积极的PS治疗，但推荐INSURE（气管插管-应用PS-早期拔管给予nCPAP）。由于大多数的转运工具上没有混合压缩空气和空氧混合仪等设备，因此在转院过程中使用纯氧治疗是可以接受的。尽管在转运中胸部X线片并非是明确呼吸衰竭的必需项目，但其能够确定气管插管的位置，也许能够为呼吸衰竭的病因诊断提供有价值的提示。建议适当镇静气管插管患儿，这不仅有利于通气，还有利于防止患儿躁动或者自行拔管。短效药物如吗啡及芬太尼有利于辅助镇静，这些药物持续时间短，也有利于间歇重复评估患儿的神经系统状态。
患儿的循环功能通过心率、皮肤灌注（毛细血管再充盈时间、外周和中央血管搏动比较、皮肤颜色、皮肤温度）、血压、尿量、脱水程度（皮肤充盈程度、黏膜情况）和意识状态来判断。所有的病危或有潜在病危的患儿应该至少开放一条血管通路，可以是经外周静脉、中心静脉或者是经骨的输液通路。尽管按标准需要两条通路，但常没这个必要，应取决于转运团队。
评估心率时要注意，窦性心动过速与很多原因都有关，如应激、疼痛和发热，也有可能是由于呼吸抑制或休克引起的。再者，查看参数时要考虑患儿的整体状况，而不能仅依靠一个参数对患儿进行评估。转运开始前还应注意评估血压（blood pressure, BP）情况。BP是指驱动血液在血管中流动的动力，BP=心输出量（cardiac output, CO）×血管阻力（systemic vascular resistance, SVR）。低血压是指低于正常血压的第10百分位数，一般指低于50/30mmHg，主要适用于足月儿。对于早产儿来说，其平均血压不应低于其相应胎龄，目前应用较广。在转运前，应评估血压，积极纠正低血压或休克，早产儿更容易发生低血压。
应尽早发现患儿休克的体征并及时给予相应的治疗。循环血容量减少是最常见引起新生儿低血压和休克的原因。结合患儿的病史及临床表现将有助于诊断休克的类型。抗休克的治疗首选生理盐水，以10ml/kg快速输注，推荐使用输液泵。为了加快输液速度，可以使用注射器或用人工推挤的方法将液体快速输注，使用20ml的注射器从小静脉内推液体遇到的阻力会小一些，合适的注射器型号能够加快输液速度。当所有的液体都输完后，需要对患儿的生命体征进行重新评估，必要时进行重复补液。新鲜冰冻血浆或5%的白蛋白在必要时也应该被快速输注给患儿，当然这取决于导致休克的病因。经反复扩容血压仍较低或休克无明显改善者，可考虑应用血管活性药物，常用的有多巴胺和多巴酚丁胺。
如果存在休克，在转出医院内就应该给予快速的抗休克治疗，但抗休克治疗应该在所有的转运工具中都能实施。如有需要使用血管活性药物治疗，也应该从转出医院就开始进行治疗。尽管转运团队在转运途中也可以进行这些治疗，但是在转出医院（患儿稳定和非移动环境）中进行治疗会更容易。所有的转运团队都应该有输液泵以保证能以所需要的低流速将液体输给患儿。虽然心律失常在新生儿中不常见，但转运团队必须有能力去识别并治疗。在转运途中尽量使用心电监护仪，还应该携带复苏的药品如肾上腺素、利多卡因、阿托品和腺苷等。
意识水平评估是一个持续的评估过程，应和呼吸道、呼吸及循环评估同时进行。可以用AVPU等级评分法对患儿神经系统进行持续简单的评价：警觉状态、对刺激有反应、仅痛觉反应，或者是昏迷。抽搐是新生儿较常见的一种表现，有很多原因会导致抽搐的发生。初步稳定治疗阶段包括氧的供给和静脉输注抗惊厥药物，保持呼吸道通畅及足够通气也是非常重要的。对可疑或者明确有颅内出血的新生儿尤其是早产儿，其治疗目标是预防继发性损伤，防止继续出血。患儿的头部应该被抬高30°，并且要保持居中。通气治疗的目的是控制性过度换气，确保达到目标的最低呼气末正压。
对于异常的化验结果，要尽量纠正至正常范围内或进行早期干预，包括动脉血气、离子和酸中毒等。全血细胞分析，若提示感染，应尽早输注抗生素，还包括影像学资料，应复印并移交给接诊医院。
当新生儿需要转院时，家属一般无思想准备，医护人员应和家属充分沟通，减少其焦虑。详细告知病情严重性及转运的必要性，而且疾病有可能继续进展。取得家属理解并同意转运，书面签字后转运。
生后羊水胎粪污染且新生儿无活力（呼吸抑制、肌张力低下和心率<100次/min），立即气管插管气道吸引，需要重复吸引时应重新气管插管。
听诊时一侧呼吸音减弱，可行胸部X线摄片或透光试验明确诊断；如有呼吸困难，需胸腔穿刺抽出气体或胸腔闭式引流，同时给予适当的氧疗措施。
转运前怀疑或已经确诊膈疝的患儿，因面罩复苏囊正压通气时大量空气进入胃肠道，扩张的胃肠进入和占据胸腔，应插入大口径胃管（10号或12号）以防止胃肠扩张导致的呼吸困难；需正压通气时应立即给予气管插管。
应抬高新生儿头部，以防胃内容物反流吸入；插入口饲管到遇到阻力后连接吸引器低负压间断吸引；需禁食及建立静脉通道；必要时气管插管呼吸支持，气管导管的远端应尽可能超过瘘口远端，以减少加压气体进入远端食管和胃内。气管食管瘘C型者应避免面罩通正压气和持续气道正压给氧。
腹裂是患儿低体温和低血糖的高危因素，需按无菌技术处理膨出的脏器，减少热量和液体丢失。腹裂患儿常有肠管血液循环障碍，转运人员必须密切观察肠道血液循环情况。推荐转运时患儿取侧卧位，适当支撑外露的肠管，以避免腹壁紧张或肠扭转。所有腹裂或脐膨出患儿均需插胃管。
转运时需调整患儿体位以保持气道通畅，必要时给予人工口咽气道及气管插管，注意患儿是否合并腭裂。
疑似坏死性小肠结肠炎（necrotizing enterocolitis, NEC）的患儿，应转运至具有小儿外科救治能力的医院治疗。转运过程中重点是支持治疗，腹胀患儿应注意留置胃管，经口或经鼻均可以。转运过程中，必须确保胃管安全并连接可开放的收纳袋或注射器，可在必要时手动吸引或持续胃肠减压。发生NEC患儿易合并呼吸衰竭，必要时需气管插管机械通气。