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按照《国家卫生健康委统计调查制度》要求，国家卫生统计网络直报系统采集全国各类医院（包含综合医院、专科医院、中医医院、中西医结合医院、民族医院）出院病人的住院病案首页和基层医疗机构（包含社区卫生服务中心和乡镇卫生院）的出院病人调查表。
卫健统4-1表：综合医院和专科医院住院病案首页。为季度报表，季后1个月内报送本季度数据。通过国家卫生统计网络直报系统报送。卫健统4-1表文件格式为表号-机构名.DBF，各表文件格式均采用DBF格式。
卫健统4-2表：中医医院、中西医结合医院和民族医院住院病案首页。为季度报表，季后1个月内报送本季度数据。通过国家卫生统计网络直报系统报送。卫健统4-2表文件格式为表号-机构名.DBF，各表文件格式均采用DBF格式。
卫健统4-3表：社区卫生服务中心和乡镇卫生院出院病人调查表。为季度报表，季后1个月内报送本季度数据。通过国家卫生统计网络直报系统报送。卫健统4-3表文件格式为表号-机构名.DBF，各表文件格式均采用DBF格式。
医院质量监测系统（hospital quality monitoring system，HQMS）是根据《卫生部医管司关于开展医院质量监测评价工作的通知》（卫医管评价便函〔2012〕105号）的精神，监测全国各类三级医院，全面推进医院质量监测评价工作的系统。共采集字段项目346个。
2019年国家卫生健康委《关于启动2019年全国三级公立医院绩效考核有关工作的通知》（国卫办医函〔2019〕371号）的相关要求，已经将上传HQMS的首页采集字段项目数增加至642个。
为加快推进统一的医保信息业务编码标准，形成全国“通用语言”，国家医疗保障局于2019年9月23日颁布了《国家医疗保障局关于印发医疗保障定点医疗机构等信息业务编码规则和方法的通知》，公布了医疗保障基金结算清单、定点医疗机构、医保医师、医保护士、定点零售药店、医保药师、医保系统单位、医保系统工作人员、医保门诊慢特病病种、医保按病种结算病种、医保日间手术病种等11项医保信息业务编码规则和方法。同时，在国家医保局网站上开通了“医保信息业务编码标准数据库动态维护”窗口。其中“医疗保障基金结算清单”位居首列，后文均简称“结算清单”，对于病案首页的运用与DRG的实施具有十分重要的意义。
结算清单的数据基础来自病案首页，包括基本信息、门诊慢病诊疗信息、住院诊疗信息、医疗收费信息几大类版块。其主要功能是为了满足医保审核与结算、病种病组管理、大数据分析需要。结算清单具有普遍适用性，可以用于各类型医疗机构、各种就医类型和现行的各类支付方式，对统一全国结算数据标准和大数据分析提供了基础保障。其设计思路主要取自病案首页、收费票据和其他结算凭证；取自病案首页的数据与首页保持一致性，取自票据的数据与医疗收费票据上的分类项目一致，数据具有唯一且统一的规范性。
湖北省目前开展的网络直报系统已经支持导入zip格式的压缩文件，压缩文件的命名无要求，但是压缩文件内部的DBF文件必须按照规范命名，并且压缩文件只能为ZIP格式。上报的382个字段名中，除了机构名称为USERNAME，其他的字段名均为汉字首字母的大写，如医疗付款方式的字段名为YLFKFS。382个字段中涉及住院病案首页必填项目的部分不能为空，其他部分可以为空。382个字段项目中有311个为字符格式，71个为数字格式。
上传时每例出院患者的病案首页在“病案首页数据接口标准”表中记录一行数据。文件名称以“hqmsts_”开头，例如“hqmsts_2018M1-12.csv”。对接文件格式为英文逗号分隔，并符合国际标准的CSV文件。每个CSV文件大小不超过200MB。数据采集项的字段名称与接口标准要求一致；“必填”项数据都不能为空。如无数据或不适用，填写英文横线“-”。“条件必填”不算必填项。满足条件时，“条件必填”项数据不能为空。642个字段项目中“必填”项63个，“条件必填”项18个。字符格式548个，数字格式48个，日期格式45个，集合类型格式1个。
结算清单数据从医院系统中直接采集，无需人工填写。
（1）基本信息中的定点医疗机构、新生儿入院信息。年龄不足一周岁的，填写方法与原来存在一定差异，原：15/30，现填写为15，新生儿入院类型：有正常、早产、有疾病等用于DRG分组的指标。
（2）住院诊疗信息：入院、诊断、手术操作、护理、出院信息；其中呼吸机使用时间，重症监护病房为DRG付费的重要信息。
（3）医疗收费信息：共91个数据项，14类收费项目能覆盖医疗收费中的所有费用类别，全部为必填项目；统一标准后，解决了各地区收费大类杂乱，标准不一的问题；收费信息与财政部2019年8月印发的最新版《医疗收费票据（2019版）》保持一致。
（4）申请结算信息：可以涵盖按项目、单病种、病种分值、DRG、按床日、按人头等多种支付方式。
首先是目的不同。医保结算清单是申请医保费用结算时提交的数据清单，开展大数据分析的重要工具。病案首页的填写目的则是提高医疗机构科学化、规范化、精细化、信息化管理水平，加强医疗管理与控制，完善病案管理，为付费方式改革提供技术基础。二是医保结算清单中有新生儿入院类型、治疗类别、诊断代码计数、医保支付方式。三是医保结算清单中含有基金支付明细信息等医保资金结算审核指标。四是医保结算清单中缺少麻醉分级、手术级别、切口信息、死亡尸检、药物过敏等与医疗质量相关但与支付无关的信息。五是医保结算清单中的ICD编码目前使用的是医保版疾病编码，但后期将统一成国标临床版2.0版的疾病编码，与病案首页的编码标准保持一致。需要注意的是，医保结算清单不等于病案首页，但医保结算清单源于病案首页，同时有别于病案首页。