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科学问题是指在一定的时代背景及特定的知识背景下，有关领域的科学人士提出的关于科学知识和科学实践中需要解决而尚未解决的问题。它强调了在特定的时间、特定的背景下所形成的问题。当然科学问题不是随口便能提出的，科学家只有在一定的知识储备和充足的学习经验中，才能提出一个比较有说服力的科学问题。科学问题的解决结果可以有预期的目标，但不一定会达到该目标。检验问题可以发生在任何时间、任何地点和任何人群，它所涉及的范围更加广泛。它是在提出问题之后，为了检验、论证其是否存在或者避免它的发生而采取的措施和形成的问题。
科学问题的提出和解决的过程中可能存在检验问题，检验问题中也可能存在着尚未发现的科学问题。但科学问题的性质是提出但尚未解决的问题，而检验问题就不一定是尚未解决的问题了。因此，在某些程度上，检验问题所涉及的范围更广，但它所涉及的未知内容会比科学问题少一些。
检验问题的提出和科学问题一样，都需要具有足够的资料作为它提出的依据，并且检验问题和科学问题都涉及各个领域的问题。在医学科研中，科学问题的存在和提出是必要充分条件，但检验问题的存在和提出就不一定是必要充分条件，需要具体问题具体分析。检验问题的存在会帮助我们在检验过程中不断思考，从而提出真正意义上的科学问题，换一句话说，检验问题也许会是科学问题的存在形式或者来源之一。检验问题和科学问题之间存在着很大的差别，但也存在着某些密不可分的联系，在某种程度上，限制了相关的条件，检验问题的确可能是潜在的科学问题。比如，观察到鱼儿有在水中自由来去的本领，人们就模仿鱼类的形体造船，观察到鱼在水中用尾巴的摇摆而游动、转弯，人们就在船尾上架置木桨。就这样通过反复的观察、模仿和实践，逐渐改成橹、舵，还有桨，增加了船的动力，掌握了使船转弯的手段。在这一个过程中，为了造成最终符合要求的船，提出的质疑性问题即为科学问题，而之后对初步形成的船的功能进行检验，为保障乘船安全所提出的问题即为检验问题。因此，从某种程度上说，检验问题是因为科学问题的存在而被提出和产生的。