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12月上旬，桂系部队在广西境内被全部歼灭后，白崇禧赖以生存的老本已经输光，也已经没了立锥之地。由于他屡次拒绝中共的争取，留在大陆的道路已被堵死，摆在面前的只有两条路：第一是去台湾“归队”，第二是像李宗仁那样，移居海外。
12月10日，两位不速之客抵琼来到白崇禧住处，他们是“陆军副总司令”罗奇与前军政部军需署长陈良，陈良带来了黄金数万两，说是清还所欠华中部队的军饷，罗奇则是奉蒋之命请白赴台与蒋“共商善后”的。并暗示白崇禧，蒋有意让其出任“行政院长”之职。这对白是极具诱惑力的。当然，白心里清楚，他现在无一兵一卒，光杆司令一个，老蒋与他“共商善后”是假，到台北“劝进”是真。因为蒋介石早已迫不及待地要复位了。
尽管如此，白崇禧还是不放心，随即派李品仙飞台谒蒋，刺探蒋之真实意图。李到台后不久即回电，说蒋介石真心请白出来“组阁”，蒋介石的敦促电报也随之而来。
白崇禧临行前，其多年至交“立法委员”何遂劝其慎行，白说：“我自追随蒋公北伐以来，殆逾二十载，既处遇顺境，亦处遇逆境，一生一世历史第一，我必对历史有所交代，生死利害，在所不计，君勿为此喋喋也。”
12月30日，白崇禧乘机抵达台湾。
白崇禧到台湾之后，立刻明白了蒋介石的所谓“共商善后”以及“行政院长”的允诺，都不过是甜蜜的诱饵。心里难免惴惴不安。但还是在台南盖了两栋房子，将家眷20多人从香港接到台湾，包括大哥、二哥、四弟和二妹，让亲属们住在两幢大房子里，他自己一家住在台北一幢旧式平房中。
白崇禧之所以这样做，其目的十分明确。当时台湾一片混乱，经济落后，物质生活贫乏，很多人到台后又悄悄去了美国、日本、泰国或香港等地，而他却把亲属从香港全部搬到台湾，尽管很多朋友对此举甚为不解，但白知道，蒋介石当会看明白，他此时对蒋介石的效忠何等死心塌地。
尽管蒋桂争斗多年，特别是在淮海战役中白对蒋的公开对抗，在蒋陷入危机时的再度“逼宫”，令蒋介石衔恨至深。但白崇禧自负地认为，蒋介石不会甘心偏居一隅，其“反攻大陆”时还要靠他统兵打仗，同时，他还是蒋介石用来牵制李宗仁的一颗棋子，对于蒋介石来说，他还有利用价值。因此，他觉得至少不会在近期有身家性命之虞。
1950年3月1日，蒋介石以“国民之公意”为辞“复正大位”。此前，白崇禧特致电李宗仁：“望公不持反对态度，以期留有余地。”但李宗仁在蒋介石宣布复职的当天下午，即在纽约举行记者招待会，抨击蒋介石的“复职”为“违宪”。为向蒋介石表忠心，白崇禧随即又写了一封信给李宗仁，指责其不应与蒋对着干。
蒋介石复职后，开始清算大陆失败的责任人，其有的被枪毙（如陈仪），有的被判刑（如李玉堂），有的被“驱逐”（陈立夫），有的被挂起（陈果夫等）。至于桂系的李、白二人，毫无疑问是导致大陆江山易主的“罪人”。蒋介石曾想“引渡”李宗仁回台湾治罪，但考虑到美国不会答应，反而会弄巧成拙造成负面影响，只好作罢。而李宗仁在美国，白崇禧就成为了美国人以及舆论关注的对象。握在手里却不能动他，这让蒋介石恨得咬牙切齿。他给白起了个“老妹子”的代号，将其列为头号政治敏感人物，派特工24小时严密监视，并为此在白家对面设了个派出所。
白崇禧立刻“心领神会”，主动配合，一方面减少外出活动，一方面在外出中为对方监视提供方便。有一次乘车外出，跟踪的吉普车半路抛锚，白崇禧即命司机停车，并派随从去告诉跟踪的特工，让他们不要着急，慢慢修车。特工人员为此非常尴尬。
还有一次，白崇禧和几个朋友到咖啡店喝咖啡，临走时却结了三桌客人的账。朋友很不明白。白笑说：“你没看出有两桌是我的‘保镖’么？他们那么辛苦，我应该给他们买单。”后来这件事传开，那些特工承认，在所有客人中，确实只有他们两桌人是有任务的。
随着时间的推延，蒋介石对白崇禧的限制也越来越多，并于1952年对白崇禧的住所进行了大搜查，除搜查所有家具外，还将地板全部挖开，令白崇禧忍不住打电话责问蒋经国。蒋经国说：“健公，这不是我的意思，你打电话问总统好了。”白又打电话给蒋介石，蒋介石回答说：“我知道这件事，我们对所有人都应该来一次这样的大搜查。”但事实上，这次只搜查了白崇禧和薛岳，以后也没有对其他人进行过此类搜查。
在1952年10月召开的国民党第七次“全代会”上，国民党改造宣布结束，作为对“党国元老”的安置，所有未在新组建的“中央委员会”任职的“党国元老”，均在“中央评议委员会”里提名任职，只有一个人除外，这个人就是白崇禧。而白崇禧原来的“中央执行委员”、“中常委员”也在此次会议中被拿掉，只留下“总统府战略顾问委员会副主任委员”、“中国回教协会理事长”和“国大代表”这些空衔。
“总统府战略顾问委员会”主任委员是何应钦，在大陆时，何、白两人曾经拍档亲密无间，如今处境却天壤之别。虽然何应钦同样被夺了权，但起码还居高位可以出席“道德重整会”去美国转转，白崇禧则被禁止踏出台湾一步。
很多人为白崇禧抱不平，白崇禧似乎很“坦然”，他对朋友说：“经过这一次大失败，总要找个人来顶罪，任何时候都一样，没有什么好奇怪的。”
蒋介石不想公开处罚白崇禧，但湖北人却不想放过他。桂系军队长期盘踞湖北，横征暴敛，令湖北人十分痛恨。在以“湖北人家长”自居的何成浚策动下，湖北“国大代表”弹劾白崇禧，吞没军费7万多两黄金；吞没汉口中央银行库存370多万两白银；不服从统帅指挥，拥兵自重，要求“追究责任，以明是非，振纪纲而知复兴”。
面对此弹劾，白崇禧十分惶恐，幸好蒋介石此时没有借此清算白氏的意图。身为会议主持的陈诚起身为白氏辩护：“华中的事，各委员所提的不是事实，你们要想知道真相来问我。”此事便被压下了。
1954年“国民大会”一届二次会议上，湖北“国大代表”40多人联名，旧案重提。白崇禧再次以书面作答。最后“国大”会议决定将此案保留，一场弹劾案才不了了之。
不久，曾任国民党“中央宣传部副部长”的潘公展，在香港《新闻天地》发表文章，提及当年华中“剿总”抗旨不尊，“视徐淮之告急若秦越之不相关”，令白崇禧万分紧张。1959年蒋经国出版的《危急存亡之秋》一书中，披露了桂系逼宫全过程，令白崇禧百口莫辩。逼宫案成了白崇禧晚年的最大心病，担心蒋介石随时会与他清算旧账，置他于死地。
在这种惴惴不安中，“副总统”陈诚对白崇禧表现出的宽容与示好，令白崇禧深感安慰。1954年的“国大”一届二次会议还有一项议程，就是选举正副“总统”。“副总统”一职由蒋介石提名陈诚。虽然在大陆时陈诚与白崇禧明争暗斗，互不相容，但如今陈诚成为炙手可热的二号人物后，对白崇禧非但没有落井下石，反而礼遇有加，十分尊重。并于此前专程拜访白崇禧，希望白能帮忙拉选票。陈当选“副总统”后，蒋仍要其兼任“行政院长”，陈为此征求白崇禧意见，白送他四个字：“养体养望”，建议不要兼。以后陈诚有什么事总是征求白崇禧意见，白亦知无不言，陈亦从善如流。1961年白崇禧70大寿之日，陈诚夫妇亲自到白府祝寿，并与白崇禧合影留念。
白崇禧还有一项职务是“中国回教协会理事长”。抗战时期，白崇禧担任此职，对增强西北回族与马家军的内向力，制止日本人分化中华民族，发挥了重要作用。1955年约旦国王侯赛因访问台北，邀请白崇禧访问中东。蒋介石担心白崇禧一去不归，在不予批准的同时，要求“回教协会”改选理事长。白崇禧只好黯然辞职。
白崇禧去台之后的生活，主要靠读书写字，打猎、下棋消磨时光。晚年的一项工作就是口述回忆录，并于1984年以《白崇禧先生访问记录》为书名，分上下两册公开出版。