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进口法检货物应凭检验检疫机构签发的通关单办理海关通关手续。对跨境电商零售进口政策明确了跨境电商商品货物属性的，检验检疫机构应依法签发通关单。
为提高跨境电商商品通关效率，相关部门在通关单管理上采取了相应的便利措施。一是通关单仅针对跨境电商零售进口中的网购保税商品，而对跨境电商零售进口中的直购商品，免于签发通关单。二是将通关单的签发环节设定在“一线”，避免在“二线”出区时对小包裹逐个签发通关单，缩短通关时间、降低企业成本。三是实施通关单联网核查，检验检疫机构将通关单电子数据直接发送海关，尽最大可能实现通关单无纸化，进一步提高通关效率。四是清单内仅有约 36%的编码在“法检目录”内，需要凭通关单验放，其余都不需要通关单即可办理海关通关手续。