每一个有机体中都有着叫作“微生物组”的微生物群殖民者。植物中到处都是微生物组——种子、果实和叶子的微生物组。我们的身体里有超过100万亿的微生物。它们生活在我们的皮肤上,我们的嘴巴、鼻子、耳朵、食道、胃里和我们肠道里。它们拥有扩展人类基因功能的特殊基因,能够帮助身体代谢保护它。科学家将这个充满活力的微生物群落称为微生物群,也称菌群,其全部基因就是微生物组。肠道中的微生物帮助我们消化难消化的食物,皮肤上的微生物则会让病原体远离我们。
我们所吃的东西滋养着我们肠道中的微生物。如果我们吃糖,就是在喂养发酵糖的微生物,增加它们的数量。所以我们的食物选择会影响微生物的种群动态,从而会影响我们,因为不同的微生物会产生不同的必需维生素、激素和神经递质。