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邦本先生毕生服务于中医教育和医疗机构，以教书传道授业和临床为己任，从20世纪70年代便开始步入教书育人生涯，积累了丰富的办学治校经验。在原万县地区中医学校执教期间，他亲自担任班主任，带领学生到农村乡镇卫生院开门办学，巡回医疗，培养了众多的大中专学生，所带教的进修生、实习生难以计数。他担任教务主任和教学副校长多年，十分重视理论教学与临床实践的结合，教学管理中严肃认真，作风严谨，一丝不苟，师生们既敬畏他，又由衷地钦佩他。20世纪80年代，该校教学质量在四川全省7所同类学校中位居前列，毕业生统考多次获全省第一名，为四川省和三峡地区基层医疗单位培养了大批临床实用型人才。
尽管学生广布，执弟子之礼者众，但邦本先生均未正式以师承方式收徒为入室弟子，只有家族之中七弟郑祥本，侄女郑丽随其习医多年。至2000年，邦本先生从重庆三峡中心医院副院长岗位上卸职，方始担任第四、五、六批全国老中医药专家学术经验继承工作指导老师，受弟子行拜师之礼，正式招收入室弟子，悉心传授毕生所学，致力于高级中医药人才的培养。邦本先生培养的学术继承人张文涛、王顺德、胡波、徐冬、牟方政、胡江华等均成为优秀的中医药后继人才。其中张文涛、胡波获得博士学位，晋升副主任中医师。王顺德、胡江华晋升为主任中医师。王顺德入选中华中医药学会男科分会常委，中国性学会基层泌尿男科分会副主委，重庆市中西医结合男科专委会常务副主委，获中国男科2018年度人物奖。胡江华被评为重庆市优秀青年中医，担任国家中医重点专科学术带头人，万州区中西医结合肾病临床研究所所长，中华中医药学会肾病分会委员，重庆市中医药学会肾病专委会副主委，重庆市科协代表，入选万州区学术技术带头人、“平湖英才”“最美医生”。牟方政被评为重庆市优秀青年中医，担起了重庆三峡中心医院中医科主任的担子，当选中华中医药学会综合医院中医药工作委员会青年委员，万州区中医药学会副秘书长，万州区中医药学会治未病专委会副主委。
2016年，国家中医药管理局命名成立“全国名老中医药专家郑邦本传承工作室”。传承工作室成员有牟华明、牟方政、余宗洋、魏大荣、龚雪、杨昆、郑波、秦超、熊燕、漆辉莲、李柏群、张绍林等12人，他们均为重庆三峡中心医院、重庆三峡医药高等专科学校的中青年博士或硕士，是学有所成的临床、科研、教学一线的中坚力量。国家中医药管理局划拨工作经费50万元，单位配套50万元，共计100万元，以3年为期，专以培养中医后学，传承邦本先生中医学术思想和学术经验。