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1974年，国家实施振兴中医战略，创建四川省万县地区中医学校，在万县地区所辖九县一市各抽调两名专家参加筹建。正值壮年的邦本先生，作为奉节县的唯一代表成为万县地区中医学校的创建者之一，先后历任该校中医内科专业教师、教研室主任、教务处主任和教学副校长，潜心中医药教育事业18年。作为该校教学工作的负责人，他狠抓教学质量，倡导开门办学，对学生的中西医基础、诊断、内科、方剂和中药等课程考试考核十分严格。尤其重视理论教学与临床教学相结合，要求教师做坚持实践、疗效卓著的临床家，不做纸上谈兵的“文字之医”，并身体力行带头示范。该校教学质量在四川省同类学校中口碑很好，20世纪80年代，毕业生统考多次获全省第一名，为四川和三峡地区基层医疗单位培养了大批人才。因此，1989年邦本先生被四川省人民政府授予“优秀教师”称号。
邦本先生无论治学著述还是讲学授业，均严谨严肃、亲力亲为，说话行事一丝不苟，在师生中享有崇高声望。中医学校初创之际，生活工作条件极差，教材讲义多需亲手拟写。他长期担任《内经》《温病学》《中医学基础》《内科学》和《方剂学》等的教学工作，所需讲义大都亲手编撰。尽管所授内容早已烂熟于胸，但每逢授课，无论大课小课，他必定早早起床，再次浏览讲义，或默忆或诵读，谋篇布局了然于心，方仪容整洁、精神饱满地踏入教室。邦本先生授课气宇轩昂，声量宏大直透窗外，抑扬顿挫极具感染力。万县地区开办过两届西学中班（每届一年），参加者均为临床经验丰富的高年资西医专家，邦本先生主讲中医基础理论和临床课程，将深奥玄妙的中医理论化为深入浅出的讲授，理论与临床信手拈来，中医西医相互参详，深受这些西医专家的好评。
邦本先生重视勤学苦读，终身手不释卷，笔耕不辍，并在青年时期就展示出中医理论学习的扎实功底。1964年四川省卫生厅选拔一批医生到重庆中医进修学校参加中医进修班学习一年，邦本先生以全川第一名的考试成绩入选；1981年入湖南郴州地区卫生学校举办的“全国中等卫生学校中医经典著作医古文师资班”学习一年，成绩均位居前列。1987年7月，他参加在成都举行的中日青年中医学术交流会，论文收入《中日青年中医论文选》，在国内外公开发行。邦本先生还参加中华全国中医学会中医理论整理研究会组织编写的《痹病论治学》《感冒病临床治疗学》《中医男科临床治疗学》和《中华临床药膳食疗学》等4部专著的编审，并担任《感冒病临床治疗学》副主编。他还担任国家和四川省中医中专统编教材《中医学基础》《古典医著选》的主编和审订工作，并参加《中医精华浅说》《重庆名医证治心悟》等6部专著的写作。他为名老中医郑惠伯主任医师总结临床经验10万字，其中有的医案被《中国现代名老中医医案精华》等收录；有的专论被专业书刊选用。邦本先生公开发表论文50余篇，公开出版和发表的著述共计100万余字。
20世纪80年代，为支持地方企业出口创汇，邦本先生还为万县地区罐头厂、万县地区糖果厂设计“参芪炖羊肉罐头”和“天麻软糖”“首乌软糖”配方，产品出口香港地区及东南亚国家，受到外商欢迎。
1991年，惠伯老入选首批500名全国老中医药专家学术经验继承工作指导老师之一，邦本先生再次成为惠伯老钦点之弟子。为更好地继承、整理和发扬惠伯老的学术经验，邦本先生于1992年由万县地区中医学校副校长调任万县地区人民医院副院长，主要转向中医临床科研和医院管理。1998年后专门从事医教研工作。
邦本先生在忙于公务的同时，仍然坚持一边出门诊，一边带学生，一边著述。一周三次门诊雷打不动，治愈疑难杂症无数，求医问药者众多，医名卓著。1993年，郑惠伯、郑邦本、郑家本叔侄三人同时获得国务院政府特殊津贴，“郑氏三杰”成为国内中医界的美谈。新华社为此发了专稿，《健康报》《中国中医药报》《四川日报》和四川人民广播电台等多家媒体都做了报道。
夔门郑氏温病流派肇始于仲宾，形成于惠伯，光大于邦本、家本、祥本、建本、光富。早年以川东夔门为基点，后逐渐以万州和成都形成集中性影响。百余年来人才辈出，门风谨严，惠伯先生医术传承者皆为子女、侄婿，医学传承以家族谱系内部传承为主。诸子侄皆服务于中医教育和医疗机构，以教书传道授业和临床为己任。
尽管执弟子之礼者众，但均未正式收徒为入室弟子。至2000年，邦本先生从重庆三峡中心医院副院长任上卸职，方始担任第四、五、六批全国老中医药专家学术经验继承工作指导老师，受弟子行拜师之礼，正式招收入室弟子，悉心传授毕生所学。每批两人，一届三年。弟子均经过严格遴选，皆为具有中医院校本科以上学历，年龄45岁以下，8年以上中医临床工作经验，主治中医师以上技术职称，跟师考核合格和通过学位论文答辩后，由成都中医药大学授予博士学位或硕士学位（师承制）。邦本先生的跟师弟子中已有两人获得博士学位（另有两人在读博士），两人晋升主任中医师。
2016年，重庆市卫生局、重庆三峡中心医院重托盛邀，成立“全国名老中医药专家郑邦本传承工作室”。传承工作室成员12人，国家中医药管理局拨工作经费50万元，单位配套50万元，共计100万元，专以培养中医后学，传承邦本先生中医学术经验。
2016年，“渝东郑氏温病学”被评为万州区非物质文化遗产代表性项目；2019年，“郑氏温病治疗法”被评为重庆市非物质文化遗产代表性项目。