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环境与资源保护法学是一门关于方法论的学问。由于环境与资源保护法学具有明显的交叉学科的特点，因此，应当运用各种社会科学和自然科学的研究方法，对环境法学进行跨专业、跨部门的研究。作为法学的一个分支学科，各种法学方法当然适用于环境法学的研究，如哲学分析方法、价值分析方法、比较分析方法、历史分析方法。除了法学的方法以外，其他社会科学的方法，尤其是经济学的方法、社会学的方法，也应渗透到环境法学的研究中去。同时作为一门与环境科学交叉的法学学科，许多自然科学的研究方法，诸如系统论、信息论、控制论等也有助于环境法学理论的发展与革新。