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第一节
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《诸病源候论》曰：“肠痈者，由寒湿不适、喜怒无度，使邪气与荣卫相干，在于肠内，遇热加之，血气蕴积，结聚成痈。热积不散，血肉腐坏，化而为脓。”这里指出了气候、生活方式、情绪可作为肠痈的发病原因。这种认识与西医学对克罗恩病的流行病学认识相似，随着生活方式、饮食结构、精神压力的改变，克罗恩病的发病率也呈现不断升高的趋势。
《太平圣惠方》曰：“夫肠痈者，由寒温不适、喜怒无常，使邪气与荣卫相干，在于肠内，遇热加之，血气蕴积，结聚成痈。热积不散，血肉腐坏，化而为脓。其病之状，肠重而微强，抑之即痛，小便数似淋，时时汗复恶寒，其身皮皆甲错，肠皮急如肿状。诊其脉洪数者，必已有脓也；其脉迟紧者，未有脓也。甚者腹胀大，转侧闻水声，或绕脐生疮，而穿脓出，或自脐中脓出，或大便去脓血。唯宜急治之。又云：大便脓血，似赤白下者，是肠痈也。卒得肠痈，而不晓治之，错者不少。寸口脉滑而数，滑则为实，数则为热；滑则为荣，数则为卫。卫下降，荣上升。遇热则荣卫相干，血为独惫。小腹痞满，小便或难，汗出或复恶寒，脓为已成。设脉迟紧，聚为瘀血，血下则愈。脓成引白，又诸浮数脉，当发热而反淅淅恶寒。若有痛处者，当积有脓。”指出了肠痈与寒温不适、情志喜怒、邪热相加等因素相关。现代研究发现，情绪因素在克罗恩病的发病中也起了一定作用，反之，克罗恩病本身也会导致患者产生不良情绪，对疾病产生不良影响。情绪干预对克罗恩病的治疗有重要意义，良好的情绪干预可提高克罗恩病患者的生存质量。
《圣济总录》曰：“肠痈由恚怒不节，忧思过甚，肠胃虚弱，寒温不调，邪热交攻，故营卫相干，血为败浊，流渗入肠，不能传导，蓄结成痈，津液腐化，变为脓汁。其候少腹硬满，按之内痛，小便淋数，汗出恶寒，身皮甲错，腹满如肿，动摇转侧，声如裹水，或绕脐生疮，脓从疮出，或脓出脐中，或大便下脓血，宜急治之，不尔则邪毒内攻，腐烂肠胃，不可救矣。”这里也指出了不良的情绪、寒热不调、邪热交攻等是克罗恩病的发病原因，而胃肠虚弱是发病的基础。
《全生指迷方》中对“瓜子汤”的论述为：“治肠头如以针刺，连谷道。又因痔痛，小便如淋状，时寒时热，此由产时用力，气并肠间。亦由阴虚，邪热乘客留聚肠间，热结恐成肠痈。”由此可知，产时用力耗气、阴虚、邪热均可作为肠痈的发病原因。
《严氏济生方》曰：“夫大便下血者，多因过饱饮酒，无度房室，劳损荣卫，气虚风冷易入，邪热易蕴，留注大肠则为下血。血色鲜者风也；色如小豆汁者寒也；浊而色黯者热也。久而不愈，必为痔漏之疾矣。”痔漏一般不直接起病，而多由于大便下血日久不愈发展而成，其病因包括过饱饮酒、无度房室。而克罗恩病瘘管病变一般也是病情日久发展而成，与饮食劳倦有密切关系。
《活人事证方后集》曰：“辨肠风、痔漏、下血证候，夫有五痔，人奏圊则下血，或点滴，或迸箭，或清或浊。面黄唇白，心忪脚弱，头目眩晕。此因饱食、坐久、肠癖所为。亦有饮酒、房室过度所致。世医多指此为肠风脏毒，然肠风脏毒，自属滞下门，脏毒即是脏中积毒；肠风即是邪入脏。纯下清血，谓之风利。今五痔下血，乃是酒痔、脉痔，其血自肛门边别有一窍，如针孔大，滴淋而下，与泄物不共道，不可不知。”该段文字论述了肠风、痔漏、下血的鉴别，并且指出病因为饱食、坐久、肠癖、饮酒、房室过度。还详细描述了痔漏的特点，即“自肛门边别有一窍，如针孔大，滴淋而下，与泄物不共道”，这些描述与体表漏道的特点是吻合的。
《症因脉治》曰：“肠痈腹痛之因：或膏粱厚味，蕴积肠胃；或劳动跌仆，损伤气血；或六淫之邪内伏，或恼怒郁结，气血凝聚；或偶有他病，误用温热补塞之药，亦能成痈。”这段文字对肠痈腹痛的原因归纳如下：饮食不当、劳伤气血、外感而伏于体内的邪气（伏邪）、情绪因素、治疗因素。而克罗恩病发病则与饮食、情绪、药物有相关性。
《赤水玄珠·肠痈门》曰：“夫肠痈者，乃阴阳偏胜，喜怒无时，伏于脏腑之中，结在肠胃之内，血凝气滞，回旋失度，不能通行，聚结成痈，致生肿痛。”指出了阴阳偏胜、喜怒无常对肠痈的影响，可理解为气候因素与情绪因素是肠痈发病的原因。
《普济方》曰：“神效散治洗痔。凡富贵之人，多因嗜欲、酒色过度、喜怒不常，致生痔漏；或如鼠乳连珠，或粪门肠头肿，流脓漏血，其痛如割，不可忍者，但是诸肿痔漏及肠风下血，此药治之。”这段文字论述了痔漏的病因及临床表现，并指出神效散可治之。另外，书中还有论述“夫痔漏盖缘寒湿与夫房室醉饱间得之”，指出了寒湿邪气也是痔漏发病的原因之一。
《奇效良方》曰：“经曰：风客淫气，其精乃亡，邪伤肝也，因而饱食，筋脉横解，肠澼为痔。盖缘风气通于肝，肝生风，风生热，风客则淫气伤精，精亡则邪热伤肝，因饱食行房，则筋脉横解，而肠澼痔漏生焉。”这段文字指出风气侵袭、伤精、饱食行房等皆为肠澼痔漏的病因。
《寿世保元》曰：“夫痔漏之原，由乎酒色过度，湿而生热，充乎脏腑，溢于经络，坠于谷道之左右，冲突为痔，久而成漏者也。”这段文字论述了痔漏的病因，即酒色、湿热影响脏腑经络，病情日久不愈而发为痔漏。
《古今医统大全》曰：“初生肛门成不破者，为痔，久而破溃，脓血黄水浸淫，淋沥不止者，曰漏。此疾者皆由湿、热、风、燥四气相合而致之也。盖因人之纵欲恣饮，喜怒无常，脏腑抑郁，饮食自倍，肠胃乃伤，阴阳不和，关格壅滞，热毒下注，血渗大肠，而为肠澼痔漏之患矣。”该段文字指出湿、热、风、燥四气合而致病，主要是由于纵欲恣饮、喜怒无常、脏腑抑郁、饮食自倍等因素导致脾胃损伤，阴阳不和。另有论述：“妇人患痔病，与男子少异，多是房劳所伤，及酒毒流积而成，及长年久坐以攻女工者，得之为异耳，其余则皆同于男子而治之可也。其五种之状，并载男子痔漏门。”指出了妇人患痔病的原因与男子有不同。
《丹台玉案》曰：“夫痔，不分男妇小儿皆有。缘富贵之家多患此疾，皆因嗜饮曲酒，过贪色欲，并厚味肥甘、椒姜炙爆等物，以致湿热流注大肠之经，积而成痔，蕴蓄日久，则变为漏矣。”指出富贵人家并多食膏粱厚味之人容易得本病。
《医学入门》曰：“五痔原因食色伤，经曰：因而饱食，筋脉横解，肠癖为痔。盖饱食则脾不能运，食积停聚大肠，脾土一虚，肺金失养，则肝木寡畏，风邪乘虚下流，轻则肠风下血，重则变为痔漏。或醉饱入房，精气脱泄，热毒乘虚下注；或淫极入房过甚伤筋，忍精停毒，甚则以男交男，致伤膀胱与肾肝筋脉。盖膀胱筋脉抵腰络肾，贯臀走肝，环前后二阴，故痔乃筋脉病，发则面青痛甚，肝苦急也。”指出本病由脾土不足，肝木风邪下侵而发，认为痔属筋脉病，因为发病时面青，且疼痛明显，是由于肝苦急也。
《儒医心镜》曰：“痰者，人身之痰贵乎顺行，随气升降，无处不到。设若气逆，阻其道路，为喘，为咳，为呕哕，为眩晕，为惊悸，为健忘，为不语，为狂言，为癫呆，为厥逆，为怔忡，为嘈杂，为串痛，为糜，为流注，为肿块，为痰核，为痰气，为痰结，为痰燥，为痰话，为痰闷，为痰火，为寒，为热，皆是痰之为患。”“百病多由痰作祟”，痰留体内可导致多种病变，本段论述也指出了气滞痰阻可导致流注，这种认识也为临床治疗提供了新的思路。
《外科枢要》曰：“流注，或因饮食劳倦，脾胃伤损；或因房劳阴虚，阳气凑袭；或因营气不从，逆于肉理；或因腠理不密，外邪客之；或暴怒伤肝；或郁结伤脾；或湿痰流注；或跌扑血滞；或产后恶露；皆因气虚血注而凝也。或生于四肢关节，或生于胸腹腰臀，或结块，或漫肿，或作痛，皆由元气亏损所致也。”这段文字从内外因的层面阐述了流注的产生，外因较多，且流注发生部位及形态也多种多样，但均以元气亏损为发病基础，强调了流注发病内因的关键性。
《医灯续焰》曰：“肠痈者，肠内生痈也。大肠、小肠皆有之。大抵得之不节饮食、不适寒温。或积垢瘀凝，或败血留滞。壅塞不行，久郁化热，久热腐脓，而痈斯成矣。如小腹肿痞皮急，按之则痛，小便数如淋，或复自调，时或发热，或自汗恶寒，身如甲错。外无热，内无积聚而见上证者，皆肠痈之候也。甚者腹胀大，转侧有水声。或绕脐生疮，或脓自脐出，或大便出。”文中指出肠痈的病因为饮食不节、不适寒温、积垢瘀凝、败血留滞。现代研究发现，克罗恩病发病与饮食所致的积滞内停有重要的相关性。
《简明医彀》曰：“经曰：精气夺则虚，邪气盛则实。流注之证，因于怒气郁结；或湿痰流积，或饮食劳倦，脾胃伤损；或房室阴虚，阳气凑袭；或腠理不密，外邪客之；或闪肭折挫，跌扑血滞；或脾虚气弱，风湿相搏；或伤寒失汗，邪留经络；或荣气不从，逆于肉理；或产后败血，流入关节，皆能致此。”此段论述情绪、痰湿、饮食、房室、体质外伤、误治等众多致病原因。
《重订通俗伤寒论》曰：“大凡风寒留于经络，无从发泄，往往变为痈肿，上为发颐，中为肺痈、肝痈、痞积，下为肠痈。”指出了外感风寒邪气，郁于体内，无从发泄，内侵于肠则发为肠痈，论述了外感与肠痈的关系。
《医方絜度》曰：“古语云：膏粱无厌发痈疽。此指外疡而言也。然肠痈一证，亦因膏粱积热者多，又或妇女经停，气血壅滞，亦能致此。”这说明膏粱积热是肠痈发病的一个重要原因。西医学认为，饮食结构是克罗恩病发病的重要因素之一，尤其以欧美地区的饮食结构为主，其中高脂肪、高糖、高蛋白质饮食可能是最重要的影响因素，而这些与古籍中的“膏粱积热”类似。
《金匮要略广注》曰：“肠痈乃湿热瘀血，流入大小肠而成，其致病有男子暴急奔走，以致肠胃传送不能舒利，败血浊气壅遏而成者；有妇人产后体虚多卧，未经起坐，又或坐草艰难，用力太过，产后恶露未驱，以致败血停积，肠胃结滞而成者；有饥饱劳伤，担负重物，致伤肠胃，或醉饱房劳，过伤精力，或生冷并进，以致气血乖违，湿动痰生，多致肠胃痞塞，运化不通，气滞而成者，此生肠痈之由也。”这段论述指出了暴急奔走、产后体虚、劳力太过、饥饱劳伤、担负重物、醉饱房劳、过伤精力、生冷并进等均可导致肠痈之病，总结起来看就是劳逸不当、饮食不节是发病的重要原因，这与克罗恩病的现代病因认识有许多吻合之处。
《重订广温热论》曰：“凡伏邪留于隧络，深则入于脏腑骨髓之中，无从发泄，往往上为发颐肺痈，中为肝痈痞积，下为肠痈便毒，发于皮肉则为癍疹疮疡，留于关节则为痛痹拘挛，注于足胫则为鹤膝足痿，此等证候，皆络瘀为之也。精气旺则不发，至血气偶虚，或有所感触，虽数年之久，亦有复发者。”文中认为肠痈发病与伏邪相关，体内邪气深伏导致脉络瘀组，则可出现肠痈证候。我们知道，多数克罗恩病患者病程缠绵难愈，时有复发，此与伏邪的特点甚为相似。
《冯氏锦囊秘录》曰：“痈疽之生，始于喜怒哀乐之不时，饮食居处之不节，或金石草药之发动，寒暑燥湿之不调。阴阳不平而蕴结，荣卫凝涩而腐溃。轻者起于六腑，浮达而为痈，重者发于五脏，沉涩而为疽，浅者为疖，实者为痈，深则为疽矣。发于外者为背疽、脑疽、须眉等疽，发于内者为肝痈、肺痈、肠痈等痈。”指出了痈疽的发病原因与情绪、饮食、药物、天气、环境等有关。
《杂病源流犀烛》曰：“七曰肛内痈，俗名盘肛痈，生肛门口，乃蕴积热毒于大肠之间，或多食煎煿毒物，或湿热流注日深，皆致此症。”指出了煎煿毒物、湿热蕴积可作为肛痈的发病原因。西医学研究认为，烧烤、煎炸类食物多属于高脂肪、高蛋白食物，是克罗恩病的发病原因之一。
《神灸经纶》曰：“痔漏多由酒色过度，湿热充乎脏腑，溢于经络，下坠谷道之左右，冲突为痔，久不瘥变为漏也。《内经》所谓因而饱食，经脉横解，肠澼为痔。又谓少阴之复为痔。又督脉生病癃痔。”指出酒色湿热过度，充斥脏腑经络，郁于谷道而成痔，久病不愈而生漏，病变与少阴、督脉受损相关，不仅指出了发病的原因，也阐述了病位所在。
《证治汇补》曰：“肠风痔漏，久服寒凉，坐努下脱，久痢久泄，里急后重，窘迫下脱，男子房欲过度，产妇用力太早，小儿叫号伤气，俱有此症。”指出本病的发生与饮食、房劳及伤气等有关。
《济世全书》曰：“凡衣食丰饶之人患痔漏，必干于饮食、色欲所致，及有乘酒犯房。若要除根，必须服此滋阴内补药，宜戒酒、厚味，寡欲乃可也。”指出了衣食丰饶的人患痔漏原因与饮食、酒色、房事相关，并对治疗提出了大原则。此种认识主要针对特殊人群，临床上也有一定的指导意义。
《本草简要方》曰：“附子八物汤。附子（制）、人参、白术、当归、白茯苓、熟地、川芎、白芍（酒炒）各一钱。木香、肉桂、炙草各五分。水二钟，加生姜三片，红枣一枚，煎至八分，食远服。治房劳伤阴，外寒侵入而成流注者。”这段文字通过对附子八物汤的论述，指出了房劳伤阴加风寒外侵是流注的发病原因。
《不居集》曰：“流注之症，所因不一，皆因真气不足，邪得乘之，故气血凝聚为患也。然此症或生于四肢关节，或生于胸腹腰臀，或结块或漫肿，或痛或不痛。”这段文字论述了真气不足、外有邪乘的发病机制，指出了本虚是重要的发病原因，符合“邪之所凑，其气必虚”的中医发病观。克罗恩病患者一般存在营养不良情况，且体质较差，符合中医“正虚”的特点。
《金匮启钥》曰：“更有病名流注者，盖谓血滞而注也，其症多因脾虚食积而凝，或因闪跌，外为六淫所侵。”指出脾虚食积是流注的发病原因，外伤、外感也可导致流注发病。
《鸡鸣录》曰：“野云曰：此证善窜，故俗名疬串，与流注相似，皆肝热生痰，风激入络，结而成核。”这段文字通过对比论述疬串、流注，认为两者具有同样的病因：肝热生痰，风激入络。
病因又称为致病原因，它包括六淫、疠气、七情、饮食、劳逸、外伤、寄生虫、药邪、医过及先天因素等。大多数中医疾病的病因都有规律可循，如肺系疾病多与外感六淫相关，脾胃疾病多与内伤饮食有关等。但克罗恩病情况比较特殊，从前述的内容可以看到，在论述病因时，很多条文都是多个因素同时存在或者状态涉及多个病因的，可见克罗恩病的发生不是单一因素的结果，而是多因素影响的结果。现总结如下。
一是饮食不节。总结以上条文，可以看出饮食不节是提及最多的病因，毕竟本病以消化道症状为主，李东垣有“饮食劳倦，脾胃乃伤”之说，在古人的论述中，“膏粱积热”“煎煿毒物”“嗜饮曲酒”等因素非常常见，这些食物的共性是偏热性的。现代研究也认为，饮食结构的改变是克罗恩病发病的重要因素之一，其中高脂肪、高糖、高蛋白质饮食可能是最重要的影响因素。
二是寒温不适。寒温不适总的来说与外感六淫邪气有关，但并不完全等同。所谓六淫为非时之气，如六气的太过或不及，非其时而有其气，以及气候变化过于急骤的情况，多责之于外；寒温不适除了上述情况外，还有一种情况也比较常见，就是个体不遵四时气候之变化，穿衣覆被过多或过少引起病变，多责之于内。在六淫邪气方面，风邪、寒邪、湿邪最受古人关注。
三是情志失调。人体的情志活动与脏腑气血有着密切的关系，《素问·阴阳应象大论》说：“人有五脏化五气，以生喜怒悲忧恐。”可见情志活动的物质基础是五脏的精、气、血。克罗恩病患者多比较年轻，五脏气血未充，而且病程较长，身形瘦小，气血受损的情况比较明显，因此多伴有情绪方面的问题。反之，情绪不畅又会损伤五脏之精、气、血，使正气耗损，影响克罗恩病患者的恢复。现代研究发现，情绪因素在克罗恩病的发病中也起了一定的作用，良好的情绪干预可提高克罗恩病患者的生存质量。
四是正气亏虚。《素问·评热病论》指出“邪之所凑，其气必虚”。饮食不节、寒温不适、情志失调等在临床上是非常常见的病因，但克罗恩病的发病率很低，换言之，并非所有的有上述病因的患者都会发生克罗恩病，所以体质因素应该是本病发生的核心问题。现代研究也发现，本病的发生与遗传基因有一定的相关性。
五是房劳纵欲。古籍中认为痈疡的发生与房劳有很大的关系，相关的描述也非常多，如“过贪色欲”“无度房室，劳损荣卫”“醉饱房劳，过伤精力”。这一认识的来源与古代医家注重修身有关。克罗恩病的发病年龄一般在18岁左右，而且在儿童中也有相关的病例报道，房劳之说应该与本病的发生关系不够密切，但房劳多伤肾，而小儿“肝常有余，脾常不足，肾常虚”，如果从肾虚这个角度切入，或许能够找到共同点，这也是临床医生应该关注的地方。
六是伏邪为患。伏邪是指感而不随即发病，而伏藏于体内的病邪。伏邪致病多病程较长，缠绵难愈，随外感而发，比较典型的伏邪是哮喘病人的伏痰。关于克罗恩病的伏邪问题现代研究不多，但现代病理研究发现，克罗恩病患者存在肠系膜微循环障碍的问题，这与《赤水玄珠·肠痈门》所言“夫肠痈者，乃阴阳偏胜，喜怒无时，伏于脏腑之中，结在肠胃之内，血凝气滞，回旋失度，不能通行，聚结成痈，致生肿痛”的认识非常相似。从本条文分析，此伏邪应该与瘀邪有关。除瘀邪外，《症因脉治》提出“六淫之邪内伏”，但未提及具体以何种邪气为主。克罗恩病属于终身性疾病，有缓解期和活动期，疾病活动容易受到外界诱因的影响，这些疾病特点与中医“伏邪”的认识有相似之处，因此，伏邪方面的中医研究有待加强。
《四圣心源·痔漏根原》认为“痔漏者，手太阳之病也。手之三阳，自手走头，足之三阳，自头走足。手三阳之走头者，清阳之上升也，足三阳之走足者，浊阴之下降也。足三阳病则上逆而不降，手三阳病则下陷而不升”。根据圆运动的原理，太阳主升，阳明主降，太阳不升，则阳明不降，手太阳升发不及，则手阳明顺降失权，从而变生痔漏之证。
《素问·厥论》曰：“少阳厥逆，机关不利。机关不利者，腰不可以行，项不可以顾，发肠痈，不可治，惊者死。”指出了少阳厥逆、枢机不利可导致发肠痈。而《黄帝素问直解》中则对上述条文进行了解释：“少阳经厥气逆，则枢转有乖，故机关不利。申明机关不利者，病于下，则腰不可以行，病于上，则项不可以顾；不能枢转从外，则发肠痈，发肠痈则内郁之气，从痈而泄，不可治。少阳之主病，当治阳明之肠痈。若治少阳，虚其旋转之气，神机内乱，而发惊，枢将折也，故死。此少阳厥逆病能，发于阳明，当治阳明，故不言治主病者。”认为肠痈是少阳枢机不利导致上下皆病，内气郁闭不通，郁热腐蚀成痈所致。
《世医得效方》曰：“肠痈乃荣卫相干，气为败浊，小腹如肿，大小便或涩，或复汗出，或复寒热是也。若腹皮急，按之濡，身无热，乃阴冷所成；小腹坚痞，按之痛，身有热，乃结热所成。”指出了本病荣卫失调，寒热失调，阴冷热结的病机特点。《古今医统大全》曰：“此证皆因荣卫不调，或瘀血停滞所致。”此条论述与《世医得效方》认识基本一致。《类证治裁》也认为：“肠痈之脉滑而数，滑则为实，数则为热；滑则为营，数则为卫；卫数下降，营滑上升；营卫相干，血为败浊。”
《金匮玉函经二注》曰：“血积于内，然后错甲于外，经所言也。肠痈何故亦然耶。痈成于内，血泣而不流也。唯不流，气亦滞，遂使腹皮如肿，按之仍濡，虽其患在肠胃间，究非腹有积聚也。外无热而见数脉者，其为痈脓在里可知矣。”可见血滞不流，气滞胃肠，即血瘀气滞是肠痈的主要病机。《医方集宜》也认为“肠痈者，是气血凝于肠胃之间，结而不散，发为痈肿”。《金匮悬解》也有“肠痈者，痈之内及六腑者也。血气凝涩，外不华肤，故其身甲错。肠胃痞胀，故腹皮紧急。壅肿在内，故按之濡塌。形如肿状，其实肌肤未尝肿硬也。病因肠间痈肿，腹内原无积聚。瘀热在里，故身上无热，而脉却甚数，此为肠内有痈也”的论述。《灵枢·痈疽》曰：“寒邪客于经脉之中则血涩，血涩则不通，不通则卫气归之，不得复反，故痈肿。寒气化为热，热胜则腐肉，肉腐则为脓，是痈成为热，而其先则寒也。寒非得湿则不凝，薏苡附子败酱散，薏苡去湿而消滞，败酱破血而宣壅，附子温寒而散结也。”认为血气凝涩，瘀热在里，先寒后热，寒热错杂是本病的病机。《本草纲目》也认为“大抵痈疽流注，皆是气血凝滞所成，遇温则散，遇凉则凝”。
《曹沧洲医案》曰：“肛痈：大肠湿热下注，渐成肛痈，不易速效。”认为大肠湿热是病机关键。《一见能医·病因赋下》也认为：“湿热之气，下迫大肠，以致经脉横解，为痔漏之病。”《吴氏医方汇编》曰：“夫肠痈者，湿热瘀血流入小肠而成。”论述了肠痈与湿热、瘀血相关，病位在小肠，其机理是湿热、瘀血阻闭小肠气机，郁而化热，腐蚀肌肉而成。《高注金匮要略》曰：“小肠之痈，起于阳虚，不能运水而聚湿，湿久则生虚热，湿热交蒸于小肠，则肠中之气血壅塞，而拥起成痈矣，大肠闭结，而其气积热，气热而郁滞，则血不流行，故痈。此前后两方，一系责阳虚，而除湿热；一系责血热，而攻气滞之不同也。小肠紧承胃之下口，其气虚寒，则不能胜湿而化热。小肠湿热，则上逼胃中，胃土外应肌肉，湿热熏蒸，则血色不化，故身必甲错。湿热外浮，而腹与小肠为尤近，故其皮如急状，盖湿鼓而腾热之应也。然湿热蒸腹皮，而痈肿在肠内，与皮内肠外之空处无涉，故按之濡，腹如肿状，而实非肿者，此也。夫腹中有积聚，则气机之往来短促，而脉数于里者有之。身有表热，则阳浮气胜，而脉数于表者有之。若俱无此，而脉见数，则数为气血不通，而热聚搏激之应，以症准之，则为腹内痈脓无疑矣。”认为大肠与小肠之痈是不同的两种状态，小肠痈应以清湿热为主。《普济方》从外邪的角度来论述湿热的病机：“夫五痔之疾，或出鼠乳，或发寒热，或生疮，或痒痛，或下血，其证不一。治之不早，劳伤过度，则毒气浸溃，肌肉穿穴，疮口不合，时有脓血，故成痔漏。经曰：痔久不瘥，变为漏是也。肠风痔病者，所发手太阴手阳明经，以应动脉。谓肺与大肠为表里，为传道以行糟粕。肠风痔疾有五种，其证亦异。盖阳气虚而元府疏，风邪乘而热自生。风湿邪热，攻于肠中，致使大便涩而燥热郁血。热散而流溢，冲侵肠里。故以先血后便为热在下，先便后血为热在上。久而不愈，乃作痔。《素问》云：因而饱食，筋脉横解，房室劳伤，肠癖为痔。盖以风热不散，谷气流溢，传于下部，故令肛门肿满，结如梅李核，甚者变成而为漏也。方猬皮丸（出《济生方》）治五种痔漏。”《疡科心得集》则从肺与大肠的相互关系上论述了湿热的病机：“夫大肠生痈者，或其人平素醇酒炙煿，湿热郁蒸，相傅受伤，肺气不能宣降，致湿热下注，壅遏气血而发（肺与大肠为表里，肺伤则湿热下注于大肠而生痈也）；或由七情所伤，饥饱劳役，担负重物，致使气血乖违，湿动痰生，肠胃痞塞，运化不通而结。”认为湿热郁蒸，肺失宣降，湿热下注大肠，气血壅滞是本病的病机关键。而《陈莘田外科方案》认为在湿热为患的基础上，还存在真阴不足的问题：“真阴亏损，湿热下注，结为肛痈；阴虚肺热，下移大肠，遂生肛痈；肝肾阴虚，湿热下注，肛痈成漏，绵延半载；咳嗽经久，肺热下移，大肠结为肛痈，溃脓之下，坚肿未化，最虑淹缠成漏。”《爱月庐医案》也有类似的观点：“体归阳盛，诚为松柏之资；质本阴虚，未得涵濡之用。况乎权操国政，地僻事繁，条教所施，悉本精神所注。即使节性提躬，怡情静养，犹惧不济，而复加以湿温久扰，则虚者愈虚，余湿不能尽化，注于会阴之间，酿成肛痈之候。”认为阴虚湿热同时为患为本病的病机。
《验方新编》曰：“流注发无定处，如块如核，漫肿无头，皮色不变，或痛或不痛，久则破而流走是也。若忽然身生疙瘩，红肿游走，名游风丹毒，与此不同，不可误认。此症毒发阴分，因痰塞清道，气血虚寒凝结，一曰寒痰，一曰气毒。”痰塞清道，气血虚寒凝结于阴分，故发为流注。《医门补要》曰：“风寒与痰湿，走窜脉络，结为流注，愈者将愈，发者又发，延绵不已，多进阳和汤可效。若皮色红者，不可用热药。”也认为本病的发病与风寒痰湿郁结于脉络有关。但从条文的主题来看，与痰邪有关的条文都与“流注”相关，所以痰邪为患不一定是克罗恩病的主要病机，而可能是其并发症的主要病机之一。
木火刑金是根据五行学说产生的术语，在中医学中的一般认识是指肝火旺盛损伤肺金，而产生咳嗽、胸痛、口干、心烦等症状，与胃肠关系不大。其实不然，本病病位在大肠，大肠属于庚金，所以肝木火旺，不仅会影响肺，还会影响大肠。《奇效良方》认为“然此诸证，皆本之于大肠也。大肠者，庚金也，本性燥清，肃杀之气，本位主收，所司主行津液，以从足阳明中州土之所化，若旺则能生化万物，而衰则损伤万物，故云万物生于土而归于土，此之谓也。然手足之阳明，同司其化焉。若人醉饱行房，精气脱泄，其脉空虚，酒热之毒，流着于脉；或因醉饱，淫极而强忍泄；或用药固其精，弗能泄越，停积于脉，归注大肠，以致木乘火势，而侮燥金，以火就燥，则大便闭而痔漏作矣”。