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随着抗日战争形势发展的需要，115 师及 343 旅的壮大，为建设更多更大的敌后抗日根据地，中央军委适时指示，将红军改编的 343 旅等抗日主力，作为一粒粒种子，分散到各地组织更大的抗日力量。于是，分兵，是 343 旅等抗日骨干部队势在必行的了。
第一次分兵是在山西五台，根据毛泽东 1937 年 10 月 20 日指示，115 师将一分为二，林彪率主力南下驰援娘子关方面友军，聂荣臻留下开辟晋察冀抗日根据地。
这一次分兵，343 旅有 2 个连加旅机关一部分留下，跟随聂荣臻开辟晋察冀抗日根据地；343 旅的主力由陈光率领随 115 师南下。
之后，343 旅陆续分兵。
1938 年 6 月，八路军 115 师 685 团工兵营和部分地方武装，组成永兴支队，由曾国华率领挺进冀鲁边区。
8 月，343 旅司令部、政治部机关和部分干部由肖华率领，挺进冀鲁边，统一领导武装斗争。
10 月，685 团由团长彭明治（杨得志已升任 344 旅代旅长）、政委吴法宪率领挺进到山东微山湖以西地区。
1938 年 11 月 25 日，中央军委命令 115 师部率 343 旅进入山东及淮北的新老黄河间（包括津浦铁路东、西，胶济铁路南、北的广大地区）。
12 月 27 日，师之先头部队第 685 团，进入苏鲁豫地区（后改称湖西地区），与原来在该地区活动的挺进支队合编，改称苏鲁豫支队，支队长彭明治，政委吴文玉，副支队长梁兴初，下辖 4 个大队。
12 月，师部率领 686 团从晋西出发向山东挺进。
留下第 343 旅新建之补充团与晋西省委所属的 3 个游击大队合编成师晋西独立支队，支队长陈士榘，政治委员林枫，副支队长黄骅，政治部主任王麓水，下辖第 1 团，团长邓克明，政委符竹庭；第 2 团，团长何以祥，政委曾明桃，坚持吕梁山地区的斗争。
这样，343 旅就像地瓜秧，被一再分开，越长越茂盛，并主要在山东开花结果。343 旅的领导在上述分兵变化的过程，也相应不断调整变化。
1938 年春，第 343 旅仍由肖华任政委，李天佑为副旅长，陈士榘仍为参谋长。所属之685、686 团分别由吴文玉、杨勇任政委；并成立了独立团，团长邓克明，副团长杨忠；补充团，团长彭雄，政委王麓水。
1940 年 4 月，在鲁西北地区组成鲁西军区，由第 343 旅肖华兼任司令员和政委，杨勇任343 旅旅长兼军区副司令员。下属以支队长彭雄、政委张国华副支队长邓克明、率领的黄河支队；支队长曾国华、政委王叙坤率领的运河支队；何光宇率领的泰西支队。并统一指挥周贯五、陈兴、杨承德率领的津南支队；杨忠，龙书金率领的鲁北支队。
11 月，第 343 旅旅部和运河支队改编为第 115 师教导第 3 旅，并兼鲁西军区；黄河支队改编为教导第 4 旅。