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党的十八届五中全会作出“推进健康中国建设”的战略决策。在国务院医改领导小组的领导下，2016年3月成立了以国家卫生计生委、发展改革委、财政部、人力资源社会保障部、体育总局等部门为主，环境保护部、食品药品监管总局等20多个部门参加的起草工作组及专家组。坚持开门编规划，协调各方参与，邀请有关民主党派中央和组织有关部门、智库及专家开展20多个专题研究、平行研究和国际比较研究，借鉴国内其他领域和国际健康中长期规划经验，广泛听取地方、企事业单位和社会团体等多方面的意见，并向社会公开征集200多条意见建议。
期间，国务院医改领导小组多次召开专题会、专家座谈会等听取意见，讨论修改文件稿。5月26日，国务院医改领导小组全体会议进行了审议。在8月19日～20日召开的全国卫生与健康大会上征求了全体与会代表的意见，经逐份逐条梳理，对提出的374条意见进行充分吸纳。8月26日，中央政治局全体会议审议通过了《纲要》。
可以说，《纲要》编制是一个总结经验、研究问题、提高认识、改进工作的过程，是一个发扬民主、集思广益、科学决策、达成共识的过程，是一个全民参与、汇集众智、反映民意、凝聚民力的过程，充分体现了全社会意愿的统一。