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咽炎是由细菌或病毒感染、环境因素刺激等因素引起的咽部黏膜、黏膜下和淋巴组织炎症的统称，可单独发生，也可合并其他上呼吸道炎症，包括急性咽炎和慢性咽炎。咽炎与抽动障碍患者均可出现清嗓、干咳、发声等症状，但两者间仍然有很明显的区别。
首先，急性咽炎一般病程较短，常常伴随咽喉明显不适、多痰、咽红等症状，有时血常规可表现出病毒或细菌感染的血象。慢性咽炎虽然同抽动障碍一样会有较长的病程，但两者咽喉部症状仍然有着明显区别。
其次，抽动障碍往往是多种症状同时出现，如同时出现挤眉弄眼、异声怪叫等。最后，试探性治疗也是区分两者的有效手段之一。在经过常规咽炎治疗之后如果症状并没有出现显著的改善，就应当考虑患者罹患抽动障碍的可能性。