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卡若文化和曲贡文化在文化性质、年代和地域上都有明显区别，但是它们也有不少相似之处。对于卡若与曲贡文化的异同，通过石器和陶器我们比较的结果是这样的：
首先，两个文化的打制石器有相同的技术，都采用石片石器的预加工技术，曲贡文化的技术更为成熟，运用也更为广泛。石器器型也有不少相同或相似，如一些类型的斧形器、切割器、尖状器、敲砸器、刮削器、石刀、石矛、重石等都见到类似的器型。但是曲贡文化极少磨制石器和细石器发现，并不典型的细石器标本在数量上仅占全部石器的 3.2% ；卡若文化的磨制石器数量稍多，细石器标本非常典型，而且数量也比较多，占到全部石器的 10.8% 。
其次，两个文化的陶器装饰手法有相似的传统，都采用有刻划、剔刺和压印手法。装饰纹样也有雷同，如两个文化都见到菱格纹、重菱纹、三角折线纹、涡纹和剔刺纹等。
两个文化的陶器群不同，器型区别较为明显。曲贡文化陶器以圜底带耳器和圈足器为主要造型特征，不见平底器；卡若文化陶器以小口鼓腹平底少耳为主要造型特征，不见圈足器和圜底器。在装饰风格上两个文化也表现有明显的区别，如曲贡文化陶器质地细腻，器表光滑，纹饰较为简练，少见复合纹饰，不见彩陶，有精致的磨花工艺；卡若文化陶器质地粗糙，纹饰草率繁复，复合纹样较多，有彩陶，有曲贡文化陶器所不见的绳纹、篮纹、篦纹等。
将这两个文化的异同合并起来观察，我们对高原新石器文化就有了较为清晰的印象。当然，从卡若到曲贡，远不是西藏史前文化的全部，也不是西藏新石器文化的全部，这一地区的文化发展序列还不清楚，即便这两个文化的源流也并没有机会考察清楚。
在雅鲁藏布江中游地区，虽然发现了一些打制石器和细石器地点，有一些可以肯定属于旧石器时代和早期新石器时代，但由于缺乏科学发掘过程，还不能就这些地点的石器标本进行准确的分期，所以一时还不能确知早期和中期新石器文化面貌是怎样的，因此关于这个地区新石器文化的发展序列，目前暂时还没能建立起来。正因为如此，曲贡文化和卡若文化的来源一时也就不能准确说明。这样就提出了一个非常重要的学术课题，应当尽快建立起西藏地区新石器文化序列。在卡若文化和曲贡文化分布地域以外的地区，新石器文化的面貌也还不是很清楚，一些零星的发现尚无法构建起初步的文化体系，所以填补这大面积的区域空白，就成了又一个重要的学术课题。只有在这样的时空缺陷得到填补以后，在西藏考古获得更多新的关键性资料以后，我们对西藏地区新石器文化的了解才会更准确一些，也更全面一些。